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Title: Fig. 1. MtDNA structural map in Torrent catfish, Liobagrus obesus. All proteins are encoded by genes located on H-strand (upper) with the exception of ND6 ... – PowerPoint PPT presentation

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Title: e-mail: kartavtsev_yu48@hotmail.com


1
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2
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4
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5
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?????????????? P. Hebert ? B. Ward

6
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Class Barco-ded Species Prog-ress Class Barco-ded Species Prog-ress
Actinopterygii 3623 27984 13 Cephalaspidomorphi 9 42 21
Elasmobranchii 259 968 27 Holocephali 15 37 41
Myxini 7 70 10 Sarcopterygii 0 11 0
7
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www.boldsystems.org) (1)
8
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www.boldsystems.org) (2)
9
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10
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    ???????????? ? ???????? ??????????? Leviton et
    al. 1985 http//www.asih.org/codons.pdf), 3)
    ???????? ??????????? ????-????????? ?????????
    ???????? ?????? ? 4) ????????????????? ?????? ?
    ??????? ???? ??????, ??????? ? Fish-BOL
    (http//www.fishbol ), GenBank, NCBI
    (http//www.ncbi.nlm.nih.gov/ ), BolD
    (www.boldsystems.org ) ? FishBase
    (http//fishbase.com/search.php ).

11
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12
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    ????? ????? 2000. ?????????? ????????????? ?????
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  • ?????? ????? ???, ??????? ? ????????????
    ??????????? ??? ??????? ????????????
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    ??????????? ? ???????????? ???????????.
  • ?????????? ???????? Hebert et al., 2004 Ward
    et al., 2005 ?????????, ??, 2006
  • Ratnasingham, Hebert, 2007.
  • ??????? ??????? Moritz, Cicero, 2004 Funk,
    Omland, 2004.

13
????? ????? ??? ??
  • ? ???????? ???????? ??????????? ? ??? ??????? ?
    ??????????? ??? ?????? ??????????? 557 ????? ?
    ?????? ???????? (?????????, ??????, 2004).
    ??????? ???????????? 367 ????? (Froesy, Pauly,
    2005 World Wide Web Fishbase).
  • ??????????????? ????? ??????? ????? 568
    (Froesy, Pauly, 2005 Fishbase, 2005). ?.?.,
    ????? ????? ????? ??? ? ?????? ?????????? 1125.
    ?????? ?? ????? ?????? ???????????? ? ?????????
    (2007) ?????? ????? ??????? ??? ????????? ????
    ?????????? 366 ?????, ? ????? ? ?? ? ????????????
    ????? ??????? 1153 ????? ???????????? ? ??? ??
    170 ????????, 39 ??????? ? 5 ??????? (????????,
    2005). ????? ???????, ??????????? ?????? 1200
    1400 ?????, ? ??? ????? ????? ??????????
    ????????? Fish-BOL, ??????, ?????? ???????????.
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14
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    (????), ????????????? ???????? ??????? ?????????
    ? ???????????? (?????-?????) ? ??.

15
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Chair Masaki Miya Vice Chair Shunping He The
members are Nina Bogutskaya Seinen Chow
Shunping He Yuri Kartavtsev Keiichi Matsuura
Masaki Miya Mutsumi Nishida Ekaterina Vasilieva
North East Asian Regional Working Group
16
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  • ??????????
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    ????????? ???).
  • ????????? ??? (? 2007 ?.?).
  • ????????? ??? ??? (? 2007 ?.?).
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  • ???????
  • Fish-BOL (????? ?????????? ??? ?????????????????
    ??????????? FAO, World Bank etc.).

17
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18
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19
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???????? - ??????? - ?????????? - ?????????
???? - ????? ? ????? - ?????? ? ??????? -
????????? - ?????? ???????? - ????? - ????????
l I I
I I I I
I I I l
l (???????? ???) 600 500
450 400 350 300 250
200 150 100 50 0 PRECAM-
ORDO- SILU- DEVO- CARBONI PER-
TRIAS-JURAS CRETA- CENOZOIC BRIAN
CAMBRIANVICIAN RIAN NIAN FEROUS MIAN
SIC SIC CEOUS ??????????? ?????
??????????? ???????? ? ????? ?????????? ??????
????? ?? ????????? ?????????????????? ?
??????????????? ?????? (?? McLaughlin, Dayhoff,
1972 ???????. ?? Nei, 1987).
20
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    ?????? ????? 16-18000 ?? (??? ???????????). ???
    ?????????? ???????????? ??????, ????? ???? ???
    ????? ??????? ??????????? (Lee et al., 2001 Kim
    et al., 2004 Kim et al., 2005 Nagase et al.,
    2005 Nohara et al., 2005) ? ????, ??? ??????????
    ? ? ?????? ??????????? ????????, ??????? ????????
    (Anderson et al., 1981 Bibb et al., 1981
    Wallace, 1992 Kogelnik et al., 2005). ??????
    ?????? ???????????????? ?????? (??????????)
    ???????? ??????????? ?????? (CR ??? D ?????),
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    ?????.
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    ???????? ???????? 1 (C?-1), ??????? ????????????
    ??? ????????? ???????? ?? ?????? ??? ?????????
    (Johns, Avise, 1998 Hebert et al., 2004
    ?????????, ??, 2006). ????? ???????????????????,
    ??????? ???????????????? ??????, ???????? ???
    ?????? ????? ????? ?? ???? 16S ????.
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    ????????? ???????????????? ?????? ??-?? ?????????
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    ???????? ???????? ?????, ????????? ???????? ?
    ????????? ?????????? ? ?????????????
    ?????????????? ???????? ???????
    ??????????????????? ??? ???????????????? ?????
    (Hilish et al., 1996, Miya et al., 2001). ??? ??
    ?????, ??? ????????????? ?????, ?? ???????
    ????????????, ?????????? ????????? ????
    ???????????? ???????? ???????????????????,
    ???????? ???? ??-1, 654 ??.

21
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?????????? ???????? ????????????? ??????????
22
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A
B
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Hypoglossus elasodon (A) ? ?????? ???????,
Pseudopleuronectes obcurus (?).
23
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????? ??????????? ???????.
24
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  • ???????? ??????? ??????????, ?????????????
    ?????????.
  • ???????? ??????? (Psedopleuronectes yokohamae)
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  • ????????????
  • ?????? ??????

    ?????? ???????
  • ????? ? ????? ???????????? ???????????????????
    NCBI
  • - Cyt-b ??? ? ?????????? ?????? ?? ???????????
  • - 16S ???? ??? ??????????? ? ???????????
    ????????????????? ?????? (Pardo et al., 2005)
  • - Co-1 ??? ? ?????? ???? ????? ??????
  • ??????? ???????? ?????????? ??? ?????????????
    ??????, ? ????? ??? ?????? ??????????????? ?
    ??????????? ??? ????? ?????? ??????????.

Norman, 1934 Moiseev, 1953 Ivankova, 1995 Sakamoto, 1984 Lindberg, Fedorov, 1993
25
???????? ???????
  • ??????? ???????????? ???????????? ? 6 ?????
    ?????? ? ???????? ????????????? ???? ?????? ?
    ???????????? ?????????? ???????????? ???
    Pseudopleuronectes yokohamae P. schrenki ?
    Hippoglossoides elassodon H. robustus.
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    ????????? Pleuronectidae.

26
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27
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    ?????? ??????? (???)
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    ???????.
  • ??? ????????? ??????? ?????? ?? ???? Cyt-b ??? 6
    ????? ?????????? ??? ??????? ? ??????? ???????
    ??? ? ????????? L-12321-Leu (5-GGT CTT AGG AAC
    CAA AAA CTC TTG GTG CAA-3) ? S-LA-16S-H (5-TGC
    ACC ATT AGG ATG TCC TGA TCC AAC ATC-3) ????????
    ???????? ???????? ???????? 8 ???. ?????
    ???????????? ????? ????????????? ?????????,
    ??????????? ??? Cyt-b ?????????? ??? cytb-F,
    5'-ATG GCC AAC CTC CGT AAA TCC CAC CCC CTT C-3' ?
    cytb-R, 5'-CTG GGG CTC TGG ACG CTG AGC TAC TAG
    TGC-3'.
  • ??????????? ????? (50 µl) ??? ??? ???????? 5 µl
    10x ??? ?????? (TaKaRa, Japan), 5 µl L-????????,
    5 µl H-????????, 8 µl ????? dNTP, 1 µl ????????,
    0.5 µl Taq ?????????? (5 units/ µl ) ? 30.5 µl
    ???????????????? ????. ??? ??????? ????????? ?
    ???? 35-40 ?????? ??? ??????? 98oC - 25,
    55-60oC - 30 -90 ? 72oC - 60-120 ?? ????.
    ???????? ??? ?????????? ????????????? ? 1.0
    ????????? ????. ???????????, ????????????
    ???????? ?????? ? ????????????? ? ??-?????. ????
    ???????? ????????? ???-????????? ?
    ??????????????? ???? ??????????? ?? ???????
    pCR2.1 (Invitrogen). ?????????????? ??????????? ?
    ?????????????? ???????????? ????????? T7 ??? M13.
  • ?????? ????????? ?????????????????? ???
  • ???????? ????????? ??? ????????????? ??
    ??????????? ?????? 373S (Applied Biosystems
    Inc.).
  • ?????????????????? ????? ?????? ?? ???? Cyt-b
    ????? ???????????????? ?? ???????? ? ???????
    ?????????? ????????????????????.
  • ??????? ????????? ???????????? ??? ???????????? ?
    ????????????? ???? ??-1 (?????? ? ???????
    ???????).
  • ???????????????? ??????
  • ?????????????????? ??? ???? ????????? ? ???????
    ????????? ClustalW (Thompsn et al., 1994),
    ??????????????? ? ????? MEGA-3 (Kumar et al.,
    1993). ????????????? ?????????? (??? ???????) ?
    ???????????? ??????? ???????????????????.
    ??????????? ?????? ??? ???????????? ????? ???
    ?????????????? ?????? ???????????????????
    ????????? ? ?????????????? ????????????
    ???????????? ???????? Modeltest 3.7 (Posada,
    Grandall, 1998). ????????????? ???? ????????????
    ?? ?????????? ????????, ??????? ??????
    ???????????? ?????????? (MP), ?????????????
    ????????????? (ML) ? ??????????? (BA), ?
    ????????-?????????? ?? ???? ???????, ??? ???
    ?????????? (Nei, Kumar, 2000 Felsenstein, 2004).
  • ?????????? ??? ????? ?????? ?????? ?????????? ???
    (20 ???????????????????) ????????? ??? ??????
    ????? TVNIG ? TrNIG. ?????? ??????,
    TrNIG, ???????? ????????? ????????
    ??????????????? ???????? ????? (Akaike), ?????
    ??? ??????, TVNIG, ??????? ??? ?????????
    ???????? ????? ????????????? ?????????????

28
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29
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??????????? ???? Cyt-b 17 ????? ???????????????
? ?????? ???
30
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    (A-B), ???????????? ???????????????? ???????????
    ?? ?????? ???????????? ??????????????????? ????
    Cyt-b ??? ?????????????????? ????? ??????
    (Pleuronectiformes) ? ??????? ??????? ????????
    (out-group). A ????? ??????????? ?? ??????
    ?????? ?????????? ????????? (NJ) ?
    ????????-?????????? (n1000), B ???????????
    ????? ? ????? ???????? ??????? (???????????, )
    ? n106 ????????? ????????????. ????? ???????? ??
    ?????? ?????? ??????-??? (TrNIG) ? ???????????
    ?? ??????? ??????? ???????? ???
    ??????????????, Perciformes ? ???? -
    ????????????? Cypriniformes. ??????? ?????
    ?????????? ??????? ??? ???? ?????? (?? ?????????
    ? ??. 2007, ????????).

31
???. 8. ??????????? ??????????? ????????????
(50) ?????, ???????????? ????????????????
??????????? ?? ?????? ????????????
??????????????????? ???? Co-1 ??? 13
?????????????????? ????? ??????
(Pleuronectiformes) ? ???? ??????? ????????
(out-group). ? ????? ???????? ???????
(???????????) ? n106 ????????? ????????????.
????? ????????? ?? ?????? ?????? ??????-???
(TrNIG) ? ??????????? ?? ???? ??????? ????????
??????????????, Perciformes. ??????? ?????
?????????? ??????? ??? ???? ?????? (???? ??
?????????????? ??????).
32
???. 8. ??????????? ???????????? (50) ?????,
???????????? ???????????????? ??????????? ??
?????? ???????????? ??????????????????? ????
Cyt-b ??? 34 ?????????????????? ????? ??????
(Pleuronectiformes) ? ???? ??????? ????????
(out-group). ??????????? ????? ? ????? ????????
??????? (???????????, ) ? n106 ?????????
????????????. ????? ???????? ?? ?????? ??????
??????-??? (TrNIG) ? ??????????? ?? ????
??????? ???????? ??????????????, Perciformes.
??????? ????? ?????????? ??????? ??? ???? ??????
(?? Kartavtsev et al., 2007, Marine Biol.).
33
p-?????????? ? ??????? ????????? (1)
?-??????????
???????????? ??????
  • ???. 4. ?????????? ?????????????? ??????? (ANOVA)
    ? ??????? ???????? p-?????????? ? ??????? ???????
    ????????? ????? ??????????????? ???
    (Pleuronectiformes) (?? ????????? ? ??. 2007,
    ????????).
  • ?????????? ?? ??????? ???????? p-??????????.
    ?????? 1. ?????????????, ????? ??????? ?????? ?
    ???? ?? ???? 2. ?????????????, ????? ??????
    ?????? ???? 3. ??????????????, ????? ??????????
    ?????? ?????? ????????? 4. ??????????????, ?????
    ??????? ??????????? ?????? ??????
    (Pleuronectiformes). ?????????? ???????????? ?
    ????????????? ????????? ???????? ??????. SE -
    ??????????? ?????? ???????. ??????? ???????? ??
    ??????? (1) 0.560.07, (2) 3.751.20, (3)
    12.020.21, and (4) 19.330.22.

34
p-?????????? ? ??????? ????????? (2)
?-??????????
???????????? ??????
  • ???. 2.6. ??????, ???????????? ????????
    p-?????????? ??? ??????? ??????????????? ???????
    ? ???????????? ??? (Pisces, Siluriformes) ?? ????
    Cyt-b (?? Kartavtsev et al., 2007, Gene).
  • ?????? 1 1 ????????????? (Intraspecies), 2
    ????????????? (Intragenus), 3
    ????????????????-??? (Intrafamily), 4
    ?????????????? (Intraorder). ???????? ?????
    ???????? ???????? ????????????? ??????? F
    124.74, d.f. 3 29, p lt 0.0001. SE
    ??????????? ?????? ???????.

35
p-?????????? ? ??????? ????????? (3)
?-??????????
???????????? ??????
???. 2.4. ???????????? ?????????? (p-??????????),
??????????? ??? ?????? ????????????????
(Reptilia, Testudines) ?? ?????????
?????????????????? ??????????? ???? 16S ???? ?
????????? ??????? ????????? (1) ?????????????
?????????, (2) ???? ?????? ????, (3) ???? ??????
????????? ? (4) ????????? ?????? (?? Jung et al.,
2006). ???????? ?-??????????, ??????????? ???
????????? ?????? ???????????? ???????, ??????????
?????????? ????????????? ???????????? ? ???? (1)
????????????? ?????????, (2) ????? ?????? ??????
????, (3) ????? ?????? ?????? ????????? ? (4)
????? ??????????? ??????. ???????? ??????????
????????? (1) 2.330.03, (2) 3.340.48, (3)
6.410.11 ? (4) 11.920.37 (??????? SE).
36
  • ???. 5. ?????????????????? ?????? ?????????????
    ??????? ?-?????????? ? ??????? ??????? ?????????
    ?? ????? Cyt-b ? Co-1 ??? ?????? ????????
    ???????? (???????????? 14000 ?????).
  • 1 - ?????????????, ????? ??????? ?????? ? ????
    ?? ???? ?????? ? ????? ??????????? 2 ?????
    ???????????? ??????, 3 - ?????????????, ?????
    ?????? ?????? ???? 4. ??????????????, ?????
    ?????????? ?????? ?????? ????????? (?? ?????????,
    ??, 2006).
  • ??? ??????, ? ????? ?????????????? ?????,
    ????????? ??????? ????? ? ???, ??? ????? ????????
    ??????????????? ?????????? ?? ??????????????
    ??????, ? ???????????????? ?????????????? ??????
    ?????? ??????? (????? ???????????) ? ???????
    ????????? ? ??????????? ??? ???????? ??????????.
    ?????? ???? ?????? ??????? ????????????? ???
    ?????? ????? ???????? ? ???????? ????????????
    ???????????? ????????? (Johns, Avise, 1998
    Avise, 2001 ?????????, 2005 ?????????, ??,
    2006).

37
???????????? ???????? ? ???????? ??????? ?????
??????? ?? ???????
???. 3.3. ???????????? ???????? ? ????????
?????????? ????? ?? ???????? ??????? ??????? ???
?????. 1 ??????? (I0.84), 2 ???????? ?
????-???????? (I0.78), 3 ???? (I0.63), 4
???? (I0.47). ????? ????????????? ???????? ???
??????? (95)(???? ???? ??????, ?? ?????????,
2005, ? ????????????). ????? ???????, ? ??????
??????? ???????? ???????? ????? ???????????? (1)
???????? ???? ??? ? ????????????? ????????
?????????? ??? ???????????????? ? (2) ???
?????????????? (????????????, ?1) ??????
???????????????, ???????? ????????????? ? ???????
??????? ???????????? ????, ? ???????????
??????????? ?????? ???????????? ???????? ?
???????????? ????????????? ???. ???????? ??????
?? ?????? ???????????? ????? ??????????? ??
????? 7.
38
???????????? ?????????? ????? ?????? ?????????
????? ???????? (?? Avise, Aquadro, 1982)
  • ???????? ???????????? ????????? ??? ?????
    ??????????????? ????????, ??? ??? ??????, ?????
    ???? ?? ??????????? ? ????????? ????????????
    ??????, ??? ????? ????? ? ????????? ???????
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