Optimizaci

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Optimización de mathcluster
2
Rocks

• El sistema operativo de mathcluster es Rocks, una
  distribución de Linux intentado para clusters de
  alto rendimiento.

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Los Nodos de mathcluster

• dorothy.bollman_at_mathcluster rocks list host
• HOST MEMBERSHIP CPUS RACK RANK RUNACTION
  INSTALLACTION
• Mathcluster Frontend 4 0 0
  os install
• compute-0-0 Compute 4 0 0
  os install
• compute-0-1 Compute 4 0 1
  os install
• compute-0-2 Compute 4 0 2
  os install
• compute-0-7 Compute 1 0 7
  os install
• compute-0-4 Compute 1 0 4
  os install
• compute-0-5 Compute 2 0 5
  os install
• compute-0-6 Compute 1 0 6
  os install
• dorothy.bollman_at_mathcluster

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hostfiles

• Un hostfile se puede usar para indicar a mpirun
  los nodos y los CPU cores del cluster que
  participarán en un trabajo MPI
• Para ejecutar un programa MPI con la
  configuración indicada por el hostfile
• mpirun - -hostfile arch np p ./prog
• Donde arch is el archivo que contiene el hostfile

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Un posible hostfile para mathcluster

• mathcluster slots1
• compute-0-0 slots1
• compute-0-1 slots1
• compute-0-2 slots1
• compute-0-4 slots1
• compute-0-5 slots1
• compute-0-6 slots1
• compute-0-7 slots1

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Ejemplo

• Si lo anterior está contenido en el archivo
  hostnodes, entonces se puede ejecutar floyd
  mediante
• mpirun - -hostfile hostnodes np p ./floyd arch