Le monde microbien

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Le monde microbien

• Scène des infections nosocomiales
• Dr J.-M. GUYOT
• U44 ingénierie médicale
• http//www.u44.fr

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Les micro-organismes

• Micro-organisme organisme visible au microscope
• Saprophyte souches bactériennes, virales ou
  parasites trouvés naturellement dans
  lenvironnement, non pathogènes
• Pathogène souches bactériennes, virales ou
  parasites , entraînant une maladie

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Micro-organismes

• Bactéries
• Virus
• Champignons
• Parasites
• Prions (ATNC)

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Principaux Germes des IN
85 BACTERIES
ENTEROBACTERIES STAPHYLOCOQUES PYOCYANIQUES ENTERO
COQUES
Mais TOUTE Bactérie peut être responsable Cas
particuliers ? Bacille de Koch (aérien,
endoscopies) ? Légionella (eau)
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Les bactéries

• Bactéries commensales (ou saprophytes, totalement
  indépendantes de lhôte) vivent en contact
  étroit avec lhôte
• Bactéries pathogènes entraînent des
  perturbations /- sévères chez lhôte
• Bactéries opportunistes deviennent pathogènes
  chez certains hôtes fragilisés

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structure dune bactérie 
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Les bactéries

• Morphologie variable selon les espèces
• Sphérique (cocci)
• Allongée (bacille)
• Incurvée (vibrion)
• Spiralée (spirelle)
• Irrégulière (corynébactérie)
• Ramifiée (actinomycète)

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Bactéries

• Dès larrivée au laboratoire
• examen direct (parfois), résultat immédiat
• puis mise en culture, résultat gt 24h
• puis antibiogramme, résultat gt 48h
• Bactérie -gt Coloration de Gram
• Bacille ou cocci
• Gram positif ou Gram négatif
• Doù 4 possibilités

Cocci Gram -
Cocci Gram
Bacille gram -
Bacille gram
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Bactéries rencontrées dans le milieu hospitalier
(1)

• Cocci gram positif
• Staphylocoques
• Staphylocoque doré ( staphylocoque aureus SA)
• Staphylocoque non doré ( staphylocoque coagulase
  négative, S. blanc, S. Epidermidis )
• Streptocoques
• S. Pneumoniae (Pneumocoque)
• Autres streptocoques
• Entérocoque

Cocci Gram
Bacille gram -
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Bactéries rencontrées dans le milieu hospitalier
(2)

• Bacilles gram négatifs
• Entérobactéries
• Colibacille,
• Proteus,
• Serratia,
• Entérobacter,
• Non entérobactérie
• Pseudomonas (dont P. aeruginosa Pyocyanique)
• Acinetobacter

Cocci Gram
Bacille gram -
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Reservoirs

• 1014 bactéries / être humain
• 100 000 000 000 000
• 10 x plus que de cellules eucaryotes
• rhinopharynx 108/ml
• colon 1011/ml
• FLORES DE L'ENVIRONNEMENT
• Eau potable ?100 bact/ml
• Air 100 à 100 000 bact/cm3
• Sol 106 à 107 bact/gr

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Peau

• Densité 102 bactéries/cm2 en peau sèche et
  exposée à l air à 106 bactéries/cm2 en zone
  humide, chaude, pileuse
• Flore résidente flore transitoire
• Provenance Autres mains, tube digestif,
  rhinopharynx, milieu extérieur / surfaces
• Bactéries S.aureus, Entérobactéries,
  Streptocoques, P.aeruginosa, Acinetobacter

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Naso-pharynx

• Staphylocoque doré
• Streptocoque pneumoniae
• autres streptocoques
• neisseria sp
• Donc surtout des

Cocci Gram
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Tube digestif

• Anaérobies (Bacteroïdes, Clostridium...)
• Entérobactéries (E.coli, P.mirabilis,
  K.pneumoniae, Enterobacter, Citrobacter,
  Serratia)
• Streptocoques
• Entérocoques
• Serratia sp
• P.aeruginosa
• Donc surtout des

Bacille gram -
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Les bactéries

• Les mycobactéries
• mycobactérium tuberculosis
• mycobactérium xenopi
•  
• Les bactéries anaérobies
• clostridium tétani (tétanos)

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Les bactéries

• Bactéries aérobies ont besoin doxygène pour se
  développer
• Bactéries anaérobies se développent dans les
  milieux dépourvus doxygène

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Les virus

• Définition
• Micro-organismes visibles seulement au microscope
  électronique
• Taille 0,2 à 0,3 µm
• Ils tirent leur énergie exclusivement du
  métabolisme de la cellule qu'ils infectent.
• Multiplication intracellulaire obligatoire

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Les virus

• VHB VHC VIH
• VRS
• Grippe HxNy
• Autres

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Les champignons et levures les parasites

• Définition
• Organismes vivants, appartenant le plus souvent
  au règne animal ou végétal, qui deviennent
  visibles à l'il nu lorsqu'ils envahissent une
  surfaces.
• Responsables, chez l'homme, de mycoses souvent
  longues à guérir ou des maladies respiratoires.
• Cavité buccale ou tube digestif
• A l'origine saprophytes (candida albicans).

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Les champignons et levures les parasites

• Reproduction
• Les candidas se reproduisent par bourgeonnement,
  et sont ovalaires. La forme est le plus souvent
  filamenteuse.
• Les kératinophiles se multiplient de manière
  centrifuge par migration. Ils se transmettent par
  contact humain ou animal.
• Les aspergillus sont de forme ovalaire, et se
  multiplient par sporulation.

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Les champignons et levures les parasites

• parasites
• Pneumocystis carinii ( infecte les poumons de
  façon extra-cellulaire et se multiplie dans les
  alvéoles)
• Toxoplasma gondii (responsable de la toxoplasmose
  qui peut aller jusqu'à des lésions viscérales à
  dominante cérébrale)
• Cryptococcus neoformans

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Les agents transmissibles non conventionnels
(ATNC)

• Définition
• Il s'agit de particules infectieuses, non
  bactériennes, non virales, susceptibles de
  s'accumuler dans les cellules de l'hôte,
  principalement au niveau du système nerveux
  central, les organes lymphoïdes.
• Ces sont des protéines pathogènes résistantes,
  responsables d'une spongiose et d'une mort
  neuronale suivies de la mort du patient.

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Les agents transmissibles non conventionnels
(ATNC)

• Maladie de Creutzfeld Jacob
• Iatrogène (hormone de croissance, neuro-chirurgie
  ...)
• Familiale
• Sporadique
• Nouveau variant (viande de boeuf)
• .