Ma

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Maîtrise de linformation (Information literacy)
dans la recherche en biologie
Par internet, toute information est disponible,
facilement accessible, intéressante et utilisable
à volonté La recherche en biologie ou le défi
de laccès à linformation (!), de la sélection,
et de lutilisation des sources dinformation!
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Maîtrise de linformation dans la recherche en
biologie

• 1. Mes activités et BIST pratiqués dans une
  activité de biologiste
• Activités passées de biologiste
• Activité actuelle recherchiste/formatrice
• 2. Ce qui est important quon enseigne aux
  élèves?
• 3. Opportunités pour enrichir et actualiser les
  enseignements?
• 4. Discussion avec les participants
• Confrontations des propositions à la réalité des
  classes.

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1. 1 Activités (passées) de biologiste
Utilisation de linformation pour mes recherches
A phytoremediation approach to remove pesticides
(atrazine and lindane) from contaminated
environment (thèse - académique) Evaluation
dextraction dADN facilitée pour grand public
(animation Eprouvette - vulgarisation) Choix
dun support à cellules CHO pour laugmentation
de la production de Rebiff (RD Serono -
industrie)
i
Préparation de projet (état de lart,
originalité, compétitivité dun système par
rapport à un autre)
i
Recherche de protocoles (en fonction du budget et
équipements de laboratoire)
Comparaison des résultats obtenus, critiques
i
Rédaction (rapport ou publication)
i
4
1.2 Activité (actuelle) de recherchiste/formatrice
Utilisation de linformation pour la recherche
en Science de la Vie à lEPFL
Séminaire dexpérimentation animale Recherche de
sources pour lexpérimentation animale pour le
respect des 3R Prof. Marcel Gyger étudiants
master en sciences de la vie Sylvie
Vullioud-Marcacci, pour info.bc, le 13 décembre
2007

• Recherches documentaires avec et pour les
  étudiants et chercheurs
• Formations Ba, Ma, (Dr) à la recherche
  documentaire
• Accueil info à la bibliothèque
• - Accueil aux nouveaux étudiants internationaux

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2. Ce quil me paraît important quon enseigne
aux élèvesA. La maîtrise de linformation? Le
collège vous y prépare?
Scholar university
Industry

• Use of library catalog
• How to cite
• Writing a reference

Bachelors
1. Engineer applies for a job 2. Engineer
develops an innovative project
1. Student applies for master project 2. Student
develops a master project

• Use of specialized databases
• Reference management

Masters
3. Technology watch and project design choice and
viability

• Use of alerts
• Citation and impact factors
• Publication modalities

PHD
Information literacy
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2. Ce quil me paraît important quon enseigne
aux élèves actuelsB. Notion de Web caché

• Invisible Web
• Sometimes 80 of information is invisible in
  science and technology
• No indexation of deep pages
• Access to pages only with subscription
• No access to some databases with objects
  without URL

Rechercher dabord des BDB avec Google!

• Google
• Poor search grammar
• Best results listed according score or page
  rank? short-lived list of results
• - Popularity based on number of links pointing
  on 1 page
• - Importance traffic, and quality of links
• - Distance between words and frequency of results
• Mixed information (personal, commercial,
  institutional, commercial, political Web sites)

• Bibliographic databases
• Rich grammar search options (documentary
  equation)
• Results based on answers from a request of a
  form ? reproducibility
• Mostly based on peer-reviewed articles ?
  trustful sources

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2. Ce qui me paraît important quon enseigne aux
élèvesC. Utiliser des ressources (outils)
scientifiques sur internet!
Task Scientific documentary tools in general Open-Access scientific documentary tool Documentary tools at EPFL
Scientific Subject search Book catalog Bibliographic database catalog Scientific institutional BDB OA Book catalog Booshelf in Pubmed? OA BDB Pubmed, DOAJ, Free medical journal? Search engine Scirus, Google scholar? OA institutional BDB Infoscience, IRD? Library book catalog NEBIS http//www.nebis.ch Library BDB links http//library.epfl.ch/db/ Institutional BDB Infoscience
Scientific Subject search Littérature vulgarisée payante American scientific, Pour la Science etc. Littérature vulgarisée OA - BDB Université de Pau? - news de nature par RSS? - news de newscientist par RSS?
http//library.epfl.ch
Stratégie explorez les sélections de liens de
BDB et journaux par les bibliothèques
universitaires pour en trouver en OA?
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Ex. What are professional information resources
for animal experimentation and 3R at EPFL?
1. Encyclopedias of life sciences
Encyclopedias of life sciences 2. Open-access
monograph catalog NEBIS (3. E-Books access
restricted to EPFL users) E-books link 4.
Commercial BDB (access restricted to EPFL
users) Medline BIOSIS WOS Scopus 5.
Publisher sites (access restricted to EPFL
users) Science direct

• Domaines dapplication des 3R
• Replace , Reduce, Refine
• Animal testing, animal experimentation
• Laboratory animals, animal protection
• Domains
• 1. Fondamental basic research
• Ex  gene fonctions
• 2. Medical search
• Ex. Serums, vaccines, diagnosis reactiv, drugs,
  secondary effects
• 3. Non medical search
• Ex biosafety assessment of chemicals, cosmetics,
  quality assessment of drugs

DOMAINS 1. Ethics, bioethics, philosophy see
UNIL resources! 2. Swiss, European and
International rights see institutional websites
and UNIL resources! 3. Alternatives technics to
animal experimentation see also CHUV
resources! 4. Animal genetics and transgenic
mice see alsor CHUV and UNIL resources!
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2. Ce qui me paraît important quon enseigne aux
élèvesD. Recherche de synonymes pour utiliser
les moteurs et BDB!
My question Jaimerais avoir une vue densemble
et de ce qui se fait actuellement dans le domaine
de recherche des méthodes alternatives à
lexpérimentation animale
DOMAINES 1. Ethique, bioéthique, philosophie 2.
Législatif, Droit suisse, européen, et
international, 3R, protection des animaux 3.
Expérimentation animale et techniques
alternatives 4. Génétique animale, souris
transgénique, modèle animal

• Related words translation, plural, synonyms,
  abbreviations
• animal protection, animal testing, animal
  experimentation, animal models, laboratory
  animal?
• 3R, three R, three R principles, Reduce, replace,
  refine / refinement, replacement, reduction
• alternative to animal testing, alternative
  testing methodologies, alternatives to animal
  experiments, alternative methods, experimental
  models, non-models animals, animal use in life
  sciences
• animal genetics, transgenic mouse, transgenic
  mice

Grammar Boolean operators AND OR NOT Quotation
marks Bracket () Truncations ?
An example of documentary equation for NEBIS and
BDB use "three R principles" or "reduce replace
refine" or "animal alternative testing
methodologies" or "alternatives to animal
experiments" or "in vitro alternative methods" or
"non-model animals"
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3. Opportunités pour enrichir et actualiser les
enseignements en biologie?

• Critique de linformation par les élèves
  remonter linformation- de la presse à la
  science
• Des cours à jour par les profs se mettre au
  courant des nouvelles techniques et découvertes
  en biologie
• Découverte du réel processus de recherche par
  les élèves controverses scientifiques
• Méthodologie documentaire par les élèves et
  profs acquisition de la notion de couverture de
  recherche et de sélection de linformation
• Ethique de linformation par les élèveset les
  profs respect des sources et de leur sens!
• Toute la synthèse dans le travail de matu?

Ex Code dhonneur, guide des références et
citations
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3. Articulation de la construction dun travail
de matu?

1. Introduction à la maîtrise dinformation
   (frontal) recherche, critique, utilisation de
   linfo
2. Formuler une question pour démarrer une recherche
   documentaire, exploration des mots-clés (par les
   élèves, avec aide)
3. Exploration de la recherche de sources
   dinformation scientifiques (par les élèves, avec
   aide)
4. Mise en commun des mots, outils et références sur
   un wiki (par les élèves, en commun, avec aide)
5. Synthèse et compréhension des documents (travail
   personnel)
6. Rédaction, avec un chapitre de méthodologie
   documentaire (mots-clés et ressources
   utilisées!), des citations et références (par les
   élèves, avec aide)

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Maîtrise de linformation (Information literacy)
dans la recherche en biologie
Par internet, toute information est disponible,
intéressante et utilisable à volonté La
recherche en biologie ou le défi de laccès à
linformation (Web caché), de la sélection
(fiabilité des infos), et de lutilisation (droit
dauteur) des sources dinformation!