Primer Taller de MODELADO MOLECULAR Y SOFTWARE LIBRE

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Primer Taller de MODELADO MOLECULAR Y
SOFTWARE LIBRE

• 3-12-2008
• Gabinete Informático Edificio Damianovich
• FIQ UNL
• Textura del fondo Papel reciclado.

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A cargo de Dr. Sergio GARAY (FBCB UNL)

• Coordinador
• Ing. Victorio Marzocchi
• Especialistas, Asesores y Colaboradores
• Ing. Pedro Mancini (Director PACT)
• Ing. Horacio Beldoménico (Director LCSA)
• Dr. Silvano Sferco (Modelado Molecular)
• Ing. Guillermo Courault (Software Libre)
• Ing. José Caropresi (Visualización Científica)
• Mgs. Alicia Vilchez (Visualización 3D)
• Dr. Eduardo Adam (Software Libre)
• Dr. Pablo Bolcatto (Modelado Molecular)
• Lic. Romina Brasca (Modelado Molecular)
• Ing. Miguel DAmato (Modelado Molecular)
• Mgs. Ma. del Carmen Castells (Pedagoga)
• Tco. Guillermo Hang (Soporte Informático)
• Nicolás Vanzetti (Modelado Molecular)
• Rodolfo Leonarduzzi (Modelado Molecular)
• Agradecimientos a
• Fernando Chekirdimian (Live CD)

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• Breve reseña histórica, objetivos y
• estado de avance del PI
• VISUALIZACIÓN Y MODELADO MOLECULAR DE
  MACROPOLÍMEROS ORGANICOS DE INTERÉS INDUSTRIAL

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Breve reseña histórica... (1)

• BLOG VISUALIZACIÓN Y MODELADO MOLECULAR
• Repositorio de informes y documentos del Grupo
  de Trabajo "Escrudiñando el Espacio".
• ENTORNO VIRTUAL UNL VISUALIZACIÓN Y MODELADO
  MOLECULAR
• Repositorio del PI
• SOFTWARE NÉMESIS Celulosa curva y hemicelulosa
  acetilada.
• VISUALIZACIÓN Y ESCALA El Universo en 40 saltos.
  Kees Boeke.
• LÓGICA DE LA NATURALEZA La dimensión fractal.
• PASANTÍAS
• Relevamiento de Software para Visualización y
  Modelado Molecular.
• Pasante Rodolfo Leonarduzzi. Directores Ing.
  Victorio Marzocchi y Mgs. Alicia Vilchez.
• Relevamiento de Bases de Datos de Imágenes de
  Moléculas
• Pasante Nicolás Vanzetti. Directores Ing.
  Victorio Marzocchi y Dr. Ignacio Rintoul.

http//modeladomolecular.blogspot.com
http//entornovirtual.unl.edu.ar/
http//www.vendian.org/mncharity/cosmicview/
http//www.cienciahoy.org.ar/hoy40/sistv2.htm
http//www.springerlink.com/content/v793552024j247
05/
http//cmm.cit.nih.gov/modeling/software.html
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Breve reseña histórica... (2)

• PACT
• Química Orgánica Reactividad, Modelado
  Molecular, Cinética y Mecanismos
• Director Ing. Pedro Mancini.
• PI
• Visualización y Modelado Molecular de
  Macropolímeros Orgánicos de Interés Industrial
• Director Ing. Victorio Marzocchi
• Docencia TP Química Orgánica
• Servicios Base datos PCBs, PCDDs PCDFs (LCSA)
• Investigación Modelado de la pared fibrosa
  (celulosa, hemicelulosas y lignina).
• Criterio No hay nada de mayor interés práctico
  que un buen modelo (A.L)

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Breve reseña histórica... (3)

• CURSO DE GRADO OPTATIVO-ELECTIVO MODELADO
  MOLECULAR.
• Dr. Silvano Sferco y Dr. Sergio Garay.
  Departamento de Física, FBCB, UNL.
• Se dicta hace 5 años. Live CD Molecular Live
• CICLO DE CHARLAS MODELADO MOLECULAR Y SOFTWARE
  LIBRE
• PRIMER TALLER DE MODELADO MOLECULAR Y SOFTWARE
  LIBRE
• 3-12-2008 Gabinete Informático Edificio
  Damianovich FIQ - UNL

http//www.fiq.unl.edu.ar/descargas/modelado_molec
ular.htm
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VISUALIZACIÓN DE MOLÉCULAS

• MODELO MECÁNICO (1953, Watson y Kirk)

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VISUALIZACIÓN DE MOLÉCULAS

• MODELO GRÁFICO EN 3D
• Átomos Esferas (diámetro y color)
• Coordenadas de centros
• EJEMPLO Benceno
• Visualización 2D (Excel - Marzocchi)
• Visualización 3D (CAD - Caropresi)
• Visualización 3D (Matlab Vilchez)
• Visualización 3D (Scilab - Vilchez)
• Visualización 3D (Ubuntu, Octave Adam)

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CONCLUSIONES

• Las nTICs ofrecen múltiples posibilidades de
  visualización de modelos de moléculas.
• Existe gran cantidad de software libre para
  Visualización y Modelado Molecular aplicable en
  docencia, gratis y sin limitaciones de uso.