L

1
Lamélioration génétique dans lélevage laitier
2
Méthodes dindexation les principes

• Indexer estimer la valeur génétique des animaux
  à partir de deux types dinformation, les
  performances mesurées et les généalogies.
• la base de tout protocole dévaluation génétique
  identification des animaux, leur filiation et
  le contrôle de leurs performances
• Lindex meilleure estimation de la valeur
  génétique dun reproducteur ( valeur génétique la
  plus probable)

3
LINEL en France

• Une méthode internationalement reconnue pour des
  index fiables (depuis mars 1990)
• 5 index élémentaires
• Quantité de lait (QL) en kg
• Quantité de matière grasse (MG) en kg
• Quantité de matière protéique (MP) en kg
• Taux butyreux (TB) en , ou en g/kg
• Taux protéique (TP) en , ou en g/kg
• 1 index synthétique combinaison des 5 index
• INEL INdex Economique Laitier
• INEL 1,15 (MP 3TP)

4
LINEL en France

• fondée sur une méthode  BLUP appliquée au modèle
  animal 
• BLUP Best Linear Unbiased Predictor (meilleur
  prédicteur linéaire non biaisé)
• Méthode statistique complexe permet lanalyse
  simultanée des effets de milieu identifiées et
  des effets génétiques
• modèle animal considération de lindividu
  qui réalise la performance (et non son père ou
  son grand-père maternel)

5
LINEL en France

• Avantage du  modèle animal 
• considération de toutes les relations de parenté
• tous les individus pris en compte et formules de
  calcul identiques pour tous les animaux ?
  comparaison directe
• prise en compte des effets de la sélection passée
• tient compte des accouplements raisonnés
• autres sources de biais également prises en
  compte

6
LINEL en France

• Lindex de valeur génétique dun animal exprime
  sa valeur en tant que reproducteur.
• La somme de lindex de valeur génétique et de la
  valeur individuelle non transmissible (A V)
  exprimerait quant à elle la valeur de lanimal en
  tant que producteur.

7
LISU

• Intégration des caractères fonctionnels et
  morphologiques dans lINEL 04/02
• ISU (Index de Synthèse Upra) il traduit
  lobjectif de sélection dune race et est défini
  au sein de lUPRA (unité nationale de Promotion
  de la Race)
• Les caractères dintérêt économique ajoutés
• Fertilité femelle
• Comptage cellulaire
• Longévité fonctionnelle résiduelle
• Format ou développement

8
LISU

• Fertilité femelle
• action sur les réformes pour infertilité, sur
  lintervalle vêlage-vêlage, et donc sur la
  production par lactation et le nombre de veaux
  par an, et sur les frais dinsémination
• sa corrélation génétique avec la production
  laitière est négative(rg -0.37).

9
LISU

• Les comptages cellulaires (CEL)
• mesure indirecte de la résistance aux mammites
  (corrélation génétique entre fréquences de
  mammites cliniques et comptages cellulaires est
  0.70)
• liaison génétique entre comptages cellulaires et
  quantité de lait défavorable (rg 0.20)

10
LISU

• La longévité fonctionnelle résiduelle
• correspond aux réformes dues aux causes autres
• liaison génétique entre longévité fonctionnelle
  (LGF) (normalement insensible aux réformes dues à
  linsuffisance de production) et la production au
  travers de lINEL pratiquement neutre

11
LISU

• Le format ou développement
• avec sa conséquence sur le poids de lanimal, il
  est lié directement au produit viande et aux
  besoins dentretien
• la taille des animaux et leur capacité corporelle
  semblent quasi indépendantes de la production
  laitière (rg 0.10)

12
LISU

• Estimation de leur valeur économique marginale
  somme des conséquences dune élévation du niveau
  génétique dune unité du caractère considéré pris
  isolément pour une femelle du troupeau
• Cette somme de conséquences est mesurée sur la
  carrière de cette femelle et ramenée ensuite à la
  marge nette de lexploitation.
• Le gain génétique en production participe pour
  environ 50 à lamélioration de la marge nette
  de lexploitation

13
Indexation Scandinave inclusion des caractères
de reproduction et de santé

• Problèmes concernés taux cellulaires, taux de
  mammites, pathologies de lappareil locomoteur,
  fertilité, vêlage dystocique et mortalité
  périnatale
• Sources dinformation pour leur intégration
  bases de données existantes depuis les années 60
• Etude sur une population de vaches rouges
  (Suédoise rouge et blanche SRB) et de vaches
  pie-noires holsteinisées (SLB) 2 x 700 000
  vaches et 2 x 450 taureaux dIA

14
Indexation Scandinave inclusion des caractères
de reproduction et de santé

• durant les 3 dernières décennies
• SRB échange uniquement entre populations
  scandinaves (2700 kg de lait)
• SLB holstéinisation internationale (3000 kg)
• gain de production supérieur des SLB
• Une observation faible héritabilité des
  caractères de fertilité et de pathologies (lt5)

15
Indexation Scandinave inclusion des caractères
de reproduction et de santé

• But de cette étude mettre en relation
  productivité, méthodes dévaluations génétiques,
  sélections pratiquées et réponses observées (en
  considérant les caractères de fertilité, de
  vêlage et de mammites)

16
Indexation scandinave 1. la fertilité femelle

• Mesures pour deux caractéristiques différentes 
• intervalles vêlage-1ere ou dernière insémination
• taux de gestation par rapport au nombre
  dinséminations
• Variation génétique
• Faible héritabilité (2-3 )
• Grande variation génétique additive (6-9 )
• Corrélation génétique de fertilité entre les
  catégories dâge
• Très haute chez les vaches
• Régie différemment chez les génisses (gènes
  partiellement différents)

17
Indexation scandinave 1. la fertilité femelle

• Evaluation génétique
• Conséquence de la faible héritabilité ? sélection
  des taureaux sur base de progeny test (grand nb
  de filles)
• Sélection et réponse
• TMI Total Merit Index (tous les pays nordiques)
  incluant la fertilité femelle

18
Indexation scandinave 1. la fertilité femelle
19
Indexation scandinave 2. Caractères de Vêlage

• Collecte des dates de vêlages, du taureau
  utilisé, de létat du veau à la naissance, dun
  score de performance au vêlage et des pedigree
  des parents
• Variation génétique
• Héritabilité faible des caractères de vêlage
• Variation génétique additive plus importante
• Taux de mortalité périnatale
• au 1er vêlage grande disparité entre les races
• chez les vaches différences minimes
• Variation génétique indépendante du type de
  vêlage

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Indexation scandinave 2. Caractères de Vêlage

• Evaluation génétique
• Compliqués à définir malgré une apparente
  facilité dobservation (intéraction de 2
  générations)
• Variation considérable entre les génisses et les
  vaches
• Nombreuses études biaisées par une population
  unique de primipares (différence flagrande avec
  les pluripares)

21
Indexation scandinave 2. Caractères de Vêlage

• Sélection et réponse
• Dystocie et mortalité périnatale incluses dans le
  TMI
• Une hypothèse propagation dun gène récessif
  provoquant une malformation vertébrale chez les
  Holstein (graphe)

22
Indexation scandinave 2. Caractères de Vêlage
23
Indexation scandinave 3. Résistance aux
mammites

• Problème le plus coûteux dans la production
  laitière
• Mêmes bases de données que les précédentes pour
  les cas cliniques de mammites
• Utilisation du compte de cellules somatiques
  comme outil de gestion

24
Indexation scandinave 3. Résistance aux
mammites

• Variation génétique
• Héritabilité basse pour les cas cliniques (CM)
  2-5
• Héritabilité variable entre 8 et 15 pour le SCC
• Correlation génétique entre CM et SCC 50 - 80
• Rapport défavorable entre la production et la
  sensibilité à la mammite

25
Indexation scandinave 3. Résistance aux
mammites

• Variation génétique
• Absence de sélection des taureaux sur le critère
  SCC
• Progrès réalisé sur lesvaches en première
  lactation (graphe)

• Sélection et réponse
• Grande importance des caractéristiques des
  mammites dans lélaboration du TMI

26
Indexation scandinave 3. Résistance aux
mammites
27
Indexation scandinave 4. Total Merit Index

• Début dapplication en Norvège et en Suède
• Inclus tous les paramètres vus jusquà présent
• Contribue à un gain économique de 10 à 25 par
  rapport au simple caractère de production

28
Indexation scandinave Conclusion

• Adoption unanime des autres pays de lattitude
  scandinave car
• Développement de bases de données similaires
• Intérêt croissant du public pour le bien-être
  animal
• Nécessité dune harmonisation sur la définition
  et les modèles dévaluation génétique des
  caractères

29
Bibliographie

• Philipsson J., Lindhé B. Experiences of including
  reproduction and health traits in Scandinavian
  dairy cattle breeding programmes, Livestock
  production science 83 (2003) 99-112
• http//www.inst-elevage.asso.fr/html1/rubrique.php
  3?id_rubrique507
• http//res2.agr.gc.ca/lennoxville/activ/informatis
  e-computerized_f.htm
• http//dga.jouy.inra.fr/sgqa/equipes/bl.htm
• http//www.agrireseau.qc.ca/bovinslaitiers/
• http//www.web-agri.fr/infos/dossiers/31_01_02_tau
  reaux

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MERCI DE VOTRE ATTENTION

• Travail réalisé par
• Camus Stéphan
• Ceysens Nicolas
• Charbonneau Alexandre