Our aim

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RHABDOVIRIDAE
Genoma a RNAss di polarita negativa
Envelope (130-240 nm) a forma di
proiettile Capside elicoidale
Lyssavirus virus della rabbia
mammiferi-uomo
Vesiculovirus VSV
mammiferi-uomo-insetti
Virus della Stomatite Vescicolare
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VIRUS della STOMATITE VESCICOLARE
(VSV)
N
P(NS)
M
G
L
3
RHABDOVIRUS
VSV
4
FAMIGLIA Filoviridae Generi EBOLA Zaire ( gt
80 m.) EBOLA Sudan ( 70 m.) EBOLA Reston
VIRUS EBOLA
DIMENSIONI L oltre 1 micron
D 80 nm.
MORFOLOGIA allungata U o 6 Nucleocapside
elicoidale (50 nm, d) Involucro si
GENOMA 1 molecola di RNAss lineare (-) 18.9 kb
- 7 geni

L e VP35 Trascrittasi NP Nucleoproteina VP30
componente del capside VP40 proteina della
matrice VP24 funzione non nota Gp
glicoproteina dell'involucro sGp glicoproteina
di secrezione
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Recettori Ignoti Meccanismo di penetrazione
Ignoto Replicazione nel citoplasma
simile ai Rhabdovirus Meccanismo di maturazione
Gemmazione CPE vescicole
intracitoplasmatiche rigonfiamento dei
mitocondri lisi degli organelli corpi inclusi
citoplasmatici
FATTORE di RISCHIO 4 STABILITA stabile a
temperatura amb. INATTIVAZIONE 60 C per 30
min radiazioni UV
raggi X solventi dei lipidi
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VIRUS DELL'INFLUENZA
Genoma RNAss (-) segmentato
Influenza A - 8 segmenti. Infetta luomo e
diversi animali Influenza B - 8 segmenti.
Infetta solo luomo. Influenza C - 7 segmenti.
Infetta solo luomo.
(80-120 nm)
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Virus dellInfluenza Strategia di un virus a
RNA(-) segmentato
Replica nel nucleo
Utilizza i meccanismi di splicing della cellula
ospite
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Organizzazione strutturale dei complessi RNP de
virus influenzale
PB2
PB1
PA
Modello di RNP. Le sfere blu rappresentano i
monomeri di proteina NP associati al vRNA
(linea nera). Il singolo filamento di vRNA è
ripiegato e forma una struttura hairpin a
doppia elica (sequenze 5 e 3 complementari )
che costiruisce il sito di legame per il
complesso eterotrimerico della RNA polimerasi
RNA-dependente (PB1-PB2-PA).
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Il complesso della RNA polimerasi RNA-dipendente
del virus dellInfluenza A
il complesso RpRd non ha attività di
metiltransferasi per la sintesi del cap
PB2 ruba le sequenze 5-cap agli mRNA della
cellula ospite
La sequenza cap rappresenta il primers per la
sintesi degli mRNA virali da parte di PB1
Ulteriore vantaggio Inibizione della sintesi
degli mRNA cellulari
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Virus Influenzale passaggio dalla trascrizione
degli mRNA alla replicazione del genoma
I livelli di NP neosintetizzata determinano la
transizione della fase
Bassi livelli di NP, sintesi di mRNA
Richiesta di PB2 per legare il cap
Assenza di funzione di PA
Alti livelli di NP, replicazione del genoma
La polimerasi virale acquisisce la capacità di
iniziare la sintesi di RNA senza primer
From Flint et al. Principles of Virology (2000),
ASM Press
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(No Transcript)
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virus a RNAds REOVIRUS
Respiratory Enteric Orphan Virus (150 tipi)
Genoma segmentato (10-11)
Capside icosaedrico doppio (70-75 nm) -
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Reovirus strategia dei virus dsRNA
nel lisosoma proteolisi dei 2 rivestimenti
proteici attivazione della RNA polimerasi virale
contenuta nel core
la trascrizione dei segmenti avviene allinterno
delle particelle core
RdRP proteina m1
ISVP
sintesi di trascritti primari mRNA provvisti
di Cap ma mancanti di polyA
VP nel RE
raggiungono il citoplasma mediante canali posti
in asse di simmetria 5 della particella subvirale
core
nel citoplasma gli mRNA
- traduzione delle proteine
- impacchettamento nelle particelle subvirali
neoformate. Vengono utilizzati come stampo per la
sintesi di nuovi genomi a dsRNA
I virioni maturano nel RE dove acquisiscono il
capside più esterno
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RETROVIRUS
Capside a forma tronco-conica con involucro
Genoma diploide (9-10 Kb) RNAss a polarita
positiva
(80-120 nm)
HIV
LTR Long Terminal Repeats
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Genoma dei Retrovirus

• 7-10 kb/copia

• Diploide 2 copie/virione

• alto grado di ricombinazione

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Replicazione dei Retrovirus
From Flint et al. Principles of Virology (2000),
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La stupefacente azione della RT Iniziazione

• RT sintetizza una copia di DNA a partire da un
  primer di tRNA allestremità 5 del genoma
  virale

• Lattività di RNasi H della RT degrada
  lestremità 5 della molecola di RNA ( genoma
  virale)

• La molecola di DNA neosintetizzata può appaiarsi
  con lestremità 3 del genoma virale (1
  scambio di templato)

From Flint et al. Principles of Virology (2000),
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La stupefacente azione della RT 1 scambio di
templato
From Flint et al. Principles of Virology (2000),
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La stupefacente azione della RT 2 scambio di
templato

• DNA circolare con estremità 5 (U3-R-U5)
  appaiate

• RT (attività di elicasi?) svolge il DNA appaiato
  e continua la sintesi fino alle due estremità 3

RT ha scarsa attività di
proof-reading

• alto grado di mutazioni (10-4 10-6)

• 1 mutazione/genoma/ciclo di replicazione

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Replicazione dei Retrovirus
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Fasi del processo di integrazione del DNA
retrovirale
Formazione di intermedi gapped
Sintesi di riparo (enzimi dellospite)
Lintegrazione è sito specifica per il genoma
virale (estremità), ma casuale nel genoma della
cellula ospite
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gli mRNA di Gag, Pol e Env sono tradotti come
poliproteine che vengono processate dalla
proteasi virale