Gntique Molculaire :

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• Génétique Moléculaire
• Quel intérêt en sélection porcine ?

Yuefu Liu CCAP
2
Génétique Moléculaire

• Avancées très rapides ces 15 dernières années.
• Un grand nombre de gènes et QTL ont été
  cartographiés.
• Certaines compagnies ont commencé à utiliser
  largement linformation moléculaire
• - Monsanto 78 gènes et 26 QTLs depuis 2002
• - Sygen 12 gènes et 40 QTLs
• Dans le PCAGP, il est important de suivre les
  progrès de la génétique moléculaire et de saisir
  les opportunités à temps.
• Cette presentation pourquoi la génétique
  moléculaire est importante en sélection porcine
  et quelles stratégies utiliser pour utiliser
  linformation moléculaire ?

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PerformanceGènes Environnement
Gènes
Lamélioration génétique consiste à sélectionner
les animaux ayant les meilleurs gènes
Alimentation Santé Régie
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Génétique Quantitative
Gènes
Précision
IPG

Alimentation Santé Régie
BLUP
Données
Contrôle des Performances
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Génétique Moleculaire
Gènes
Test ADN

• Sélection exacte
• Economise le coût du contrôle de performances
• Avantage confirmé dans de nombreuses études.

Alimentation Santé Régie
Prise déchantillon
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Alors pourquoi nest-ce pas encore largement
utilisé?

• Porc 2,700,000,000 paires de nucléotides.
• 95 de lADN nest pas constitué de gènes
• - localisation ?
• - fonction ?
• - importance des effets ?
• Lutilisation de linformation moléculaire
  dépend des progrès en génétique moléculaire

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Etudes de cartographie

• Jusquici, 3000 loci plus de 900 gènes 2000
  marqueurs.
• Certains gènes sont bien connus ex. Halothane,
  RN, IGF2, dautres nécessitent plus de
  recherche.
• Stratégie du CCAP Utilisation sélective, en
  commençant par ceux
• - qui sont bien connus
• - qui sont utiles directement pour lindustrie

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Exemple 1 gène IGF2 Insulin-like growth factor 2

• Référence des marchés (Porc Référence)
• 19 des carcasses ont moins de 13.6 mm de gras
  (limite inférieure).
• 20 des carcasses ont un rendement en maigre de
  plus de 62.9 (borne supérieure de la grille).
• Dans lOuest Canadien, certains porcs extrêmement
  maigres ont été déclassés.

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Exemple 1 gène IGF2

• Le porc canadien est-il vraiment trop maigre ?
• Moyenne 60
• Cible dans la plupart des grilles de paiement
  entre 61 et 63 avec une moyenne de 62 (ex
  nouveau contrat OlyWest).
• Augmenter le rendement en maigre de 60 à 62
  signifie 4.25 de revenu en plus par porc
  (Sullivan, 2004).
• Le problème est en fait
• - faible uniformité du rendement en maigre
• - pas le rendement moyen

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Exemple 1 gène IGF2

• Lindustrie porcine a besoin de carcasses plus
  uniformes pour être dans la grille, et en même
  temps plus maigres de 2.
• Une solution apportée par la génétique
  moléculaire le gène IGF2
• Augmente le rendement en maigre de 2 et
  luniformité de 25
• Peut être utilisé pour produire des porcs plus
  maigres avec des truies grasses
• Possibilité dajustement du rendment en maigre
  pour sadapter à différents marchés
  

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Exemple 2 gène HFABP Heart fatty acid binding
protein gene

• Certaines longes sont trop maigres, ce qui
  influence la qualité gustative.
• Les marchés asiatiques réclament encore plus de
  gras intramusculaire (GIM).
• Méthode de mesure du GIM en développement
• Solution apportée par la génétique moléculaire
  gène HFABP
• Augmente le GIM de 0.4
• Le GIM peut être amélioré, indépendamment du gras
  dorsal

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Utilité dans de nombreux domaines

• Amélioration Génétique
• Tests de pureté de race
• Tests de parenté
• Traçabilité biosécurité et contrôle des
  maladies
• Détection de composantes de source bovine dans
  lalimentation
• Diagnostic de maladies
• Contrôle de qualité de leau et de lalimentation
• Mise au point de médicaments
• Thérapie génique pour les anomalies génétiques
• ..
• La génétique moléculaire va devenir de plus en
  plus importante en génétique porcine

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• Merci de votre attention !

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En amélioration génétique, particulièrement utile
pour

• - Les caractères non mesurables sur
  lanimal vivant
• - Les caractères peu héritables
• - Les caractères mesurables chez un seul
  sexe
• - La résistance aux maladies
• - La sélection précoce

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IGF2 Used for leaner hogs from fat sows
?
?



grand-père maternel GG
Tous génotypes
G G
G G
AA
AG
GG
X


?
?
Uniformly fatter sows
X
G -
G -
A A
A A
Verrats AA
A -
A -
A -
A -
Porcs commerciaux maigres et uniformes
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IGF2 Ajustement du rendement en maigre en
fonction de différents marchés
?
?



?
?
G G
G G
AA
AG
GG
G G
G G
X
X
Moyenne 60
G -
G -
G -
G -
A -
A -
A -
A -
G -
G -
G -
G -
A -
A -
A -
A -
Uniformes et plus gras -2 58
Uniformes et plus maigres 2 62
Marché japonais
Marché domestique
Dépend de la fréquence
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Hypothèse concernant le déterminisme du GIM
Polygènes
HFABP
r 0.1
Gras dans les tissus adipeux
Gras dans les muscles
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HFABP Ajustement du GIM pour sadapter à
différents marchés
?
?
?
?
2 en moyenne
- -
- -


X
X
0.4
1.8 en moyenne
2.2 en moyenne
Marché australien
Marché japonais
Dépend de la fréquence
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Préférences pour 4 caractéristiques de la viande
de porc à partir denquêtes réalisées dans 26 pays
Source Ngapo et al. (2004)
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Génétique Moléculaire

• Génétique Quantitative
• - En général utilisée pour linstant en
  amélioration génétique porcine
• - Théorie sur les gènes et leur hérédité
  basée sur les performances et les généalogies
• Génétique Moléculaire
• - Approche différente
• - Science étudiant les gènes et leurs effets
  directement au niveau moléculaire
• - Permet une sélection plus précise et des
  progrès génétiques plus rapides

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Perspectives

• La recherche en génétique moléculaire progresse
  très vite
• High throughput, high efficiency and low cost
  techniques come into use, e.g. Microarray
  technique, SNP genotyping
• La génétique moléculaire va devenir de plus en
  plus importante en sélection porcine
• Cela pourrait changer lamélioration génétique
  conventionnelle