Chemie und Computer

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Chemie und Computer
WS 07/08
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Inhalt

• Hinweise zu Office-Paketen und Microsoft
  Produkten
• MSDNAA, Word, Excel, Powerpoint
• Chemische Software
• Einführung in ISIS-Draw
• Chemdraw, Chemsketch
• freie Software im Internet
• Informationen aus dem Internet
• Gefahr von Plagiaten, Zuverlässigkeit von
  Quellen
• Datenbanken und andere Quellen
• SciFinder, Beilstein, SDBS, acros.be
• Kataloge von Chemikalienherstellern
• andere Quellen im in- und externen Netz
• Einführung in Beilstein

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MSDNAA

• MSDNAA Lizenzen
• Studierende der Fakultät V erhalten auf Antrag
  Lizenzen für alle Microsoft Betriebssysteme,
  Entwickler-Werkzeuge sowie einige Office
  Anwendungen
• Keine klassischen Office Produkte (Word, Excel,
  Powerpoint)
• Lizenzen sind auch für den Heimgebrauch und
  lebenslang gültig
• Infos unter http//www.uni-oldenburg.de/fk5/17641.
  html

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Office-Pakete

• Verfügbarkeit des Microsoft Office-Paketes
• CIP-Raum des Fachbereichs Chemie Raum W3 1-153
• 10 Arbeitsplätze mit 17-TFT-Bildschirmen und
  AMD-Athlon 2000 CPUs
• Betriebssystem Windows XP, diverse Software
  installiert, unter anderem das Office-Paket von
  Microsoft und der Beilstein-Commander
• Rechnerräume des HRZ, die Standorte findet man
  unter http//www.ibit.uni-oldenburg
  .de/7795.html
• Freie Alternative Open Office
• Erhältlich unter http//www.openoffice.org/
• Problem teilweise Kompatibilitätsprobleme mit
  Chemiesoftware (z.B. Chemdraw)

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Word

• Wichtigste Funktion in Word Speichern!
• Um Datenverlusten vorzubeugen regelmäßig
  speichern (nicht jedes mal das Dokument
  überschreiben), automatische Speicherung
  zusätzlich nutzen, gerade bei großen Dokumenten
  neigt Word zu Abstürzen (gilt im geringeren Maße
  auch für Excel und Powerpoint)
• Hilfe
• Die Hilfe erreicht man in den Office-Programmen
  über F1ansonsten kann man auch oftmals über
  Google nützliche Tips finden

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Word

• Formeleditor
• Der Formeleditor ist ein sehr leistungsstarkes
  Tool, um mathematische Formel etc. darzustellen.
  Er ist standardmäßig nicht installiert, muss also
  manchmal nachinstalliert werden.

Dies kann man folgendermaßen machen Systemsteueru
ng ? Software ? Microsoft Office Schaltfläche
Ändern Features hinzufügen und entfernen, dann
Weiter ? Office Tools ? Formel Editor ? vom
Arbeitsplatz starten ? Aktualisieren
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Word

• Formeleditor
• Benutzen kann man ihn, indem man im Menü Einfügen
  auf Objekt geht und sich im neu öffnenden Fenster
  den Microsoft Formel-Editor heraussucht und mit
  Ok bestätigt.
• Bsp.
• mit

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Word

• Formeleditor
• Schriftarten und Eigenschaften wie Fett oder
  Kursiv können im Formeleditor unter
  Formatvorlage ? Definieren eingestellt werden
  

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Word

• Übung Zeichen Sie folgende Formeln im
  Formeleditor

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Word

• Fußnoten, Endnoten und Querverweise
• Einfügen ? Referenz ? Fußnote
• Hier auswählen ob Fußnote (Position unten auf der
  Seite oder am Ende des Textes) oder Endnote (am
  Ende des Dokuments oder am Ende des Abschnitts)
• In der Regel werden Endnoten benutzt, die
  allerdings manchmal kleinere Probleme liefern. In
  wenigen Fällen muss nach den Endnoten noch ein
  abschließender Text kommen, dies ist bei Word so
  nicht vorgesehen. Umgehen kann man dieses Problem
  durch den Einsatz von Abschnitten (s. u.). Indem
  Endnoten nur ans Ende eines Abschnittes gesetzt
  werden, kann man danach einen neuen Abschnitt
  beginnen und neuen Text einfügen.

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Word
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Word

• Beschriftungen
• Jeder Tabelle, Grafik usw. kann eine Beschriftung
  zugefügt werden, die auch bei Umbrüchen
  automatisch an den richtigen Positionen bleibt
• Einfügen ? Referenz ? Beschriftung
• Querverweise Einfügen ? Referenz ? Querverweis
• Auf einige Fußnoten (bzw. Endnoten) muss manchmal
  mehrfach verwiesen werden, dies erfolgt über
  Querverweise
• Abbildungen, Tabellen usw. können ebenfalls über
  Querverweise erreicht werden

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Word

• Abschnitte
• Word-Dokumente lassen sich zusätzlich in
  Abschnitte einteilen, durch die man zum Beispiel
  Kapitel voneinander trennen kann. So können jedem
  Kapitel z. B. eigene Fuß- oder Kopfzeilen
  zugewiesen werden (oder eigene Endnoten).
• Einfügen ? Manueller Umbruch ? Abschnittswechsel

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Word

• Geschütze Zeichen
• Wenn zwei durch Leerzeichen getrennte Wörter
  nicht durch einen Zeilenumbruch getrennt werden
  sollen, nutzt man geschützte Leerzeichen ltstrggt
  ltshiftgt ltspacegt
• Dies funktioniert ebenfalls mit Bindestrichen
  ltstrggt ltshiftgt lt-gt

• Weicher Zeilenumbruch
• Durch ltshiftgt ltentergt kann man einen weichen
  Zeilenumbruch einfügen, der z.B. automatische
  Aufzählungen nicht weiterführt, oder in Bereichen
  mit Blocksatz einen manuellen Zeilenumbruch
  ermöglicht

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Excel

• Auch hier gilt häufiger speichern, um
  Datenverlusten vorzubeugen
• Der Formeleditor ist auch hier über das Menü
  Einfügen verwendbar

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Excel

• Erstellen von Grafiken aus Datensätzen
• Menü Einfügen ? Diagramm
• Bei XY-Datensätzen Diagrammtyp Punkt XY wählen,
  dann den passenden Diagrammuntertyp wählen
• Datenbereich auswählen (je nach Ausrichtung der
  Datentabelle Zeilen oder Spalten wählen)
• Beschriftungen erstellen
• Bei stark unterschiedlichen Reihen, kann eine
  Sekundärachse erstellt werden, indem man per
  Rechtsklick auf eine Datenreihe diese
  formatiert und eine Sekundärachse anwählt
• Regressionen einer bestimmten Datenreihe erfolgt
  ebenfalls, in dem man die entsprechende Reihe
  im Diagramm rechtsklickt und dann Trendlinie
  auswählt
• Alle Achsen und Diagrammflächen sind per
  Rechtsklick weiter formatierbar

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Powerpoint

• Nutzen einer Masterfolie
• Ansicht ? Master ? Folienmaster
• Hier Grafiken, Linien oder Formatierungen, die
  auf jeder Seite gleich sein sollen, einfügen
• Jede Folie nummerieren, damit sie in einer
  Diskussion leichter wieder gefunden werden kann
• Nur eine Schriftart nutzen, und nur wenige
  verschiedene Größen
• Folien so übersichtlich wie möglich gestalten,
  lieber eine Folie mehr erstellen und an anderer
  Stelle kürzen, wenn möglich
• Allgemein bei Präsentationen
• Unbedingt vorher testen, wie lang ein Vortrag
  geht, einhalten einer vorgegebenen Zeit ist
  elementar!

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Weitere chemische Software

• Chemsketch, ISIS/Draw
• Chemsketch http//www.acdlabs.com/download/chemsk
  .html
• ISIS/Draw http//www.mdli.com/downloads/index.jsp
  
• Kostenlos, Registrierung in beiden Fällen
  erforderlich
• ChemDraw
• Bestandteil von ChemOffice und in der vollen
  Version kostenpflichtig, eine Version, die
  zumindest 2 Wochen nutzbar ist, kann man unter
  folgender URL finden http//scistore.cambridgesof
  t.com/software/product.cfm?pid4010
• Links zu weiterer kostenloser Software
• http//spot.fho-emden.de/ftp/chemie.htm

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Chemisches Zeichnen mit ISIS/Draw

• ISIS/Draw ist auch das Zeichenprogramm, das im
  Beilstein-Commander benutzt wird
• Generell ähneln sich die meisten chemischen
  Zeichenprogramme stark, so dass nur am Beispiel
  von ISIS-Draw einige Hinweise für chemisches
  Zeichnen gegeben werden soll
• Auf gleichmäßige Schriftgröße achten
• Gleiche Schriftart für alle Atome
• Bindungswinkel korrekt darstellen, soll heißen z.
  B. bei 3 Bindungen an einem Kohlenstoffatom einen
  Winkel von 120 zwischen den Bindungen einhalten

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Chemisches Zeichnen mit ISIS/Draw

• Mit dieser Regel kann manchmal gebrochen werden,
  z.B. wenn dadurch Eduktmoleküle im Produkt besser
  wiedererkannt werden

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Chemisches Zeichnen mit ISIS/Draw

• Übung Zeichnen Sie folgenden Reaktionsgleichungen
  

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Informationen aus dem Internet

• Uni Oldenburg hat mittlerweile Tools zur
  automatischen Suche nach Textbausteinen im
  Einsatz

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Informationen aus dem Internet

• Was ist erlaubt, was nicht?
• Disclaimer der jeweiligen Quellseiten lesen,
  meist ist nicht einmal das kopieren von Grafiken
  gestattet. Reaktionsmechanismen müssen also
  selbst gezeichnet werden, die Daten aus dem Netz
  dürfen nur Vorlage sein.
• Abschreiben bzw. copy paste von Texten ist
  nicht erlaubt
• Texte dürfen als Vorlage genutzt werden, trotzdem
  muss die Eigenleistung erkennbar sein. In jeden
  Fall müssen Quellen angegeben werden.

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Informationen aus dem Internet

• Verlässlichkeit von Quellen
• Prinzipiell sollte man sich über Quellen im Netz
  erst informieren, sprich wie zuverlässig sind die
  gefundenen Quellen, wer überprüft die Daten?
• Wikipedia ist sicherlich eine beliebte
  Informationsquelle, leider ist es nur die
  Internet-Community, die die Daten hier überprüft.
  Nicht zitierfähig, meistens ist die entsprechende
  Quelle im Wikipedia Artikel auch angegeben.
• Seiten wie www.chemiestudent.de oder auch die
  Protokolle der Fachschaft Chemie sind zwar
  teilweise hilfreich und können als Vorlagen
  dienen, Sicherheit darüber, ob sie richtig sind,
  gibt es jedoch nicht!

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Datenbanken

• Scifinder
• Datenbank zur Literatur-Recherche, nur über das
  Uni-interne Netz verfügbar
• Cambridge Structural Database, CSD
• Kristallstrukturen, Zugang zur Datenbankrecherche
  nur über einen lizensierten Rechner, Strukturen
  aus Artikeln ab 1994 können per mail angefordert
  werden http//www.ccdc.cam.ac.uk/cgi-bin/catreq.c
  gi
• Beilstein
• Umfangreiche Datenbank für organische Moleküle.
  Zugang nur über das Uni-Netz, Recherche erfolgt
  mit dem Beilstein-Commander/MDL
  Crossfire-Commander

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Datenbanken

• Spectral Database System, SDBS
• Spektren-Datenbank für NMR-, MS-, ERS-, Raman und
  IR-Spektren www.aist.go.jp/RIODB/SDBS/cgi-bin/cre
  _index.cgi
• Andere Quellen
• Web of Science, Zugang über das Uni-Netz
  http//portal.isiknowledge.com/portal.cgi?DestApp
  WOSFuncFrame
• Römpp-Chemielexikon, Zugang über das Uni-Netz
  www.roempp.com/prod/index1.html
• Verschiedene Firmen bieten Daten zu den
  verkäuflichen Produkten auf ihren Homepages an
  (z.B. Sigma-Aldrich, acros, Merck u.a.). Eine
  Auflistung und andere Links findet man unter
  http//www.chemie.uni-oldenburg.de/oc/akm/28912.ht
  ml

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Beilstein - Crossfire

• Im Beilstein befinden sich zur Zeit Daten über 9
  Millionen Substanzen und 10 Millionen Reaktionen
• Die Daten stammen aus Literatur der letzten 200
  Jahre
• Zugang zur Beilstein-Datenbank erfolgt über
  Crossfire (Crossfire Commander), Zugang ist nur
  über das Uni-Netz möglich
• Suche kann über Strukturen, die mit einem
  Zeichenprogramm erstellt werden, erfolgen
• Zusätzlich können bestimmte Daten angefordert
  werden, wie zum Beispiel der Brechungsindex oder
  ein Schmelzpunkt usw.
• Dafür sind extra Felder vorgesehen, in denen
  Kürzel für die entsprechende Eigenschaft
  eingetragen werden

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Beilstein - Crossfire

• Häufig genutzte Kürzel
• RI, Refractive Index (Brechungsindex) zu finden
  unter Physical Properties ? Single Component
  System ? Optical Properties
• MP, Melting Point (Schmelzpunkt) Physical
  Properties ? Single Component System ? Physical
  State ? Crystals
• BP, Boiling Point (Siedepunkt) Physical
  Properties ? Single Component System ? Physical
  State ? Liquids
• IR, Infrarot-Spektroskopie Physical Properties ?
  Single Component System ? Spectroscopic
  Information
• NMR, NMR-Spektroskopie Physical Properties ?
  Single Component System ? Spectroscopic
  Information

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Beilstein - Crossfire
Installation
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Beilstein - Crossfire
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Beilstein - Crossfire
Passwort Zugang ist nur aus dem
Uni-Netz möglich! (IP-Bereich 134.106.x.y)
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Beilstein - Crossfire
Problem bei den Rechnern im CIP-Raum
Kann behoben werden, indem man den Ordner für die
Personal Files ändert Options ? Define
Preferences ? Auf L\ setzen Anschließend ist
ein Neustart des Programms und Neueingabe des
Passworts erforderlich
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Beilstein - Crossfire

• Übung
• Suchen Sie zu folgender Verbindung den Siedepunkt
  bei Normaldruck und den Brechungsindex bei 27C
• Suche Sie zu folgender Verbindung den niedrigsten
  und den höchsten Schmelzpunkt
• Suchen Sie zu folgender Verbindung 5 beliebige
  physikalische Daten heraus

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Beilstein - Crossfire

• Übung Suchen Sie zu der folgenden Reaktion ein
  geeignetes Lösungsmittel für die Chlorierung mit
  elementarem Chlor