Diapositive 1 - PowerPoint PPT Presentation

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Diapositive 1

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Laboratoire d'Optique P.M. Duffieux Universit de Franche-Comt , 25000 Besan on ... Ce projet s'est inscrit dans le cadre des techniques d' AMP (Assistance M dicale ... – PowerPoint PPT presentation

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Title: Diapositive 1


1
Qualification biologique des ovocytes et des
zygotes en AMP par analyse et traitement
dimages Khemmou J.1, Vuillemenot J.1, Pieralli
C.2, Roux C.3 1. I.S.I.F.C. Ingénierie
biomédicale, 16 Route de Gray 25000 Besançon 2.
Laboratoire d'Optique P.M. Duffieux Université de
Franche-Comté, 25000 Besançon 3. Centre
Hospitalier Universitaire, 2 place St Jacques
25000 Besançon
Introduction
(A)
(B)
Ce projet sest inscrit dans le cadre des
techniques d AMP (Assistance Médicale à la
Procréation) que sont la FIV (Fécondation In
Vitro conventionnelle) et lICSI (Intra
Cytoplasmic Sperm Injection). Lobjectif était de
participer au développement dun outil
informatique, qui permettrait daider à la
décision quant au choix des ovocytes à féconder
(A) et des zygotes à transférer (B) dans le but
daboutir à une implantation.
Implantation
Fécondation
Pas dimplantation
Pas de fécondation
Cet outil, développé dans l'environnement du
logiciel Matlab devait se basé sur lanalyse de
la texture du cytoplasme et de la morphologie de
la cellule (A, B) afin de déterminer si un ou
plusieurs paramètres objectifs pouvaient être
utilisés comme critères de sélection. Ces
analyses ont porté sur une base de données
dimages 512x512 pixels au format bitmap
constituée au CHU depuis 4 ans.
Traitement dimage
Lobjectif du traitement dimage est de
sectoriser la cellule en 3 parties le
cytoplasme, la zone pellucide et le fond de
limage (C) la zone pellucide pouvant faire
lobjet dune étude morphométrique ultérieure.
Pour ce faire, après avoir été filtrée par
Kirsch, limage a été binarisée puis ternarisée
par application de seuils pour obtenir 3 zones
distinctes (D).
Les seuils devant être adaptés à chaque image, un
programme de seuillage automatique a été
développé. Les histogrammes (E) des images ont
été classés en 3 groupes, et les seuils à
appliquer ont été recherchés pour chacun deux.
Pour optimiser lanalyse morphologique, il était
nécessaire de saffranchir des variabilités liées
à la position des cellules. Pour cela, un
recadrage des images (F) était nécessaire.
Il consiste à effectuer une rotation de limage
de sorte à ce que le plus grand axe du cytoplasme
soit horizontal (G).
Analyse dimage
  • La seconde étude consiste à voir sil y a des
    différences significatives de texture entre les
    ovocytes fécondés / non fécondés et les zygotes
    implantés / non implantés.
  • Les résultats statistiques ont montré quaucun
    des paramètres de texture nétait discriminant.
    Une étude tenant compte déchantillons plus
    importants devra être menée pour vérifier ces
    résultats.
  • Lanalyse de la morphologie a été mise en attente
    afin dapprofondir lanalyse de texture du
    cytoplasme. Celle-ci porte sur 7 paramètres qui
    sont la moyenne, la variance et le skewness, le
    contraste, la corrélation, lentropie et
    lhomogénéité. Deux études ont été menées.
  • La première étude consiste à comparer les
    cellules contenant des perturbations (H) avec
    celles nen contenant plus (éléments gommés) afin
    de déterminer une éventuelle influence sur la
    texture.

(I)
Une régression linéaire (I) a permis de montrer
que les perturbations peuvent être négligées pour
lanalyse de la texture.
(J)
Conclusion
Pour conclure, par rapport aux outils existants,
celui qui a été mis au point présente plusieurs
avantages  il est ergonomique et simple
dutilisation grâce à son interface graphique (J)
qui facilite le lancement des calculs et la
lecture des résultats. Lautomatisation des
tâches, notamment le tracé des contours, et
lutilisation du logiciel Matlab permettent de
réduire respectivement les temps de manipulation
et de calcul. Au final, loutil devrait pouvoir
sintégrer dans les activités quotidiennes du
laboratoire de F.I.V. et faciliter ainsi ses
étapes de validation.
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