Title: STANDART DISI AMINO ASITLER
1STANDART DISI AMINO ASITLER
- Mutlu SARIKAYA
- Ankara Üniversitesi Eczacilik Fakültesi
- Biyokimya Anabilim Dali
2Standart Disi Amino Asitler
- 1. Protein yapisinda bulunan Standart Disi Amino
Asitler - 2. Protein yapisinda bulunmayan Standart Disi
Amino Asitler
3Protein Yapisinda Bulunan Standart Disi Amino
Asitler
- Bir standart amino asit polipeptit zinciri
yapisina girdikten sonra bir modifikasyona
ugrarsa Standart Disi Amino Asitler olusur
4- 4-Hidroksiprolin
- Polipeptit zincirlerinde bulunan prolin
kalintilarindan, karisik fonksiyonlu oksijenazlar
kullanilarak 4-hidroksiprolin olusturulur - Bitki hücre duvari proteinlerinde ve bag
dokusunun fibröz proteini olan kollajende
bulunur. Kollajenin stabilitesinde önemli bir rol
oynar. OH gruplari protein yapisinin dayanikli
olmasinda etkilidir
5(No Transcript)
65-Hidroksilizin
- Lizinin türevidir. Kollajenin yapisinda bulunur.
Ancak bu modifikasyona daha az rastlanir. Bu
amino asitin rolü farklidir Polisakkaritler için
tutunma yerleri saglar
7(No Transcript)
8?-karboksi glutamat
- Glutamat türevidir. Pihtilasma faktörü protein
olan protrombinde (Faktör II) ve Ca2 baglayan
diger belli proteinlerde bulunur.
?-Karboksiglutamik asit, glutamatin K vitamini
tarafindan uyarilan bir reaksiyonla modifiye
edilmesi sonucu olusur. Bu modifikasyon proteinin
kalsiyum baglamasini saglar
9(No Transcript)
10Desmozin
- Dört lizin kalintisi içerir. Fibröz protein olan
elastinde bulunur. Elastinin su geçirmeyen
özelliginin saglanmasinda görevlidir
11(No Transcript)
12Selenosistein
- Serin amino asitinin selenyum içeren türevidir.
Glutatyon peroksidaz, glisin redüktaz,
thioredoksin redüktaz gibi bazi enzimlerde ve
bazi hidrojenaz enzimlerde ve diger birçok
proteinde bulunur. Bir veya birden daha çok
selenosistein içeren proteinlere
selenoproteinler adi verilir. - UGA normalde bir bitim (stop) kodonudur. Fakat,
UGAnin selenosistein için kullanildigi
proteinlerin mRNAsi farklidir. mRNAda SECIS
(SElenoCysteine Insertion Sequence) elementi
varsa ribozom UGAyi bitim kodonu olarak
algilamaz. Bunun yerine selenosisteinil-tRNAdaki
selenosisteini proteinin yapisina dahil eder.
13(No Transcript)
14Fosfoserin, Fosfotreonin, Fosfotirozin
- Proteinlerde bulunan serin, treonin ve tirozin
amino asitlerinin protein kinazlar tarafindan
fosforillenmis sekilleridir. Özellikle bazi
enzimlerin yapisinda yer alan serin ve treonin
kalintilarina fosfat grubu baglandiginda ya da bu
grup ayrildiginda (protein fosfotazlar ile) enzim
aktivitesinde degisiklikler meydana gelir
(Kovalent Modifikasyon)
15(No Transcript)
16N-Asetillisin
- Lizinin asetinlenmis türevidir. Özellikle histon
proteinleri için oldukça önemlidir. Histon
proteininde yer alan Lizin asetillenerek DNAnin
sarildigi histon proteininden ayrilmasini
saglayarak gen regülasyonunda görev yapar.
Lizinin asetillenmesini Histon açiltranferaz
enzimi (HAT) saglarken, Histon deaçilaz (HDAC)
deasetilazyon saglar. Ayrica Tubulin proteininde
de N-Asetillisin bulunur
17(No Transcript)
18(No Transcript)
19Lanthionine
- Yapisi Sistinin monosülfat analoguna benzer. Iki
alanin amino asidi ß karbon atomlariyla
birbirleri arasinda tioester bagi yapmislardir.
Bakteri hücre duvarinda ve ayrica nisin,
subtilin, epidermin ve ancovenin gibi
antibiyotiklerin yapisinda bulunur. Bu
antibiyotiklere lantibiyotikler adi verilir
20 216-N-metillizin
- Lizinin türevidir. Kaslarin kontraktil proteini
olan miyozinde bulunur
22(No Transcript)
23- N-Metilarginin Nükleoprotein yapisinda
- 3-Metilhistidin Bir çok enzim ve kas proteininde
24Protein yapisinda bulunmayan Standart Disi Amino
Asitler
- Proteinlerin yapisinda bulunmayan fakat hücrede
çok degisik biyolojik fonksiyonlara sahip amino
asitlerdir
25- Triiyodotironin (T3)
- Tetraiyodotironin (T4)
- Tiroit hormonlari olarak bilinirler. Tiroglobulin
yapisinda bulunan tirozinlerin bir seri
reaksiyonu sonucu olusurlar. Ilk basta proteinin
yapisinda olmasina ragmen, tiroglobulin proteinin
parçalanmasi sonucu serbest hale gelirler. Bu
hormonlar hücre metabolizmasini düzenleyici rol
oynarlar
26(No Transcript)
27?-aminobutirik asit (GABA)
- Glutamin amino asidinin amino grubuna komsu olan
karboksil grubunun dekarboksilasyonu ile
inhibitör nöronlar için transmitter bir madde
olan ?-aminobutirik asit (GABA) olusur. GABA,
önemli bir inhibitör nörotransmitterdir. Santral
ve periferal sinirsel fonksiyonlarda düzenleyici
rol oynar
28(No Transcript)
295-hidroksitriptofan
- Triptofan amino asidinden sentellenir.
Seretoninin öncül maddesidir. Serotonin,
monoamin bir transmitterdir. Merkezi sinir
sistemindeki nöronlar ve gastrointestinal
bölgedeki enterocromafin hücreleri tarafindan
sentezlenir. Ruh halinin, açligin, vücut
sicakliginin, uykunun ve metabolizmanin
düzenlenmesinde görevler yapar
30(No Transcript)
313-4-Dihidroksifenilalanin (DOPA)
- Tirozin aminoasidinden sentezlenir ve dopaminin
öncülüdür. Dopa vücutta ve beyinde dopamine
çevrilir. Dopamin, beyin sapinin üst kisimlarinda
nörotransmitter olarak görev yapar. Dopaminden
türeyen adrenalin (epinefrin), noradrenalin
(norepinefrin) ve bunlarin sentezinde ara ürün
olan dopamin, katekolaminler olarak bilinirler.
Adrenalin ve noradrenalin, böbreküstü bezinin
medülla kisminin hormonlaridir
32(No Transcript)
33S-adenozilmetionin (AdoMet)
- Metionin amino asidinden sentezlenir. Biyolojik
sistemlerde metil vericisi olarak görev yapar.
Noradrenalinden adrenalin, fosfatidil
etanolaminden fosfatidil kolin olusmasi gibi
olaylarda gerekli olan metil grubu (-CH3),
metioninin ATP ile aktiflestirilmis sekli olan
S-adenozilmetioninden (SAM) saglanir. Bir metil
grubunun hedef moleküle aktarilmasi, AdoMeti
S-Adenozilhomosisteine (AdoHcy) dönüstürür
34(No Transcript)
35Homosistein
- Homosistein sistein ve metioninin biyosentezinde
ve metioninin yikiminda bir ara üründür. Son
yillarda yapilan çalismalar dolasim sistemi ile
ilgili hastaliklarda homosistein düzeyinin
düstügünü ortaya koymaktadir. Beslenme katkisi
olarak folik asit, kobalamin ve piridoksin
alinmasi, kandaki homosistein düzeyinin düsmesine
karsi koruyucu etki ortaya koymaktadir. Ayrica,
S-adenozil metiyonin (SAM) üzerindeki metil
grubunu diger bilesiklere transfer ederken de
homosistein olusur
36(No Transcript)
37(No Transcript)
38(No Transcript)
39Ornitin, Sitrulin ve Arjinino süksinik asit
- Ornitin, Sitrulin ve Arjinino süksinik asit üre
döngüsünde ortaya çikan ara metabolitlerdir.
Ayrica sitrulin L-arginin ve oksijenden, oldukça
karmasik bir tepkime sonucu önemli bir serbest
radikal olan nitrik oksit (NO?) olusurken de
sentezlenmektedir. Ayrica ornitin spermin ve
spermidin biyosentezin de kullanilir
40(No Transcript)
41(No Transcript)
42(No Transcript)
433-aminopropanoic acid (ß-alanin)
- ß-alaninde NH3, ß pozisyonundaki karbon atomuna
baglanmistir. Dihidrourasil ve Karnosinin yikimi
sonucu ortaya çikar. Karnosin, anserin ve
pantotonik asidin (vitamin B5) yapisinda bulunur.
44(No Transcript)
45Sistein sülfünik asit
- Sistein amino asidinden olusur. Sisteinden
taurin olusumunda ara metabolittir. Taurin beyin
ve sinir sitemindeki kalsiyum ve potasyum
dengesinin düzenlenmesine yardimci rol
oynamaktadir. Ayrica taurin vücuttaki nörolojik
fonksiyonlari ve nörolojik iletisim mekanizmasini
kuvvetlendirir ve düzenler. Beyin hasarindan
sonra vücutta taurin seviyeleri artirilir bunun
nedeni nörolojik olarak koruyucu olmasi ve
nörolojik canlandirici etkilere sahip olmasidir.
Safra asitleri ile konjugat olusturur.
46(No Transcript)
47Trimethylglycine (Betain)
- Batainin memelilerde bilinen üç görevi vardir
- 1-Renal medulla hücrelerinde ve bazi diger
dokularda ekstrasellüler hipertonik dengeyi
saglar - 2-Saperon proteini gibi denaturasyon kosullari
altinda proteinlerin stabilitesini saglar - 3-Biyolojik reaksiyonlar için metil vericisi
olarak görev yapar
48N-metilglisin (Sarkozin)
- Glisinin metil türevidir. Kas ve vücudun diger
dokularinda bulunur. Sarkozin dehidrogenaz ile
glisine dönüstürülebilir. Glisin N metil
transferaz ile de glisinden sarkozin olusturulur.
Glutatyon, kreatin, purinler ve serinin birincil
metabolik kaynagidir
49N-formil metionin (fMet)
- Prokaryotik proteinlerin ilk amino asidi, formil
metionindir (fMet). Metionin tRNAya
baglandiktan sonra NH2 grubu formillenerek fMet
olusur. Deformilaz enzimi, formil grubunu
polipeptid zincirinin sentezi sirasinda veya
sonrasinda çikartir. Ayrica, aminopeptidazlar da
N ucundaki metionini ve yani sira bir iki amino
asidi daha çikarir. Ayrica mitokondri ve
kloroplastin protein sentezinde de önemli bir
rol oynamaktadir
50O-diazoasetilserin (Azaserin)
- Azaserin pürin nükleotitlerinin sentezini inhibe
eden potansiyel bir antibiyotiktir. Yapisi
glutamine benzer, bu nedenle glutamin
amidotransferazlari (glutaminin amido grubundaki
azotu alici bir moleküle transfer eden
ATP-bagimli enzimler) geri dönüsümsüz biçimde
inhibe ederler. Böylelikle IMP sentezi
gerçeklestirilemez
51Penisilamin
- Kelat yapici özellige sahip bir maddedir.
Cuprimine ve Depen adi altinda ilaç olarak
satilir. Penisilinin bir metabolitidir. Buna
karsin antibiyotik özelligi yoktur. Romatoid
artritin tedavisinde kullanilir. T-lenfosit
sayisini düsürür, makrofaj fonksiyonlarini inhibe
eder, IL-1 ve RF seviyelerini azaltir ve
kolajenin çapraz baglanmasini önler. Ayrica kelat
yapici ajan olarak Wilson hastaliginda ve
sistinüride kullanilir
52- Chloramphenicol Bakteriostatik bir
antibiyotikdir - Sikloserin Mycobacterium tuberculosise karsi
etkili bir antibiyotiktir - ß-aminoizobutirik asit Nükleik asit
metabolizmasinda bir ara metabolittir - L-homoserin Amino asit metabolizmasinda bir ara
metabolittir - O-asetil serin Sistein sentezinde bir ara
metabolittir