Anal

1
Analýza obrazu

• MUDr. Michal Jurajda

2
Definice

• V biologických vedách pod pojmem analýza obrazu
  rozumíme získání kvantitativní informace z
  obrazových dat.

3
Lidský zrak X kamera

• Lidský zrak má schopnost vnímat svetlo s
  obrovským rozsahem intenzit (nocní šero až
  oslunená zasnežená krajina).
• Lidský zrak je však schopen rozlišit po adaptaci
  na dané svetelné podmínky pouze 20 úrovní jasu
  (20 úrovní šedé)
• 8-bitový cb obrázek má 256 úrovní šedé

4
Parametry obrazu

• Rozlišení obrazu udává velikost rastru.
• Bitová hloubka udává pocet barev, kterých muže
  každý bod nabývat. Cím víc barev tím víc bitu
  potrebujeme ke kódování.
• Množství informace nesené obrazovými daty je dáno
  rozlišením násobeno bitovou hloubkou.

5
Obrazový formát

• Formátem obrazu je dán zpusob popisu obrazových
  dat.
• Zásadne analyzujeme rastrové obrázky bez ztrátové
  komprese (TIF, BMP)
• CAVE .jpg

6
(No Transcript)
7
Postup pri analýze obrazu

• Získání obrazu
• Predzpracování (histogram, LUT)
• Segmentace (binární obraz)
• Operace s binárním obrazem
• Merení

8
Získání obrazu

• Digitalizace analogovového záznamu.
• A/D prevodník, framegrabber
• Digitální fotoaparát, kamera

9
Zarízení k získání obrazu

• Optika vytvárí skutecný obraz predmetu na
  svetlocitlivém prvku
• Ohnisková vzdálenost, svetelnost, zoom, atd.
• Kontrola expozice záverka, clona
• Svetlocitlivý element
• Film, CCD, CMOS

10
CCD Vs CMOS

• Today, most digital still cameras use either a
  CCD images sensor or a CMOS sensor. Both types of
  sensor accomplish the same task of capturing
  light and converting it into electrical signals.
• A CCD is an analog device. When light strikes the
  chip it is held as a small electrical charge in
  each photo sensor. The charges are converted to
  voltage one pixel at a time as they are read from
  the chip. Additional circuitry in the camera
  converts the voltage into digital information.
• A CMOS chip is a type of active pixel sensor made
  using the CMOS semiconductor process. Extra
  circuitry next to each photo sensor converts the
  light energy to a voltage. Additional circuitry
  on the chip converts the voltage to digital data.
• Neither technology has a clear advantage in image
  quality. CMOS can potentially be implemented with
  fewer components, use less power and provide data
  faster than CCDs. CCD is a more mature technology
  and is in most respects the equal of CMOS.

11
Expozice

• Cas
• Clona, svetelnost
• EV

12
Histogram

• Kontrola podexpozice a preexpozice
• Presaturované a nesaturované pixely

13
Lookup table

• Umožnuje ruzné zobrazení získaného obrazu

14
(No Transcript)
15
(No Transcript)
16
(No Transcript)
17
Segmentace

• Definujeme, co je objekt zájmu a co pozadí.

18
Binární obraz

• Cernobílý (1bitový obraz)
• Umožnuje pomerne snadno urcité specifické
  operace.
• Dilatace, eroze open, close

19
Analýza obrazu

• Pro analýzu histologických rezu použijeme
  napríklad program ImageJ.

20
Zdroje

• R. Wotton et al. Image analysis in histology