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Cómo aprender a leer artículos científicos

• Alfredo Prieto Martín
• Profesor Asociado de Inmunología
• Coordinador del programa de doctorado en
  Inmunología, MENCIÓN DE CALIDAD MECD
• Universidad de Alcalá
• alfredo.prieto_at_uah.es
• http//www.alfredoprieto.tk

Unidad mixta CSIC/UAH
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Plan de la clase

• Metodología asimilación información primaria
• 1. Comprensión del texto
• Lectura sistemática
• Búsqueda orientada de información
• 2. Interpretación de ilustraciones
• 3. Escribir un esquema, redactar un resumen y
  una lista de dudas

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Etapas del proceso de asimilación

• Metodología
• Cómo comprender el significado de un texto
  científico.
• Proceso de lectura sistemática
• Cómo leer para entender el significado de un
  texto complejo?
• Búsqueda orientada de información
• Qué información hay que buscar en cada sección?
• 2. Comprender e interpretar la iconografia
  (resultados).
• Método del paréntesis ().
• 3. Escribir un esquema, redactar un resumen de
  cada sección y una lista de dudas.
• Métodos de representación grafica de ideas

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I. Principios de lectura sistemática
1. Dividir la dificultad en partes y abordarlas
sucesivamente. 2. Localizar lo que no se
entiende y aclararlo Usar diccionario, libro
de consulta e internet para descifrarlo y
comprenderlo. 3. Registrar lo más relevante
Apuntar los significados descifrados e ideas
principales. 4. Recapitular para
integrar Releer, resumir y esquematizar para
integrar la información.
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Práctica de la lectura sistemática leer ,
releer y volver a releer
Primera lectura (descifrar palabras para
comprender oraciones) buscar (diccionario,
google) y apuntar significado palabras y hallar
relación entre ellas. Una vez descifrado el
significado de los términos se comprende el
mensaje de cada oración. Segunda lectura
(recapitulación oraciones para comprender
párrafo) relee y relaciona las oraciones y
apuntar al margen el tema principal de cada
párrafo. Tercera lectura (releer párrafos para
comprender sección) se lee de un tirón para
relacionar temas de distintos párrafos. Elaboraci
ón de listas de ideas principales y glosario.
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Ejercicio lectura

• Introducción de un artículo.
• Marquen palabras y busquen significado.
• Anoten ideas principales.
• Hagan un esquema de la introducción.

Oración párrafo sección
Termino Oración párrafo
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II. Búsqueda orientada de información Estructura
lógica del artículoA (I M R D)
Abstract resumen de todo Cuestionario para
lectura crítica del artículo Qué hay que buscar
en cada sección? Introducción Por qué lo
hicieron? Materiales y métodos Qué
hicieron? Resultados Qué encontraron? Discusión
Qué significa?
8
El título
El título identifica la idea principal del
artículo, informa de los nuevos hallazgos o
conclusiones. Qué se mide? En qué modelo?
Se descubre su causa?
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Abstract Un resumen breve

• ResultadosQué han encontrado? Cuáles son los
  resultados y hallazgos más importantes?
• Las respuestas Cuales son las conclusiones del
  estudio.
• A veces al final se señalan aplicaciones
  potenciales, implicaciones e incluso
  especulaciones.

Background Una oración que introduce la
cuestión principal. Es opcional Cuestión
objetivos o propósito Qué quiere contestar este
trabajo? Esa es la cuestión. Qué métodos
utilizan? Qué experimentos hacen?
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Introducción

• Sitúa el estado del conocimiento actual
• Define los conceptos clave y premisas asumidas.
• Justifica esas asunciones.
• Explica por qué los autores realizaron el estudio
  y define los objetivos del mismo.
• Establece la cuestión a la que responde el
  trabajo qué se pretende encontrar?

• Establece hipótesis
• Proposición afirmativa de la que se deducen
  predicciones que serán confirmadas o rechazadas
  por los resultados experimentales
• Se relaciona la cuestión con la aproximación
  experimental y se establece esta
• A veces se anticipa la respuesta encontrada

Esta dirigida a una audiencia de especialistas
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Introducción de artículos metodológicos

• Sitúa el estado del conocimiento actual.
• Explica el problema o la razón por la que el
  nuevo método es necesario.
• Establece las características que deberá tener la
  solución.
• Explica la solución propuesta.

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Material y Métodos

Proporciona información (con detalles y
referencias) para que otro científico pueda
evaluar o reproducir los experimentos. -Para
analizar críticamente un diseño experimental
debes comprender su marco conceptual y descubrir
en qué premisas o asunciones se basa. -Para
comprender esta sección dibuja esquemas de los
protocolos explicados.
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Resultados
-El texto expone los resultados de los
experimentos -Las tablas y figuras representan
los resultados principales. -El orden del texto
de los resultados es paralelo al de la
presentación de datos en ilustraciones. -Cuando
el texto te refiera a una tabla o figura haz un
paréntesis  ( ) (Con suma atención lee el pie de
la figura e intenta comprenderla)
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Discusión
-Su función es responder Qué significan los
resultados, que trascendencia tienen? Al
principio se establece la respuesta resaltando
los hallazgos relevantes y aspectos más
novedosos.

• -A continuación se defiende la validez de los
  hallazgos, usando los resultados del artículo y
  los publicados por otros autores.
• -Se explica
• Cómo los resultados soportan la respuesta a la
  cuestión?
• Porqué la respuesta es razonable?
• Cómo ajusta en el contexto del conocimiento
  actual ( paradigmas y modelos actuales)?

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Se destaca el valor de la respuesta

• Qué añade la respuesta al conocimiento
  existente?
• Deducir aplicaciones o implicaciones de la
  respuesta
• Finaliza restableciendo la respuesta,
• -Recuerda que añade al conocimiento actual
• Establecen sus posibles aplicaciones e
  implicaciones.

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2. Interpretar las ilustraciones

• -Haz un paréntesis al llegar
• -Lee el texto que se refiera a la ilustración.
• Lee el pie buscando el significado de las
  palabras que no entiendas.
• -Anota sobre la ilustración lo que significa cada
  curva cada símbolo o cada barra.
• Vuelve a empezar hasta que lo entiendas

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ILUSTRACIONES

• Las ilustraciones son expresiones gráficas,
  transmiten visualmente mensajes clave
  difícilmente transmisibles mediante palabras.
• Sólo hay dos tipos tablas y figuras
• Tablas
• Representación alfanumérica con información
  ordenada en filas y columnas
• Figuras
• Una ilustración que no es una tabla

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Tabla. 1. Componentes de una tabla

Marcador

LLC
-
B quiescente

LLC
-
B no quiescente

Controles

(n56)

(n56)

(n47)


Células
12
.5
4
.7F

5.42.7F

8
.6
3
.4

CD3CD56()

Células
1
5.6
6
.1F

7
.82.6F

12
.52.9

CD3CD57()


Este es el pie de la tabla. Se representan
valores medios y desviaciones estándar de las
poblaciones estudiadas. LLC-B leucemia linfática
crónica de células B. Número de la tabla (según
orden de citación en texto). Título.
Encabezamiento de la columna. Encabezamiento de
la fila. Campo. FIndica diferencia
significativa con los controles (student t test).
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Estructura típica de un gráfico numérico

• Cada eje representa los valores de una variable.
• Eje X variable independiente.
• Eje Y variable dependiente.

Símbolos y líneas muestran como los cambios en la
variable independiente (discreta o continua)
afectan a los valores que toma la variable
dependiente.
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Ejercicio de interpretación de figuras

• Cual es son las conclusiones que se puede
  extraer de los resultados presentados en la
  figura?
• Cual es el mensaje principal de la figura?

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Relación hipertextual entre texto y figura
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FIG. 1. Impact of the number of
centrifugation-washing procedures on cell loss
and viability of cultured cells. A
Representative dot plot analyses of viable fresh
cells used to adjust the levels for 7-AAD and
annexin V positivity. B,C Analyses of cells
cultured for 24 h in complete medium and acquired
after one (B) or four wash procedures (C). The
cell concen-tration (cells per milliliter) and
the imprecision of replicated determina-tions
(CV) are shown in each quadrant. The cell
populations discrimi-nated in each quadrant are
viable cells (annexin V negative/7-AAD negative)
in the lower left quadrant, early apoptotic cells
(annexin V positive/7-AAD negative) in the lower
right quadrant, late apoptotic cells (annexin V
positive/7-AAD positive) in the upper right
quadrant, and early necrotic cells (annexin V
negative/7-AAD positive) in the upper left
quadrant. DG Percentages of cells after annexin
V and antibody-labeling procedures, which employ
different numbers of cycles of washing-cen-trifuga
tion (from 1 to 4). Viable cells (annexin V
negative/7-AAD negative open bars), early
apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD
negative very lightly shaded bars), late
apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD
pos-itive lightly shaded bars), and early
necrotic cells (annexin V negative/ 7-AAD
positive dark gray bars). In panels E and G, the
black bars represent the fraction of cells lost
in the procedure. The PBMCs were cultured for 24
h in the presence (F,G) or absence (D,E) of
cycloheximide (10 -3 M). Percentages of cells in
relation to those that remain in the test tube
(D,F) and in relation to the original number of
cells in the sample (E,G). Data of one experiment
representative of four are shown.
To assess whether cell loss and damage oc-curred
under standard experimental conditions of
an-nexin V binding (18), aliquots of
cycloheximide-treated and untreated cells were
exposed to varying wash cycles and analyzed by
double-color stainings for annexin V-FITC binding
and membrane permeability to 7-AAD. Wash cycles
caused significant cell loss (Fig. 1AC). This
was cumulative (Fig. 1E,G) and affected the
accuracy of the enumeration by decreasing the
number of enumerated cells in both unstimulated
and cycloheximide-treated cultures (P 0.001 Fig.
1E,G). The number of wash cycles also affected
the precision of cell enumeration. The CV of the
samples enumerated after four wash cycles was
twice as high as that of samples washed only once
(Fig. 1B,C). In addition, it should be noted that
wash cycles not only caused cell loss but also
affected the viability of the cells under
analysis (Fig. 1). The increase in both the
percentage of annexin V-positive and
7-AADpositive permeable cells caused by the wash
cycles was detected by both the proposed (Fig.
1E,G) and the traditional annexin V staining
method (Fig. 1D,F). Minimal washing (one cycle)
keeps both cell loss and artefactual decreases in
cell viability to a minimum and reduces the time
needed to process samples.
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3. Escribir un esquema, redactar un resumen y
una lista de dudas
-A partir del esquema se redacta un resumen de
cada sección. -Hacer una lista de dudas.
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Técnicas para la relación esquemática de ideas
Mapa conceptual
S
V
O
25
Técnicas para la relación esquemática de ideas
Árbol temático
26
Técnicas para la relación esquemática de ideas
Diagrama de agrupamiento de ideas
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Preparación en equipo

• Reparto de la lectura de secciones, intercambio
  de resúmenes.
• Puesta en común de las dudas Unos resolveréis las
  dudas de otros.
• Primera tutoría Se plantean y resuelven las
  dudas pertinaces.
• Preparación de la presentación .
• Segunda tutoría Revisión y Ensayo de
  presentación (si queréis) se resolverán las dudas
  pertinaces.

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Habéis aprendido

• 1. Cómo abordar la lectura de un artículo.
• 2. Qué buscar en cada lugar del articulo.
• 3. Cómo descifrar una ilustración.
• 4. Distintas maneras de representar información
  en esquemas.

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Bibliografía

• McNeal, A (2000). How to read a scientific
  research paper.
• Home page Problem based Learning
• www2.uah.es/problembasedlearning/
• www.alfredoprieto.tk