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Edición de textos en Unix (Linux) con el editor
vi . Comandos importantes i
Modo de edición ltescgt
Cambiar modo x Borrar
carácter Modo de comando
w Salvar
q Salir wq Salvar
y Salir Ejercicio Generar un archivo
que tenga !/usr/bin/perl w my argumento
ARGV0 print Hola argumento \n

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Comandos básicos de linux ls l Listar
archivos en el directorio actual rm ltarchivogt
remover ltarchivogt vi ltarchivogt editar un
nuevo archivo mkdir ltdirgt crear nuevo
directorio ltdirgt cd ltdirgt cambiar al
directorio ltdirgt chmod 755 ltarchivogt hacer
ejecutable un archivo Para recordar .
directorio actual .. directorio
padre Ejercicio Ejecutar el archivo que
generaron ./archivo poner lo que quieran
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• Actividad
• Ir al directorio NCBI
• a) ejecutar NCBISearch.pl parámetros de
  búsqueda inteligentes
• b) esperar respuesta e ir a alguna línea que
  diga homologene
• i) Abrir Browser
• ii) copy y paste de la dirección web
  homologene en el browser
• iii) seguir la primera liga
• iv) tomar nota de 2 identificadores
  de genes homólogos.
• 2) Ir al directorio EBI
• a) ejecutar EBIFetch.pl ltdatabasegt
  ltidentificador1gt fasta
• b) ejecutar EBIFetch.pl ltdatabasegt
  ltidentificador2gt fasta
• 3) Abrir el browser a la dirección
  http//oz.ifc.unam.mx/EMBOSS
• a) Ir a Alignment global / needle
• b) copy y paste de las dos secuencias
  obtenidas en el paso 2
• c) ejecutar sin modificar ningún parámetro
• d) poner un valor de 100 en Gap opening
  penalty