2

1
2ème partie Construire et rédiger un article
de recherche

• StructureTableaux-Figures
• Points-clés Titre-Résumé
• Conventions internationales

2
Ne pas oublier

• On rédige un article pour être lu
• En position de rédacteur , toujours se mettre
  à la place du lecteur
• Nombreuses références à la  lecture 

3
 Explosion  du nombre darticles scientifiques
Besoin de structurer les idées et denormaliser
les écrits
En 1964 American Institute of Biological
Sciences publie Style Manual for Biological
Journals. Conference of Biological Editors.
Committee of Form and Style.
4
Utilisation dun format  normalisé  Différent
s niveaux de lecture des articles
5
Structure physique delarticle scientifique

1. Titre
2. Auteurs
3. Adresse des auteurs
4. Résumé
5. Corps de larticle
6. Remerciements
7. Liste des références bibliographiques

6
Niveaux de lecture delarticle scientifique

1. Titre
2. Auteurs
3. Adresse des auteurs
4. Résumé
5. mots-clés complément du titre
6. Corps de larticle
7. Remerciements
8. Liste des références bibliographiques

1
Identification
2
3
Complémentsdinformation
7
Comment lit-on les articles scientifiques ?
Sur les Sommaires des Revues
Titre de larticle
Dans les Bases de Données
Résumé
Corps de larticle
8
Titre et résumé sont les  Points-clés  de
tout article scientifique
9
Corps de larticle La structure IMRAD

• 4 parties fondamentales ordre logique de la
  démarche scientifique (biologie, physique)
• Quel est le problème ? Introduction
• Comment et avec quoi a-t-il été étudié ? Matériel
  et méthodes
• Qu'a-t-on trouvé ? Résultats
• Que signifient ces résultats ? Discussion
  éventuellement Conclusion

Lecture
1
4
2
3
10
Structure IMRAD

• Sest imposée au siècle dernier sous limpulsion
  des travaux de Pasteur (et la nécessité de
  soumettre ses résultats aux tests de
  reproductibilité)
• Cest la forme la plus simple et la plus logique
  de communiquer des résultats scientifiques
• Suit la démarche scientifique

11
Compléments dinformation

• Mots-clés complément du titre
• Remerciements
• Liste des références bibliographiques

12
Lecture vs Ecriture

• On écrit pour être lu !
• Mais on rédige scientifiquement en tenant
  compte de la logique des expériences

13

• 2 éléments garantissent le succès de tout
  écrit scientifique
• Le respect de la structure logique de larticle
• Le style de la rédaction utilisation du
  style scientifique caractérisé par
• Précision
• Clarté
• Brièveté

14
Faiblesses de larticle (1)

• Titre
• Général et vague
• Descriptif et non informatif
• Résumé
• Ne suit pas les recommandations aux auteurs
• Ne répond pas aux attentes des lecteurs
• Ne constitue pas un texte autonome
• Rédigé dans un style descriptif et non informatif
• Introduction
• Quelle est la question de recherche ???
• Problème général de la recherche
• Hypothèses absentes
• Stratégie
• Etude de MC Roland (Octobre 2000)

15
Faiblesses de larticle (2)

• Discussion
• Objet de la discussion
• Structuration
• Longueur
• Comparaisons
• Rédaction
• Terminologie
• Grammaire et syntaxe
• Unités de mesure et nomenclature
• Style, lisibilité

16
Les différentes étapes de laconstruction de
larticle
Ecole Doctorale SST2007-2008
17
Les différentes étapes de la construction de
larticle (1)

• Quelle est la question de départ ? Quelle est
  lhypothèse formulée ?
• Analyser et interpréter les Résultats dans leur
  ensemble
• Prendre le temps de réfléchir sur le contenu de
  larticle
• Faire une revue exhaustive de la littérature sur
  le sujet développé dans larticle base pour la
  rédaction de lIntroduction et de la Discussion

18
Les différentes étapes de la construction de
larticle (2)

• Ecrire lIntroduction permet de faire le point
  sur le sujet
• Ecrire la partie Matériel et Méthodes partie
  facile à rédiger
• Réaliser les illustrations éventuelles Tableaux
  et/ou Figures
• Écrire la partie Résultats autour des Tableaux et
  Figures
• Ecrire la Discussion en se reportant à la revue
  de la littérature
• Écrire le Résumé et le Titre de larticle

19
Les différentes étapes de la construction de
larticle (3)

• Relire lensemble et se concentrer sur le
   style  rédactionnel
• La liste des références bibliographiques sest
  élaborée au fur et à mesure de la rédaction avec
  EndNote, Procite ou Reference Manager

20
Hypothèse et rédaction (David Lindsay, 2003)

• Lhypothèse guidera la rédaction
• dans lintroduction on expose lhypothèse et le
  pourquoi de cette hypothèse
• dans les résultats 2 parties
• ceux qui sont liés à la vérification de
  lhypothèse
• ceux qui ne sont pas liés à lhypothèse
• dans la discussion
• arguments relatifs aux résultats qui permettent
  de soutenir ou de rejeter lhypothèse
• arguments relatifs aux autres résultats qui nont
  rien à voir avec lhypothèse

21
Ecrire lintroductionPermet de faire le point
sur le sujet
Ecole Doctorale SST2007-2008
22
Introduction (1)Caractéristiques

• Doit répondre à la question Quel est le
  problème ? Pourquoi cette étude ?
• Donne lhypothèse de travail
• Objectif
• Apporter au lecteur les éléments nécessaires et
  suffisants à la compréhension du travail
• Montrer lintérêt du travail réalisé pour que
  le lecteur ait envie de lire la suite de
  larticle
• Justifier de certains choix

23
Introduction (2)Structure

• Différents paragraphes successifs pour
• présenter le problème et mettre en évidence son
  importance
• le replacer dans le contexte scientifique (cités
  les travaux antérieurs publiés sur le sujet)
• indiquer lobjectif que lon sest fixé, la
  méthode utilisée, lhypothèse de départ

24
Introduction (3)

• Certains auteurs préconisent de donner un aperçu
  des résultats obtenus et les conclusions du
  travail dès lintroduction larticle
  scientifique nest pas un roman  à suspens  ...
• mais le risque est alors de faire une
  simplification artificielle ou un développement
  trop long des résultats !

25
Introduction (4)

• Attention aux introductions trop longues !
• Eviter la citation de trop nombreuses références
  
• citer des articles de synthèse
• sélectionner les références les plus pertinentes,
  les plus récentes et les plus facilement
  accessibles
• Utiliser le temps présent pour faire état de tout
  ce qui est connu et généralement accepté

26
Ecrire la partie Matériel et Méthodes Partie
facile à rédiger
Ecole Doctorale SST2007-2008
27
Matériel et méthodes (1)Rôle

• Donner suffisamment de détails et de précisions
  pour qu'un autre chercheur puisse refaire l(ou
  les) expérience(s) ou vérifier lhypothèse émise
• Faire précisément l'inventaire du matériel
  utilisé 
• Décrire la manière dont ce matériel a été utilisé
  le protocole expérimental

28
Matériel et méthodes (2)Structure

• Plan détaillé allant du plus général au plus
  spécifique
• Matériel détude (population étudiée, animaux,
  plantes, produits)
• Protocole expérimental
• Description technique des appareillages utilisés
   
• Description détaillée des expériences successives
• Traitements statistiques

29
Matériel et méthodes (3)

• Partie assimilée à une  recette  de cuisine
• Comment ? Combien ?
• Si la méthode a déjà été utilisée et décrite en
  détail
• donner la référence de larticle qui la décrit
• préciser uniquement les points qui changent
• Utiliser le temps passé

30
Réaliser les Illustrations Tableaux et Figures
Ecole Doctorale SST2007-2008
31
Tableaux - Figures (1)

• Le moyen le plus efficace pour présenter des
  données est de les représenter sous forme
  dillustrations, tableaux et/ou figures
• Tableaux et figures sont des éléments
  fondamentaux de l'article de recherche

Leur message peut être compris sans connaissance
de la langue de rédaction
32
Tableaux - Figures (2)

• Unités de communication indépendantesLeur
  lecture se fait sans référence au texte, mais le
  texte leur fait obligatoirement référence
• Auxiliaires de rédaction ne doivent être
  utilisés que pour rapporter des données
  essentielles, quand cest réellement utile

33
Tableaux Figures Définitions (1)

• Un tableau est un arrangement systématique de
  données en lignes et colonnes, présentant des
  chiffres précis
• Une figure, cest un diagramme qui montre des
  quantités, révèle des fréquences, des tendances
  ou des relations entre des données
  essentiellement les graphiques (courbes,
  histogrammes)

34
Tableaux Figures Définitions (2)

• Rentrent dans la catégorie des figures les
  schémas, enregistrements, photographies (dont
  photographies de microscopie électronique),
  cartes, séquences dacides aminés, etcElles
  sont alors qualifiées  dillustrations 

35
Données chiffrées Choix entre Tableau et Figure

• Si les valeurs exactes sont importantes
  représentation sous forme de tableau
• Si les tendances ou les relations sont plus
  importantes que les valeurs exactes ou si la
  compréhension des données le nécessite
  représentation sous forme de figure
• On ne doit surtout pas alterner tableaux et
  figures, ou choisir arbitrairement entre les deux
  par souci de variété !

36
Tableau vs Figure ?
Privilégier la lisibilité
37
Numérotation

• La numérotation des tableaux et des figures se
  fait
• indépendamment lune de lautre
• en chiffres arabes
• dans lordre de citation dans le texte

38
Principes généraux (1)

• Exactitude et précision
• Sélectivité le nombre de données à représenter
  doit être limité aux plus pertinentes
• Absence de redondance les données doivent être
  présentées une seule fois
• Uniformité des données similaires doivent être
  représentées de façon similaire
• Illustrating Science Standards for
  publication. CBE, 1988

39
Principes généraux (2)(suite)

• Mise au point le point à mettre en évidence
  doit être apparent
• Clarté et simplicité
• Efficacité visuelle les mots doivent être
  réduits au minimum
• Persuasion une figure doit être visuellement
  convaincante
• Indépendance doivent être compris sans avoir à
  faire référence au texte

40
Tableaux
41
Tableaux

• Différents éléments dun tableau
• un titre
• des lignes
• des colonnes
• des  traits 
• des titres de lignes
• des têtes de colonnes
• des notes de bas de tableau

42
Eléments
Têtes de colonnes
Titre
Colonnes
Lignes
Titres de lignes
Corps du tableau
Notes de bas de tableau
Reproduction (2001) 121, 239-247
43
Tableau liste
44
(No Transcript)
45
Titre dun tableau (1)

• Doit être suffisamment explicite pour ne pas
  avoir à se référer au texte
• Position normalisée au dessus du tableau
• Souvent complété par des notes de bas de tableau

46
Titre dun tableau (2)

• Concis
• Informatif annonce le but du tableau, décrit le
  sujet ou les tendances montrées
• Aussi bref et clair que possible éviter les
  redondances et mots inutiles
• Ni trop long, ni trop court

cf. qualité des titres des articles
47
Titre dun tableau (3)

• Premiers termes importants
• Exemple
• Testosterone production and relative amounts
  of P450scc, P45017alpha, and ISP reductase in
  Leydig cells from four inbred strains of mice

48
Titre dun tableau (4)

• Un titre de tableau peut suggérer une direction
  de lecture
• Exemple
• Effect of uridine-5-diphosphogalactose
  (UDPgal) concentration on spermbinding to
  zona-intact eggs and sperm galactosyltransferase
  (GT) rate

49
Attention aux titres trop longs
Titre
Commentaire
50
Notes de bas de tableau (1)
Notes de bas de tableau complètent le titre
51
Notes de bas de tableau (2)

• Explication des abréviations non standard
  employées
• Explication des termes techniques
• Clé des symboles
• Traitements statistiques
• Sources des données (références bibliographiques)

52
Titres des lignes et têtes de colonnes

• Les titres de lignes et têtes de colonnes
  doivent être suffisamment explicites pour ne pas
  avoir à se référer au texte

53
Attention aux abréviations non expliquées

• Reproduction Nutrition Development (2000)
  40 (4) 359-367

54
Abréviations
(Ruggeri, G., Iera, A., Polito, S., 2005.
802.11-Based Wireless-LAN and UMTS interworking
requirements, proposed solutions and open
issues.Computer Networks 47, 151-166)
55
OK abréviations expliquées en bas de tableau
Reproduction Nutrition Development 2000, 40 (4)
369-382
56
Lignes et colonnes

• Principe de départ il est plus facile de
  comparer des données entre des colonnes quentre
  des lignes

57
Comparaison lignes / colonnes
On doit privilégierla lisibilité !
58
Corps du tableau

• Contient les données de l'expérience doivent
  être pertinentes et significatives, exactes et
  logiques
• Colonnes aligner les points décimaux et les
  signes et -
• Eviter lutilisation de traits verticaux à
  lintérieur du tableau

59
Corps du tableauAlignement dans les colonnes
Reproduction Nutrition Development 40 (4)
383-391 (2000)
60
Attention aux tableaux vides !
61
Attention à lutilisation des abréviations dans
le corps du tableau
62
Dimensions d'un tableau (1) 

• Minimales  
• 3 colonnes - 2 lignes
• ou
• 2 colonnes - 3 lignes 
• Maximales  la taille de la page imprimée
• Plus le nombre de colonnes est élevé, plus le
  tableau est difficile à lire

63
Dimensions d'un tableau (2) 

• Pour condenser un tableau trop grand, se poser
  les questions suivantes
• Est-ce que toutes les lignes et toutes les
  colonnes sont nécessaires ? Attention aux
  colonnes de chiffres inutiles
• Certaines données ne peuvent-elles pas être mises
  en note de bas de tableau ?

64
Colonnes de chiffres inutiles !

• Exemple

Colonne de chiffres inutiles linformationpeut
être mise en note de bas de tableau
65
Informations de notes de bas de tableau
Les données !
66
Tableau confus difficile à lire
67
Check list pour les tableaux (1)

• Etudier le  style  utilisé dans le périodique
  sélectionné et regarder des exemples mais des
  bons
• Composer chaque tableau sur une page séparée en
  double-interligne
• Utiliser des chiffres arabes pour les numéroter
  sauf indication contraire
• Organiser le tableau pour comparer les données
  entre colonnes et non entre lignes
• Regrouper les données logiquement avec les
  valeurs des groupes témoins pour les comparaisons

68
Check list pour les tableaux (2)

• Ne pas utiliser trop de décimales (utiliser 10 n)
• Aligner les chiffres dans les colonnes et les
  signes ou
• Le titre du tableau doit être représentatif du
  contenu
• Expliquer les abréviations non standard et les
  symboles utilisés dans les notes de bas de
  tableau
• Contrôler lexactitude des symboles et des unités
  de mesure
• Etre homogène pour lensemble des tableaux de
  larticle

69
Figures ou illustrations
70
Quest-ce quune bonne figure ?

• Participe à la compréhension du discours écrit ou
  oral (cf. Des supports visuels efficaces pour la
  communication orale)
• Accompagne le discours, met en valeur, souligne
  un fait
• Est appropriée au support (article, diapositives,
  poster)
• A un impact visuel clarté,
  visibilité, lisibilité

71
Figures (1)

• Se justifient si elles amènent un plus à la
  compréhension des résultats
• Outils d'analyse (les graphiques en particulier)
  
• visualisent des valeurs, des tendances et des
  relations
• évitent lanalyse dun tableau de données trop
  fastidieuse
• Utiles quand les mots ne suffisent pas pour
  décrire

72
Figures (2)

• 2 catégories figures rapportant
• informations qualitatives
• Dessins
• Diagrammes et schémas
• Photographies
• Séquences de nucléotides ou dacides aminés
• Cartes, etc ...
• informations quantitatives
• Graphiques courbes, histogrammes,
• Enregistrements divers

73
Choix dune structure visuelle

• Relation entre 2 variables courbe
• Corrélation entre 2 variables nuage de points
• Comparaison de fréquence ou de quantité
  histogramme ou camembert
• Présentation dun mécanisme ou dun protocole
  dessin, schéma
• Présentation de résultats bruts
  photographies, cartes, séquences

74
Dessin
75
Schéma (1)
76
Schéma (2)
77
Attention à la clarté abréviations
78
Photographies (1)
Attention aux repères ou légendes
79
Photographies (2)
Trait déchelle
80
Comparaisons de Séquences
ou
81
Graphiques
Histogrammes
Courbes
82
Barres ou camembert ?
83
Histogrammes
84
Un paramètre mesuré pas daxe des abscisses
85
Attention à lutilisation des hachures
86
Eviter les histogrammes en 3D
87
Les courbes

• Axes
• abscisse paramètre contrôlé
• ordonnée paramètre mesuré
• Points
• Traits
• Degré de précision
• Lettrage

88
Principes de base

• Clarté une figure sera claire et simple si le
  nombre de traits et le nombre de lettres/chiffres
  sont réduits au minimum
• Homogénéité rester homogène dans la
  présentation des résultats

89
Clarté !
90
Clarté
91
Se limiter dans le nombre des paramètres !
92
Manque dhomogénéitéExemple
93
Axes

• Attention à la proportion des axes
• La longueur des axes doit être limitée aux
  valeurs extrêmes
• Eviter les plages libres penser à la
  rupture déchelle et au décalage des axes
• Traits déchelle de préférence vers lintérieur
  de la figure, pas de surcharge sur les axes

94
Proportion des axes
Choisir la bonne proportionpour visualiser au
mieux les variationsou relations
95
Longueur des axes
Le maximum de la courbene doit pas dépasser laxe
96
Décalage des axes
97
Rupture déchelle
98
Traits déchelle sur les axes
Trop de traits
Traits intermédiaires
Limiter le nombre de traits déchelle
99
Légende des axes
trop petite
trop grosse
100
Points expérimentaux

• Choix des symboles bien distincts les uns des
  autres
• Expliquer les symboles dans la légende de la
  figure éviter de le faire à lintérieur de la
  figure

101
Points expérimentaux ronds pleins vs ronds
vides, triangles, carrés
102
Distinction des courbes
Pas clair
103
Légende dune figure

• La légende oriente le lecteur vers la
  signification et linterprétation de la figure
• commence par un titre une phrase concise et
  précise
• suivie dune explication des symboles utilisés,
  de détails expérimentaux spécifiques (ex
  articles de Nature)
• peut être complétée par des références
  bibliographiques

104
Se rappeler (1)

• Etre sûr que la figure montre bien linformation
  à transmettre, mieux que le texte ou quun
  tableau
• Se poser la question quel type de figure est la
  plus appropriée ?
• Etre simple une figure doit être comprise dun
  premier coup dœil
• Limiter le nombre de courbes ou dhistogrammes
  sur une même figure pas plus de 3 à 5 courbes
  ou 6 à 8 histogrammes
• Eviter lespace inutile arrêter les axes aux
  valeurs limites

105
Se rappeler (2)

• Mettre la légende de chaque axe et noter lunité
  de mesure
• Etre uniforme dans lutilisation des figures
• Sélectionner la taille et le format de la figure
  pour lajuster au format du périodique
• Eviter la couleur pour la plupart des périodiques
• Taper la légende de la figure sur une page séparée

106
Écrire la partie Résultats autour des Tableaux
et Figures
Ecole Doctorale SST2007-2008
107
Résultats (1)

• La communication brute des faits, mesures et
  observations
• Plan structuré présentant les différents
  résultats obtenus dans un ordre logique
• Tous les résultats obtenus ne seront pas
  présentés sélectionner les plus représentatifs,
  mais ne pas éliminer ceux qui ne vont pas dans le
  sens souhaité ...

108
Résultats (2)

• Pas dinterprétation les faits, rien que les
  faits !
• Les commentaires détaillés sont pour la
  discussion
• Extraire les tendances générales pour aider le
  lecteur à suivre
• Pas de références bibliographiques
• La rédaction doit être objective et neutre ne
  pas exprimer dopinion ni de biais
• Hiérarchisation des résultats

109
Hiérarchiser les résultats

1. Résultats qui permettent de dire quelque chose de
   substantiel par rapport à lhypothèse de départ
2. Résultats qui permettent de dire quelque chose
   dimportant, mais moins convaincant par rapport à
   lhypothèse de départ
3. Résultats qui permettent de dire quelque chose
   dimportant, mais pas par rapport à lhypothèse
   de départ
4. Résultats qui nont rien à voir avec lhypothèse
   de départ ne pas les utiliser !

110
Résultats (3)

• Les observations rapportées ne doivent l'être
  qu'une seule fois
• soit dans le texte
• soit dans les illustrations
• soit dans les tableaux
• Pas de répétition
• Attention au  verbiage   Il est clairement
  montré dans la Figure X que  
• Utilisation du temps passé, le présent quand on
  décrit un tableau ou une figure

111
Ecrire la Discussion en se reportant à la revue
de la littérature
Ecole Doctorale SST2007-2008
112
Discussion (1)

• Souvent la partie de larticle la plus difficile
  à rédiger !
• Beaucoup darticles sont rejetés à cause dune
  discussion mal rédigée
• Répond à la question Que signifient les
  résultats obtenus ? Confirment-ils mon hypothèse
  de départ ?
• Cest un argumentaire

113
Discussion (2)Principes

• Discussion de vos résultats pas de ceux des
  autres !
• Il faut discuter de vos résultats en relation
  avec
• Ceux des autres
• Le monde réel les applications pratiques,
  la contribution à une pensée générique
• Chaque argument doit aboutir à une conclusion

114
Discussion (3)Rôle et structure

• Interprétation de ses résultats
• Confirmation ou désaccord avec lhypothèse dès
  le premier paragraphe !
• Mise en évidence des exceptions ou de l'absence
  de corrélation avec les résultats déjà publiés
• Comparaison avec des résultats obtenus par des
  travaux antérieurs
• Faire ressortir les grandes idées

115
Discussion (4)Paragraphes

• Faire un paragraphe pour chaque argument
• 3 parties dans un paragraphe
• La phrase de titre du paragraphe de quoi
  sagit-il dans le paragraphe ?
• Le raisonnement logique comment jinterprète
  mon résultats et comment jargumente
• La phrase de conclusion quest-ce que ça
  signifie ?

116
Discussion (5)Rôle et structure

• Placer ses idées par ordre dimportance
  croissante pour aboutir à la démonstration finale
• But convaincre !
• Discussion des implications théoriques et/ou
  pratiques du travail réalisé
• Temps utilisé le passé pour ses travaux, le
  présent pour les faits établis

117
Conclusion

• La conclusion peut être une partie clairement
  identifiée ou le dernier paragraphe de la
  discussion
• Rappel des principaux résultats obtenus et
  orientations futures envisagées

118
Le Résumé et le Titre de larticle
Ecole Doctorale SST2007-2008
119
Quel titre pour votre futur article ?Quel titre
pour votre thèse ?
120
Titres ?

• Leffet de lâge sur le comportement sexuel du
  bélier de la race Ile de France
• Stability analisys of Twisted Superconducting
  Semilocal Strings
• Dynamic Optical Characterization of NEMS
  Resonators
• Does the complexity of the task influence manual
  laterality in De Brazza monkeys?

121
Le titre (1)

• C'est la partie la plus importante de l'article
• 90 des lecteurs ne liront que le titre !
• Son rôle  attirer l'attention du lecteur. Il
  doit être  accrocheur 
• Le titre décrit en aussi peu de mots que possible
  le contenu de larticle c'est le condensé de
  l'article, le résumé du résumé
• Sera composé lorsque larticle sera complètement
  rédigé

122
Le titre (2)

• Peut être
• informatif affirmatif, donnant la conclusion du
  travail
• analytique descriptif, annonçant un
  raisonnement
• interrogatif

123
Informatif

• Affirmatif
• The canine renal parathyroid hormone receptor
  is a glycoprotein characterization and partial
  purification.Biochemistry. 1987 Dec
  126(24)7825-33
• Donnant la conclusion du travail
• Plasminogen activator is associated with the
  extracellular matrix of ovarian granulosa
  cells.Mol Cell Endocrinol. 1988 Mar56(1-2)1-9

124
Analytique

• Descriptif
• Localization, secretion, and action of inhibin
  in human placenta.Science, 1987. 237(4811)
  187-9
• An adaptive adjusting mechanism for agent
  distributed blackboard architecture 
  Microprocessors and Microsystems, 2005. 29 (1)
  1-46

125
Analytique

• Annonçant un raisonnement
• Identification of Herpes Simplex Virus
  Genital Infection Comparison of a Multiplex PCR
  Assay and Traditional Viral Isolation
  Techniques.Mod Pathol. 2001 Mar14(3)152-156

126
Interrogatif

• Un titre interrogatif cherche à provoquer le
  lecteur ou à susciter une réaction
• Is the central arachidonic acid cascade system
  involved in the development of acute-phase
  response in rabbits ?J Physiol. 1988
  Mar397281-9.
• Protein Mobility within the Nucleus-What Are the
  Right Moves ?Cell. 2001 Mar 9104(5)635-8.

127
Le titre (3)

• Doit être 
• court et concis pour permettre une lecture
  rapide (10 à 15 mots)
• clair ni abréviations non normalisées, ni
  formules chimiques, ni terme du jargon
  scientifique
• précis chaque terme apporte une information
  pas de mots inutiles
• spécifique et représentatif du contenu ce sont
  les termes qui sont choisis pour lindexation
  dans les bases de données

128
Titre trop court ... Pas assez informatif

• A push-door for measuring motivation.Applied
  Animal Behaviour Science. 1990. 26 3, 285-286
• Mots clés de l article
• Animal welfare, Starvation, Feeding behaviour,
  Animal behaviour, Behaviour, hens, motivation

129
Titre trop long ...

• Physiological profiles of episodic progesterone
  release during the midluteal phase of the human
  menstrual cycle analysis of circadian and
  ultradian rhythms, discrete pulse properties, and
  correlations with simultaneous luteinizing
  hormone release.J Clin Endocrinol Metab. 1988
  Feb66(2)414-21.

130
Abréviations dans le titre

• The role of sex steroids in the expression of
  MMTV in the normal mouse mammary gland.Biochem
  Biophys Res Commun. 1989 Mar 31159(3)1020
• MMTV Mouse Mammary Tumor Virus
• Optimization of nuclear transcript detection by
  FISH and combination with fluorescence
  immunocytochemical detection of transcription
  factors.J Histochem Cytochem. 1997
  Dec45(12)1585-92Que signifie  FISH  ?

131
dans le résumé

• Detection of specific nuclear transcripts by
  fluorescence in situ hybridization (FISH) has
  constituted a major breakthrough in the study of
  the organization of transcription in the cell
  nucleus. Using the model of heat shock genes, we
  present an optimized procedure for nuclear
  transcripts that provides high efficiency for RNA
  detection and good preservation of cell
  morphology and nuclear texture. Using this
  procedure, we designed an original
  high-efficiency methodology combining FISH and
  fluorescence immunocytochemistry (FICC), which is
  used here for the simultaneous detection of
  heat-shock protein (hsp) nuclear transcripts and
  the specific heat-shock transcription factor 1
  (HSF1). We show that the nuclear accumulation
  sites of HSF1 in heat-shocked cells do not
  correspond to the sites of transcription of the
  hsp70 gene.

132
Abréviations (suite)
A new method for transferring CAN messages using
wireless ATM
133
Abréviations et majuscules (1)

• IVF AND IV CULTURE OF BOVINE EMBRYOS USING SEMEN
  FROM A BULL PERSISTENTLY INFECTED WITH
  BVDTheriogenology (1992) Vol 37 (1)
• IVF In Vitro FertilizationIV In Vitro ou 4
  en chiffres romains ?BVD Bovine Viral Diarrhea

134
Abréviation et majuscules (2)

• EFFECTS OF POSTNATAL DES TREATMENT ON UTERINE
  GROWTH DEVELOPMENT AND ESTROGEN RECEPTOR LEVELS
• DES diethylstilbestrol

135
Autre problème des abréviations Signification
différentes

• Local excision of rectal cancer by transanal
  endoscopic microsurgery (TEM) combined with
  radiotherapy new concept of therapeutic
  approach.Przegl Lek. 200057 Suppl 572-4.
• EELS log-ratio technique for specimen-thickness
  measurement in the TEM.J Electron Microsc Tech.
  1988 Feb8(2)193-200.
• A simple method for the preparation of isolated
  enamel crystallites for transmission electron
  microscopy.J Electron Microsc Tech. 1988
  Feb8(2)225-6.

136
Abréviations normalisées acceptées en biologie
(1)

• Interaction of the regulatory subunit of a type
  II cAMP-dependent protein kinase with mammalian
  sperm flagellum.J Biol Chem. 1988 Feb
  5263(4)2098-104
• The incidence of mitochondrial encephalomyopathies
  in childhood clinical features and
  morphological, biochemical, and DNA
  anormalities.Ann Neurol. 2001 Mar49(3)377-83.

137
Abréviations normalisées acceptées en biologie
(2)

• Introduction of an RNA stability element at the
  5'-end of an antisense RNA cassette increases the
  inhibition of target RNA translation.Antisense
  Nucleic Acid Drug Dev. 2001 Feb11(1)29-40.
• Liste des abréviations acceptées par les revues
  donnée dans les consignes aux auteurs

138
Un titre doit être précis

• Regeneration in the anterior-posterior axis of
  the insect thoracic segmentJ Embryol Exp
  Morphol. 1986 Nov98137-65.Quel insecte ?
• Arachidonic acid and its lipoxygenase metabolites
  stimulate prolactin release in superfused
  pituitary cellsHum Reprod. 1987 May2(4)281-5.
• Quelle espèce étudiée ? Homme ?

139
il ne faut pas avoir à lire le résumé pour
savoir ...

• The direct effect of leukotrienes and other
  lipoxygenase products on prolactin release has
  been assessed. Arachidonic acid and its
  lipoxygenase metabolites 5-hydroxy-6,8,11,14-eicos
  atetraenoic acid (5- HETE) and 15-hydroxy-5,8,10,1
  4-eicosatetranoic acid (15-HETE) stimulated the
  release of prolactin in superfused rat pituitary
  cells in a dose-dependent manner. Leukotrienes
  (LT) A4, B4, C4 and E4 provoked a very marked
  biphasic and dose-dependent secretion of
  prolactin from superfused cells ...

140
Encore un manque de précision ...

• Effets de températures dincubation légèrement
  supérieures ou inférieures à la normale sur la
  mortalité embryonnaire, les performances et
  létat du plumage après léclosionAnnales de
  Zootechnie (1991) 40, 67-72

141
Précision

• En biologie, il faut au minimum préciser lespèce
  animale ou végétale sur laquelle on travaille,
  éventuellement le sexe
• Exemples Apolipoprotein E Is a Putative
  Autocrine Regulator of the Rat Ovarian Theca Cell
  Compartment.Biol Reprod 2001 64
  1080-1089.Mating Induces Gonadotropin-Releasing
  Hormone Neuronal Activation in Anosmic Female
  Ferrets.Biol Reprod 2001 64 1100-1105.

142
Précision de lespèce

• On peut ajouter le nom latin pour quil ny ait
  aucune ambiguïté ...Purified and Refolded
  Recombinant Bonnet Monkey (Macaca radiata) Zona
  Pellucida Glycoprotein-B Expressed in Escherichia
  coli Binds to Spermatozoa. Biol Reprod 2001 64
  1147-1152.

143
Précision pas de mots inutiles

• Ne pas mettre dans le titre des mots qui ne sont
  pas informatifs
• Contribution à létude de
• Etude de
• Données nouvelles sur ...
• Observations of
• Examination of

144
Eviter absolument ...

• Données nouvelles sur l'existence de populations
  ovipares de Lacerta (Zootoca) vivipara au
  nord-ouest de la péninsule balkanique. Le même
  titre en anglais Further evidence of the
  existence of oviparous populations of Lacerta
  (Zootoca) vivipara in the NW of the Balkan
  PeninsulaComptes Rendus de l'Académie des
  Sciences - Series III - Sciences de la Vie.
  Vol.323 (5),2000, p 461-468.

145
Eviter absolument ...

• Contribution à létude des mécanismes de
  régulation de la motricité utérine chez la
  brebis. Thèse de doctorat
• Évidences basées sur le polychromatisme et la
  bioluminescence que l'ophiure cosmopolite
  Amphipholis squamata pourrait ne pas représenter
  un taxon unique. Comptes Rendus de l'Académie
  des Sciences - Series III - Sciences de la Vie
  Vol 323, (5) May 2000. P 499-509

146
Si possible à éviter encore

• Effect of pH on bovine adrenal medulla
  dopamine-beta-hydroxylase.FEBS Lett. 1973 Aug
  1534(2)140-2.
• Effects of bull exposure and body growth on onset
  of puberty in Bunaji and Friesian X Bunaji
  heifers.Reproduction Nutrition Development Vol.
  40 No. 4 July-August 2000 p. 359

147

• On lit de gauche à droite les mots informatifs
  doivent être placés en début de titre cest la
  position forte qui attire lattention
• Le choix des premiers termes est important
• Commencer son titre par un mot-clé !

148
Commencer le titre par un mot-clé

• Luteinizing hormone has a stage-limited effect on
  preantral follicle development in vitro.Biol
  Reprod. 2000 Jul63(1)320-7
• Portable adapter for barcode scanners
  Microprocessors and Microsystems 3 (4), 181-253
  (1999)
• Olfactory cues in the relations between children
  and their pet dogs.Applied Animal Behaviour
  Science. 1987. 19 1/2, 189-195

149
Journal of Biological Chemistry
150
Animal Research
151
Attention à la syntaxe (1)

• An Ultrasonic Method for Assessing the Residence
  Time Distribution of Particulate Foods During
  Ohmic Heating.J. of Food Sci., Vol. 65, No. 7,
  2000
• Dégradation microbienne dans le rumen du maïs
  normal et du maïs  brown mibrid  observée au
  microscope électronique à balayage.Reprod. Nutr.
  Dévelop. 1988, 28 (1), p125-126.

152
Attention à la syntaxe (2)

• Some effects of field history on the relationship
  between grass production in subterranean clover
  pasture, grain yield and take-all (Gaeumannomyces
  graminis var. tritici) in a subsequent crop of
  wheat at Bannister, Western Australia.Australian
  Journal of Agricultural Research. 1987. 38 6,
  1011-1018.

153
Attention aux titres et sous-titres (1)

• A éviter !
• Avantage permettre une lecture à 2 vitesses, la
  1ère situant le sujet, la 2ème apportant des
  précisions sur létude réalisée
• Inconvénient la seconde partie nest pas
  toujours retranscrite dans les références
  bibliographiques...

154
Titres et sous-titres (2)Exemples

• Activation of stimulus-secretion coupling in
  pancreatic beta-cells by specific products of
  glucose metabolism. Evidence for privileged
  signaling by glycolysis.J Biol Chem. 1996 Mar
  1271(9)4838-45.
• Purification and characterization of recombinant
  human interleukin 4. Biological activities,
  receptor binding and the generation of monoclonal
  antibodies.Biochem J. 1989 Sep
  15262(3)897-908.

155
Derniers conseils ...

• Faire lire son projet de titre à plusieurs
  collègues et leur demander dexprimer ce quil
  leur suggère
• Une dernière lecture attentive du titre permet de
  sassurer quil ny a
• pas de fautes de syntaxe
• pas de fautes dorthographe
• pas dabréviations non immédiatement
  compréhensibles
• pas de termes dont linterprétation est ambiguë

156
Refaire un titre (1)

• Cest toujours possible sauf sil est déjà
  publié
• Exemple Comparaison de lévolution de lindice
  de réfraction et de la viscosité au cours de la
  gélification lactique du laitLe Lait (1988), 68
  (1), 1-12
• Gélification lactique du lait
  cinétique daugmentation de lindice de
  réfraction et de la viscosité

157
Refaire un titre (2)

• The influence of time of lambing on the
  performance of Merino ewes
• Quelle influence ? Bonne ou mauvaise
• Quelle performance ? Production de lait, de
  laine ?Courir, sauter ?
• Merino ewes produce more wool if they lamb
  in spring instead of autumn

158
Corriger les premières ébauches des titres des
articles et des thèses
159
Le résumé (1)

• Après le titre, c'est la partie la plus lue et
  donc une partie très importante de l'article
• Il sert à sélectionner les articles qui devront
  être lus complètement

160
Le résumé (2)

• C'est une unité de communication indépendante du
  texte de l'article lui-même
• Il doit se suffire à lui-même, mais est lu dans
  le prolongement du titre il ne faut pas répéter
  les informations données dans le titre

161
Exemple de mauvais résumé
162
Le résumé (3)

• Le lecteur du résumé veut connaître 
• le sujet du travail et les principaux objectifs
• la méthodologie employée
• les principaux résultats
• les principales conclusions tirées de l'étude

163
Le résumé (4)

• Le rôle du résumé détermine sa structure 
• Une phrase replaçant le problème dans un contexte
  général
• Une ou deux phrases décrivant les méthodes et
  techniques utilisées
• Une ou deux phrases rapportant les principaux
  résultats
• Une phrase de conclusion

164
Résumé structuré
Résumé structuré
165
Le résumé (5)

• Condensé de l'article
• Doit être complet, précis, objectif, bref,
  intelligible
• Pas de détails inutiles, pas de définitions
• Eviter d'y mettre des abréviations non
  normalisées, sauf si nécessaire pour gagner en
  nombre de mots (la développer lors de la 1ère
  utilisation), ou des références bibliographiques

166
Que reste-t-il à faire ?
167
Relire lensemble et se concentrer sur le
 style  rédactionnel
Ecole Doctorale SST2007-2008
168
 Style scientifique 

• La rédaction scientifique diffère de la rédaction
  littéraire !
• Les grands principes de la rédaction scientifique
  
• bon usage du temps des verbes
• suppression des variations élégantes un
  même mot pour désigner la même chose !
• suppression des expressions émotionnelles
  intéressant, passionnant nous avons eu la
  surprise de constater ...
• exclusion du passif de modestie utiliser le
  je et le nous

169
Quatre règles fondamentales 

• Etre simple et concis
• Etre certain de la signification de chaque terme
• Préférer l'emploi des verbes aux mots dérivés
  (adjectif, adverbe)
• Dissocier les groupes de mots
• Précision Clarté - Brièveté

170
et encore

• Utiliser des mots simples, usuels et précis 
• Construire des phrases courtes, structurées et
  ponctuées une phrase doit pouvoir être lue en
  une seule fois sujet, verbe, complément
• Faire des paragraphes construits  un sujet par
  paragraphe la première phrase du paragraphe est
  le titre du paragraphe, la dernière est la
  conclusion
• Faire des transitions adaptées
• Employer des intertitres efficaces
• Faire attention aux temps de conjugaison

171
Temps de conjugaison

• Les résultats déjà publiés, dont les conclusions
  sont acceptées, doivent être présentés au temps
  présent dans lintroduction ou dans la
  discussion
• Pour présenter les nouveaux résultats obtenus,
  utiliser le temps passé
• la partie Résultats est rédigée au passé
• la partie Matériel et méthodes aussi

172
Anglais / Américain

• Les revues internationales utilisent deux langues
  anglaises différentes l'américain et l'anglais.
  
• Il n'est pas forcément important d'écrire
  organise ou organize (anglais / américain),
  en revanche, il est important de se décider pour
  l'une des deux langues et de la garder ...

173
Actif / Passif

• En anglais employer en général la voie active
  les phrases sont plus courtes et plus claires
• Exemples
• The data which were obtained by Simon were
  probably indicative of...
• Simon's data suggests...
• Ou
• It might be expected that the treatment would be
  effective.
• We expect this treatment to be effective.

174
Mots et phrases quelques exemples

• Attention
• aux mots qui se ressemblent mais ont des sens
  différents
• after / following pour indiquer une succession
  dans le temps le mot after est plus convenable,
  pour une succession dans l'espace, following est
  meilleur
• While veut dire maintenant , although, bien
  que
• aux mots et phrases maladroites
• a number of many
• approximately about
• based on the fact that because

175
Liste des références bibliographiques
Ecole Doctorale SST2007-2008
176

• Pourquoi des références?
• Quelles références ?
• Comment citer une référence?
• Comment établir une liste de références ?

177
Pourquoi des références ? (1)

• Tout énoncé dans un article de recherche doit
  être justifié
• par le travail présenté dans l'article lui-même
• par un travail ayant déjà fait l'objet de
  publication citations

178
Pourquoi des références ? (2)

• Dans l'introduction elles aident à définir le
  problème et replacent le travail dans le contexte
  scientifique
• Dans le matériel et méthodes elles évitent les
  répétitions de techniques déjà décrites
• Dans la discussion ce sont des éléments de
  comparaison

179
Quelles références ? (1)

• Dans un article de recherche, seules les
  références accessibles à tous sont mentionnées
• Eviter les références à des abstracts de
  congrès ils nont pas toujours reçus un
  contrôle strict des referees et ils sont parfois
  publiés dans des Proceedings difficilement
  accessibles
• Eviter les références aux thèses difficilement
  accessibles !

180
Quelles références ? (2)

• Attention aux travaux 
• non publiés   ne doivent pas être mis dans la
  liste des références
• soumis pour publications   considérés comme
  non publiés
• sous presse   seulement sils sont
  acceptés   donner alors le nom de la revue

181
Importance des références (1)

• Trop souvent négligée !
• Elles permettent  
• au spécialiste (et au referee) de juger 
• de la crédibilité des résultats
• des connaissances de lauteur
• au non-spécialiste 
• de vérifier les informations
• dapprofondir ses connaissances

182
Importance des références (2)

• Affirmations sans preuve et références
  inexactes ou introuvables
• Mauvais jugement du lecteur, doù un
  préjudice a priori !

183
 Règles de citation

• Les règles de citation des références dans le
  texte, ainsi que la présentation des références
  dans la liste, varient en fonction du périodique
  dans lequel on publie
• Les indications sont données dans les consignes
  aux auteurs

184
Règles essentielles à se souvenir !

• Lire les consignes aux auteurs
•  Ne jamais citer un travail que lon na pas lu
• Toujours vérifier une référence par rapport à
  loriginal de larticle
• Vérification ultime des citations et de la
  liste avec le plus grand soin 

185
 Comment citer une référence dans le texte ?

• Il existe 3 systèmes de citation
• nom-date ou système de Harvard
• numérique ou système de Vancouver
• numérique-alphabétique
• Définit dans les consignes aux auteurs

186
Système Nom-Date

• Dans le texte les références sont citées avec
  le nom du 1er auteur de l'article cité, suivi de
  l'année de publicationExemple
• 1 auteur (Dawson, 1976)
• 2 auteurs (Dawson and Glenn, 1985)
• 3 auteurs ou plus (Dawson et al, 1979)
• La liste des références à la fin de l'article est
  établie par ordre alphabétique du 1er auteur,
  puis, pour un même auteur, par ordre chronologique

187
Système Nom-DateEx Journal of Animal Science
188
Système numérique

• Les références sont numérotées dans l'ordre
  d'apparition dans le texte et la liste est
  établie selon cet ordre de citation
• Seul le numéro de la référence apparaît dans le
  texte

189
Système numériqueEx Biology of Reproduction
190
Système alpha-numérique

• Combinaison des 2 systèmes
• La liste des références est établie par ordre
  alphabétique du 1er auteur et les références sont
  ensuite numérotées de 1 à x
• Dans le texte, les références sont citées à
  l'aide de leur numéro

191
Système alpha-numérique Ex Biology of the Cell
192
Comment établir la liste des références
bibliographiques

• Une référence bibliographique, cest la carte
  d'identité du document
• Les éléments d'une référence bibliographique
  varient en fonction du type et de l'origine du
  document article de périodique, ouvrage,
  chapitre d'ouvrage, brevet, etc
• Lordre des différents éléments et la ponctuation
  sont présentés dans les consignes aux auteurs

193
Référence bibliographique Article de périodique

• nom(s) et initiale(s) prénom(s) d'auteur(s)
• année de publication
• titre de l'article
• titre du périodique
• numéro du volume
• première et dernière pages de l'article
• Exemple
• Martal J., Djiane J., Dubois M.P.
  (1977).Immunofluorescent localization of ovine
  placental lactogen. Cell and Tissue Research 184,
  427-433

194
Référence bibliographiqueOuvrage

• nom(s) et initiale(s) de(s) auteur(s) ou éditeurs
  scientifiques 
• année de publication
• titre de l'ouvrage
• éditeur commercial
• ville et/ou pays d'édition

195
Ouvrage
Titre sous-titre
Editeurs scientifiques ouEditors
Année de publication ?Pas toujours sur la page
de garde
Editeur commercial ouPublisher
Ville dédition la 1ère
196
Référence bibliographique Chapitre douvrage

• nom(s) et initiale(s) prénom(s) d'auteur(s)
• année de publication
• titre du chapitre
• In (référence de l'ouvrage)
• éditeur(s) scientifique(s) suivi de la mention
  (ed)
• titre de l'ouvrage
• éditeur commercial
• ville d'édition
• première et dernière pages du chapitre

197
Référence bibliographique Chapitre douvrage

• Exemple
• Stefanini M., Conti M., Geremia R., Ziparo
  E., 1985. Regulatory mechanisms of mammalian
  spermatogenesis. In Metz C.B., Monroy A. (eds)
  Biology of fertilization. Volume 2 Biology of
  the sperm. Academic Press, Orlando. p 59-102.

198
Chapitre
Attention quandon photocopie un
chapitredouvrage il ny a parfois aucun
rappel de référence à louvrage
dorigine Penser à photocopierla page de garde
de louvrage en vérifiant quily a toutes les
informationsutiles
199
Référence bibliographique Communication à un
congrès (1)

• Références différentes selon que la communication
  est publiée
• dans un périodique
• dans un ouvrage spécialisé
• dans un compte rendu de congrès au sens strict
  (proceeding)

200
Référence bibliographique Communication à un
congrès (2)

• Dans un ouvrage spécialisé
• nom(s) et initiale(s) prénom(s) d'auteur(s)
• année de publication
• titre de la communication
• In
• éditeur(s) scientifique(s) (s'il y a lieu)
  suivi(s) de (ed)
• titre du compte-rendu du Congrès
• (titre du congrès)
• lieu du congrès (ville, pays)
• date du congrès
• éditeur commercial
• ville d'édition
• première et dernière pages

201
Référence bibliographique Communication à un
congrès (3)

• Exemple Rommerts F.F.G., Molenaar R., Themmen
  A.P.N., van der Molen H.J., 1986. Hormonal
  regulation of testicular steroidogenesis via
  different transducing systems. In Nunez J.,
  Dumont J.E., King R.J.B. (eds) Hormones and
  cell regulation. (10th INSERM European Symposium,
  Sainte Odile, France, 29 septembre-3 octobre
  1985). INSERM/John Libbey Eurotext, London -
  Paris. 97-109.

202

• Attention aux documents complexes compte-rendu
  de congrès, publié sous forme douvrage,
  considéré comme un supplément dun périodique
  existant !!!

203

204
Communication
à lintérieur
Seule apparaît la référencedu périodique
Journal of Reproductionand Fertility
Supplément 57,31-34
205
Référence bibliographique Thèse ou mémoire

• nom et initiale(s) de l'auteur
• année de la soutenance
• titre de la thèse ou du mémoire
• diplôme obtenu (type de thèse)
• lieu de la soutenance (université, ville)

206
Thèse
Type de thèse
Auteur
Université de soutenance
Titre et sous-titre
Année
207
Référence bibliographique Brevet

• nom(s) de(s) inventeur(s) (inventor)
• nom du déposant (assignee)
• titre du brevet
• pays de délivrance du brevet
• numéro de publication du brevet
• date de dépôt
• code de la classification internationale

208
Brevet
Numéro de publication
Code de classification
Date de dépôt
Auteurs / Inventeurs
Pays Brevet européen
Demandeur(s)
Titre
209
Bibliographie
Ecole Doctorale SST2007-2008
210
Bibliographie

• CBE style manual, 5th edition. A guide for
  authors, editors, and publishers in the
  biological sciences (1983). Council of Biology
  Editors, Inc. Bethesda,Maryland. 324p.
• Illustrating science  Standards for publication.
  (1988). Council of biology editors, Bethesda,
  USA. 296p.
• Briscoe M.H. (1995). Preparing Scientific
  Illustrations. A guide to better posters,
  presentations and publications. 2nd Edition.
  Springer-Verlag, New-York. 204p.
• Davis M. (1997). Scientific papers and
  presentations. Academic Press, San Diego. 296 p.
• Day R.A. (1988). How to write and publish a
  scientific paper, 3rd edition. Oryx Presse, USA.
  211p.

211

• Ebel H.F., Bliefert C. Russey W.E. (1987). The
  art of scientific writing. From student reports
  to professional publications in chemistry and
  related fields. VCH, Weinheim, RFA. 493p.
• Lindsay D. (1996). A guide to scientific writing.
  Manual for students and research workers. (2nd
  Ed) Longman Cheshire, Melbourne. 120 p.
• Matthews J.R., Bowen J.M., Matthews R.W. (1996).
  Successful scientific writing  a step-by-step
  guide for the biological and medical sciences.
  Cambridge University Press. 181 p.
• Moseley J.E. (1993). Guide pratique pour rédiger
  un article en anglais. Principes de rédaction des
  articles scientifiques en anglais. Tempo Médical,
  Paris. 70p.
• Paquette A. Roehner B. (1991). Science in
  english. Belin, Paris. 257p.