La diversit

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La diversité génétique et les tests dassignation
sur 7 races bovines françaises basés sur
lanalyse dADN microsatellite
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INTRODUCTION

• Sélection perte de diversité génétique
• Diversité génétique adaptation aux changements
  de lenvironnement, maladies, conditions de
  marché
• But déterminer le degré de parenté entre les
  différentes races bovines

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MATERIEL ET METHODE

• 1) Echantillon

Abondance Limousin
Tarentaise Charolais
Villard de Lans Holstein Française
Montbéliarde
Total 317 Bovins testés
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• 2) Amplification microsatellite et analyse
• a)prélèvement sangsperme extraction ADN
  génomique.
• b)analyse de 23 marqueurs microsatellites
• c)amplification par 12 PCR
• d)Séparation sur gel

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• 3)Analyse de la diversité génétique
• a) utilisation de divers logiciels (ex
  GENEPOP)
• b) analyse en composantes principales (PCA)

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LES REGROUPEMENTS DE POPULATION

• Nombreuses études identification de la pop
  dorigine de lindividu par les microsatellites
• Nombreuses approches utilisation de marqueurs
  moléculaires
• Comparaison de 2 approches en utilisant les
  fréquences alleliques des pop observées pour
  assigner un individu à une race
• 1)Méthode  directe (Buchanan et al.)
• 2)Méthode basée sur simulation et coeff. De
  certitude

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PROBLEMATIQUE

• 2 restrictions à la 1ère méthode
• 1)pas de valeur P
• 2)une seule pop. comme source probable dun
  individu.

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• Suggestion approche de simulation-exclusion
  exclusion des pop comme origine des
  individus et valeur P

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• Résultats
• 1)Les marqueurs de microsatellites au total 215
  allèles ont été observés à partir de 23 loci
  étudiés
• 2)Variabilité génétique plus élevée dans les
  races locales que chez la Holstein
• cas de la Holstein 2 origines différentes
• a)50 de fermes locales
• b)50 de bv frçais provenant de
  linsémination déficit hétérozygote marqué

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• 3) Relations entre races 3 groupements
• a)4 races alpines
• b)Charolais et Limousine
• c)Holstein française
• 4) Assignation de race
• cf tableau

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(No Transcript)
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(No Transcript)
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DISCUSSION

• Diversité génétique essentielle pr productivité
  de lagriculture or elle samoindrit 30 de
  races délevage menacées dextinction en Europe
• Pq?
• Isolement génétique
• Manipulation biologique (ex IA)

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• Loutil moléculaire les séq microsatellites
• But étudier lhistoire évolutive de chaque
  pop.et les relation phylogénétiques
• Létude a éstimé la diversité génétique de rs
  races bovines des races domestiques avec
  effectif réduit( ex Tarentaise de 15000 Anx)
  ont une variabilité génétique plus grande que des
  pop très largement répendues (Holstein 1 million
  dindividus)

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• Pq?
• Course à lamélioration dc petit nombre de
  reproducteurs
• Généralisation de lIA amplification de ce
  phénomène et accroissement de la consanguinité

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• CONLUSION
• Les races alpines(locales) présentent des
  variabilités génétiques supérieures aux races
  commerciales (Holstein, Charolais) ces races
  représentent donc un potentiel évolutif
  important, il est donc indispensable de conserver
  les races traditionnelles comme réservoir
  génétique