A1263200818TgirA

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Unveiling fungal zooflagellates as members
of freshwater picoeukaryotes evidence from a
molecular diversity study in a deep meromictic
lake
Lefèvre et al., 2007
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Etude de la biodiversité de picoeucaryotes basée
sur des méthodes moléculaires au Lac Pavin
U33 Diversité des Organismes Marins
Exposé présenté par
HAMOUDA Amine
Lojou Vincent
Etudiants en Master I COM
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Lac Pavin
Géographiquement
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(No Transcript)
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Lac Pavin

• Il est né d'une explosion volcanique qui creusa
  le flanc du puy de Montchal.

• De forme presque circulaire, surface de 44ha,
  profondeur max est de 92m, enchâssé dans une
  forêt, et influence anthropique relativement
  faible.

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Procédé expérimental

• Léchantillonnage à des profondeurs variables

• 5m (épilimnion)

• 9-10m (métalimnion)

• 30 m (hypolimnion)

• 56-59 m (oxycline)

• Filtration On na gardé que les organismes de
  taille lt5µm

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Procédé expérimental

• Extraction dADN Amplification par PCR

• Détection des ADNr 18S

• Détermination des affiliations phylogéniques,
  calcul des distances et alignement par des
  méthodes Bioinformatiques.

Construction de larbre phylogénique
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T(C), O2 (mg l1)
T(C), O2 (mg l1)
Chl a (µg l1)
Chl a (µg l1)
Profil vertical de température, d'oxygène et de
Chlorphylle a mesurés le 310804 au Lac Pavin
Profil vertical de température, d'oxygène et de
Chlorophylle a mesurés le 061004 au Lac Pavin
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Fungi
Rhizaria
Alvéolés
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Arbre Phylogénétique

• Nouveau clade 1 Asteronella formosa un Diatomée
  parasité par un Rhizophydium

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Fungi
Rhizaria
Alvéolés
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• Nouveau clade 4 est frère des Euglypha rotunda

Euglypha sp
Euglypha rotunda
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Fungi
Rhizaria
Alvéolés
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• Nouveau clade 5 fait parti des Perkinsea, ici
  une espèce qui parasite un bivalve philippinarum

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Courbes de raréfaction

• Sont obtenus par extrapolation des valeurs
  dOTU en fonction du nombre de clones, via des
  outils informatiques.

• Le palier est synonymes de biodiversité
  maximale atteinte.

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Courbes de raréfaction
Zone oxique du 310804
Zone oxique 061004
OTU
Zone oxycline 061004
Zone oxycline 310804
Nombre de clones
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Courbes de raréfaction

• Biodiversité maximale atteinte

• 310804 en oxycline (50-60 m)

• 061004 en zone oxique( 0-60 m)

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Abondance relative
310804
Zone oxique
Oxycline
Abondance en
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Abondance relative
061004
Zone oxique
Oxycline
Abondance en
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Conclusion

• La communauté du lac Pavin est unique

• Meromictie

• Biodiversité découverte avec 5 nouveaux clades

• Le parasitisme est important dans la communauté
  des picoeucaryotes, et influence sur les
  producteurs primaires.

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Conclusion

• Diversité très variable en fonction de la saison.

• 2 écosystèmes dans le lac Pavin

• Oxycline

• La zone oxique

• Les populations sont différentes en comparaison
  avec dautres études sur des lacs.

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Conclusion

• Une grande diversité des picoeucaryotes est à
  découvrir.

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Critiques

• Les valeurs de Bootstrap sont parfois
  illisibles, ceci ne nous permet pas de discuter
  la solidité de larbre.

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(No Transcript)
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(No Transcript)
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Critiques

• Certains graphiques sont difficilement lisibles.

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Critiques

• La méthode est basée uniquement sur les
  phylogénies moléculaires

• Utilisation dautres marqueurs moléculaires pour
  renforcer la phylogénie.

• Lécosystème des nouveaux clades découverts?

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FIN
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Bibliographie

• Olive P., BoulègueJ. étude biogéochimique d'un
  lac méromictique le lac Pavin,
  FranceGéomorphologie relief, processus,
  environnement, 2004, n 4, p. 305-316.

• http//commons.wikimedia.org/wiki/ImageEuglypha
  _sp.jpg

• http//protist.i.hosei.ac.jp/PDB6/PCD0222/htmls/
  35.html

• http//www.com.univ-mrs.fr/boudouresque

• http//www.env.sci.toho-u.ac.jp/topics/009204.ht
  ml

• http//www.pac.dfo-mpo.gc.ca/sci/shelldis/pages/
  perkincc_e.htm