Pr

1
Prospectives du laboratoire de Biométrie et
Biologie Evolutive Période 2007-2010
La structure du laboratoire Les grands axes de
recherche Moyens pour la recherche Locaux et
plateaux techniques Les personnels Lenseignement
Conclusions
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La structure du laboratoire

• Rattachements demandés dans le cadre du contrat
  2007-2010
• Équipe Epidémiologie et Santé Publique P.
  Vanhems
• Equipe Evaluation et Modélisation des Effets
  Thérapeutiques F. Gueyffier
• D. Kahn (DR INRA en détachement sur un poste
  INRIA, UMR5558)
• H. Fritz (CR CNRS, CEBC) dans le cadre dune
  demande dATIPE

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Génomique comparative
Populations et Evolution
Génétique et génomique évolutives
Ecologie évolutive
Etude des mécanismes génétiques de lévolution en
relation avec le niveau populationnel et
lenvironnement
Approche phénotypique des mécanismes responsables
de la dynamique adaptative des populations et des
communautés
Méthodologique J. Lobry
Comité de direction
Interactions durables F. Vavre
Modélisation Mathématique et Bio-statistique
Biomaths- Santé
Approches biométriques des grands problèmes de
santé publique
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Les grands axes de recherche

• Méthodologies
• Génomique évolutive
• Ecologie évolutive
• Epidémiologie

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1-Méthodologies
Les grands axes de recherche

• Algorithmique

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Réglis MF Sagot
REGuLarités Inférence et Statistiques
Identifier des régularités, au niveau génomique
et au niveau des réseaux, structurales ou
fonctionnelles, qui pourraient représenter des
indices d'une organisation profonde du vivant ?
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1-Méthodologies
Les grands axes de recherche

• Algorithmique (Projet Réglis)
• Base de données (Génomique ? Santé)
• Les statistiques bayésiennes (Santé ? Génomique,
  Ecologie)
• Ecologie statistique (Ecologie ? Santé)
• Les systèmes dynamiques stochastiques

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2- Génomique évolutive
Les grands axes de recherche

• Structure et évolution des génomes

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Génomicro L. Duret
Génomique micro-évolutive
Elucider les processus évolutifs et révéler les
contraintes fonctionnelles dans les génomes
complets.
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2- Génomique évolutive
Les grands axes de recherche

• Structure et évolution des génomes
• Processus évolutifs (Projet Génomicro)
• Rôle des Eléments Transposables

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3. Ecologie évolutive
Les grands axes de recherche

• Fonctionnement des populations
• et environnement

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Mobilité D. Allainé
Hétérogénéité spatiale et mobilité de la grande
faune. Applications à la conservation despaces
et despèces menacées en Afrique et en Europe 
Deux mésoherbivores de savane africaine
Un carnivore de montagne tempérée
qui circulent sur de vastes espaces hétérogènes
soumis à des pressions anthropiques
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3. Ecologie évolutive
Les grands axes de recherche

• Fonctionnement des populations et environnement
  (projet Mobilité)
• Gestion et conservation de la biodiversité
• Relations hôte-parasite
• Approche écologique et modélisation
• Approche fonctionnelle

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4. Epidémiologie
Les grands axes de recherche
Santé et Environnement  
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Pathocénoses et émergence des maladies
transmissibles  un concept unificateur mis à
lépreuve sur des pathologies exemplaires D.
Pontier
Etudier la co-existence de plusieurs
pathogènes sur leurs propriétés nosologiques
et/ou la dynamique de la population dhôtes.
Equipe UMR Ecologie évolutive
ONCFS
Bordeaux
Institut Pasteur de Tunis
Analyse de données et Modélisation
ENVT
IRD Conditions et territoires démergence des
maladies 
Épidémiologistes, biologistes de populations,
médecins, virologues, généticiens, gestionnaires
de la faune, mathématiciens, statisticiens
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4. Epidémiologie
Les grands axes de recherche

• Santé et environnement
• Etude des facteurs écologiques et populationnels
  impliqués dans la dynamique des infections
  (Projet Pathocénose)
• Confrontation réciproque des modèles
  épidémiologiques des maladies transmissibles chez
  lhomme et lanimal (FIV ?HIV)
• Epidémiologie des maladies non transmissibles
• Modélisation de lincidence des maladies et de
  leur pronostic en conjuguant les approches
  cliniques et populationnelles

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Moyens pour la recherche

• Les Locaux
• Extension du PRABI

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Moyens pour la recherche

• Les Locaux
• Les plateaux techniques
• Microscopie
• Biologie moléculaire
• Ecologie de terrain et écophysiologie

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Moyens pour la recherche

• Les Locaux
• Les plateaux techniques
• Les services communs
• Informatique
• PCR
• Relation avec le DTAMB

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Moyens pour la recherche

• Les Locaux
• Les plateaux techniques
• Les Plate-formes locales et centres nationaux

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Moyens pour la recherche

• Les Locaux
• Les plateaux techniques
• Les services communs
• Les Plate-formes locales et centres nationaux
• Les Personnels
• ITARF et ITA maintenir le savoir faire et
  surtout augmenter laide technique.

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Lenseignement

• Interaction forte entre recherche et enseignement
• Disciplines enseignées
• Bioinformatique, Biostatistique, Biomathématique
• Génétique des populations, Evolution moléculaire,
  Ecologie évolutive
• Filières de formation
• BioInformatique et Biomathématique (INSA)
• Biologie Moléculaire et Cellulaire (UCBL/ENS)
• Mathématique et Informatique du Vivant (UCBL)
• Méthodes denseignement
• Technologie de lInformation et de la
  Communication pour lEnseignement

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Lenseignement
Rentrée 2004
Master mention Spécialité recherche et professionalisante Responsable
EEME Ecologie Evolution Biométrie D. Pontier EE
aMIV Méthodes en Bioinformatique Moléculaire D. Mouchiroud GGE
Modélisation en Epidémiologie et en recherche clinique P. Roy BMS
Approche quantitative et Modélisation formelle pour lInnovation Thérapeutique F. Gueyffier BMS
Outils Mathématiques et Informatique pour le Vivant AB Dufour EE
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Lenseignement
Rentrée 2006
Master mention Spécialité recherche et professionalisante. Responsable
EEME Ecologie Evolution Biométrie D. Pontier EE
aMIV Bioinformatique D. Mouchiroud GGE
Biostatistique P. Roy BMS
Biomathématiques et pharmacologie F. Gueyffier BMS
Biométrie appliquée AB Dufour EE
S3 Epidémiologie P. Vanhems BMS
Projet 2007
Master europeen regroupant les spécialités
recherches de lUMR 5558
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Conclusions

• Maintenir léquilibre entre la biologie évolutive
  et la biométrie,
• Favoriser et développer les échanges intra et
  inter départements,
• Améliorer notre visibilité au niveau national et
  international.