Cours de Bact

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Cours de BactériologieFaculté de Médecine de Fès

• Dr. Sylvestre Tigaud
• Laboratoire de Bactériologie
• Centre de Biologie Nord
• Hôpital de la Croix-Rousse
• CHU de LYON

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Structure de la Bactérie

• Dr. Sylvestre Tigaud
• sylvestre.tigaud_at_chu-lyon.fr
• Tel [phone]
• Fax [phone]
• Hôpital de la Croix-Rousse

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Microbiologie

• Microbiologie Biologie des microrganismes ou
  microbes

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I - Généralités

• Cellules procaryotes
• Capable de se développer dans un environnement
  adapté
• synthèses cellulaires nécessaires à leur
  croissance et à leur multiplication
• Parfois elles parasitent des cellules eucaryotes
• Taille variable suivant les espèces
• (0,2 à 6 micromètre)

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Comparaison entre bactérie et cellule eucaryote
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II - Les enveloppes membrane cytoplasmique

• 1 - La membrane cytoplasmique
• entoure le cytoplasme ( C.eucaryote)
• trilamellaire phospholopidique protéines
• Barrière osmotique entre la cellule et son
  environnement
• perméases ? échange par transport actifs
• enzymes respiratoires
• parfois fixation de flagelles responsables de la
  mobilité (hélices protéiques)

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II - Les enveloppes Paroi

• 2 - La paroi Rigide, résistante, perméable
• Composition PEPTIDOGLYCANE
• unique macromolécule
• chaînes glucidiques reliées par des chaînons
  peptidiques
• synthèse par des sous-unités du cytoplasme

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3
2
1
chaîne glycanique
GlcNac
MurNac
GlcNac
MurNac
MurNac
chaîne secondaire exemple,
1
1
Gly-Gly-Gly-Gly-Gly chez staphylocoque
2
2
3
4
4
3
4
3
3
4
2
2
1
1
MurNac
MurNac
MurNac
GlcNac
MurNac
GlcNac
GlcNac
1
1
Tétrapeptide (initialement pentapeptide) 1
L-alanine 2 acide D-glutamique 3 acide
diaminopimélique 4 D-alanine ou L-lysine
2
2

4
3
3
4
3
4
4
3
2
2
1
1
MurNac
MurNac
GlcNac
MurNac
GlcNac
1
2
3
9
Staphylococcus aureus peptidoglycane (redrawn
from a slide by Hiramatsu, San-Diego ICAAC)
Monomeric precursors Cytoplasmic localisation
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II - Les enveloppes Paroi

• Paroi des Gram
• peptidoglycane seul, très solide
• Paroi des Gram -
• espace périplasmique (gel polysaccharidique)
• peptidoglycane en couche très mince
• membrane externe LPS (lipopolysaccharide) qui
  a un pouvoir toxique (endotoxine)
• porines protéines de transport

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Paroi Gram Positif
AcidesTeichoique
Peptido-glycane Parietal
?-lactamases
Transportactif
PLP
Mb. Cytoplasmique
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Paroi Gram Négatif
Mg
Porine
GLP
Mb. Externe
Peptido-glycane Parietal
?-lactamases
Transportactif
PLP
Mb. Cytoplasmique
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Paroi des bactéries à Gram négatif
Membrane externe avec
- lipopolysaccharide de surface LPS - porines
(protéines) pour le transport - récepteurs
phages et bactériocines
Peptidoglycane
Espace périplasmique
Membrane cytoplasmique
Paroi des bactéries à Gram positif
Peptidoglycane avec
- acides teichoïques
Membrane cytoplasmique
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II - Les enveloppes Paroi

• Paroi des mycobactéries
• peptidoglycane recouvert de
• lipides externes complexes tels que les acides
  mycoliques (70 du poids)
• Bactéries déficientes en paroi
• formes L (action des antibiotiques)
• mycoplasmes

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II - Les enveloppes Paroi

• Enveloppe rigide responsable de
• Forme
• sphériques cocci
• cylindriques (bâtonnets) bacilles
• hélicoïdales spirochètes
• Arrangement ou groupement dépend du plan de
  division
• chaînes (streptocoques)
• amas (staphylocoques)
• diplocoques (pneumocoques)
• palissades (corynébactéries)
• Coloration Gram /- Ziehl

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Aspect au Gram Cocci Gram
Isolés, en diplocoques ou en chaînette
Streptococcus Enterococcus Peptostreptococcus Ge
mella Leuconostoc Pediococcus
Isolés, en diplocoques ou en amas
Staphylococcus Micrococcus Stomatococcus
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Aspect au Gram Cocci Gram-
Isolés ou en diplocoques Neisseria Moraxella Vei
llonella
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Aspect au Gram Bacilles Gram
Taille moyenne Lactobacillus Corynebacterium Bif
idobacterium Eubacterium Propionibacterium Listeri
a
Gros bacilles à bout carré Bacillus Clostridium
Lactobacillus
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Aspect au Gram Bacilles Gram
Petits, en pallissade Corynebacterium Propioniba
cterium Listeria Rhodococcus Garderella
Filamenteux, branchés Propionibacterium Actinomy
ces Nocardia Streptomyces
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Aspect au Gram Bacilles Gram-
Taille moyenne, épais Enterobacteriaceae Bactero
ides Prevotella Fusobacterium
Taille moyenne, fins Pseudomonas Enterobacteriac
eae Bacteroides Prevotella Fusobacterium
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Aspect au Gram Bacilles Gram-
Pleomorphiques, long ou courts, souvent vacuolés
(Pseudomonas) (Enterobacteriaceae) Bacteroides F
usobacterium
Petits, souvent cocco-bacillaires
Haemophilus Acinetobacter Moraxella Prevotella P
orphyromonas
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Bacilles Gram-
En forme de virgule Vibrio Campylobacter Helicob
acter
En forme de spirale Treponema Leptospira Borreli
a
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II - Les enveloppes glycocalyx et fimbriae

• 3 - Le glycocalyx
• Présence très fréquente
• Fibres polysaccharidiques qui entourent la
  bactérie
• Responsable de lattachement de la bactérie
• aux cellules vivantes
• à des supports inertes
• 4 - Parfois existence de grosses protéines
  rigides fimbriae ou pili (attachement
  spécifique)

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II - Les enveloppes capsule

• 5 - La capsule
• Constituant inconstant
• Structure polysaccharides acides
• Empêche la phagocytose (pouvoir pathogène)
• Les Ag capsulaires sont à la base de certains
  vaccins

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III - Les constituants du contenu bactérien

• 1 - Cytoplasme
• Gel colloïdal
• Eau 80
• Substances organique et minéral
• ARN
• ARN ribosomal Nombreux ribosomes 2 sous-unité
  
• Sous unité 30S ARNr16S
• Sous unité 50S ARNr 23S
• ARN soluble ARNm et ARNt
• Pas de mitochondries les enzymes transporteurs
  délectrons sont localisé dans la membrane
  cytoplasmique

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III - Les constituants du contenu bactérien

• 2 Lappareil nucléaire
• Chromosome unique ADN (80)
• ADN bicaténaire (double hélice) circulaire
  super-enroulé
• 3 000 à 6 000 gènes génotype
• Déplié 1 mm de longueur
• - Enzymes (10) Cest la machinerie de lADN
• ADN polymérases (copient des doubles brins dADN)
• Topoisomérases
• ADN gyrases
• ARN polymérases

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III - Les constituants du contenu bactérien

• 3 - Plasmides
• non indispensable
• réplication autonome indépendante du chromosome
• portent des gènes codant des avantages sélectifs
• gènes structuraux (fimbriae)
• gènes métaboliques
• gènes de production de toxines
• gènes de résistances aux antibiotiques,
• transmission de plasmides
• aux cellules filles
• à dautres bactéries, même despèces différentes
  (multiples mécanismes)

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Transmission Verticale dun gène muté
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Transmission Verticale et Horizontale intra ou
inter specifique de plasmide ou transposon
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IV - Les spores

• Spore forme de survie de certains bacilles à
  Gram (genre Bacillus , genre Clostridium)
• métaboliquement inactive et non pathogène
• Sporulation dans des conditions défavorables
• Forme végétative
• métaboliquement active et potentiellement
  pathogène
• germination dans des conditions favorables
• Spore résistance à
• la chaleur,
• la dessiccation,
• aux désinfectants
• aux antibiotiques

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Principe de Classification

• On adopte la classification binominale
  internationale des êtres vivants en Genre et
  espèce. Par exemple Homo sapiens.
• N.B. Genre en italique, avec une majuscule,
  espèce en italique sans majuscule. Les noms sont
  latinisés, donc jamais daccent.
• La classification utilise traditionnellement la
  forme, le Gram, lutilisation de loxygène, le
  métabolisme.
• De plus en plus souvent, Séquençage de lARN16S

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Classification schématique des principales
bactéries à Gram positif
groupés en
Microcoques
amas
Staphylocoques
aérobies ou
anaérobies
groupés
facultatifs
Streptocoques
cocci
en chaînettes
Peptostreptococcus
anaérobies
Bacillus
avec spores
Corynébactéries
aérobies ou
Listeria
anaérobies
Lactobacilles
sans spores
facultatifs
Nocardia
Mycobactéries
bacilles
Clostridium
avec spores
anaérobies
Actinomyces
sans spores
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Classification schématique des principales
bactéries à Gram négatif
Neisseria
aérobies
cocci
Veillonella
anaérobies
Pseudomonas
aérobies
Salmonella

Shigella

Klebsiella

Proteus

Escherichia

Yersinia



Bordetella
bacilles
anérobies
Haemophilus
facultatifs
Pasteurella

Vibrio



Bacteroides
anaérobies
Fusobacterium


microaérophiles
Campylobacter

Leptospira
aérobies

spirochètes
Borrelia
anaérobies
Treponema
sans paroi

Mycoplasma