ED n2 de Chimie

1
ED n2 de Chimie
ASSOCIATION DU TUTORAT MEDECINE DE MONTPELLIER
(ATM²)

• Sur le cours de
• Mister Sieso

Par vos tuteurs préférés!!
2
Métabolisme azoté Cycle de lurée
3
Méthylation - Cycle de reméthylation
4
AssociationProtéine-Ligand
5
Relation déquilibre lors dun phénomène
mickaëlien

• k1 gt
• P L ltgt PL
• lt k-1
• A léquilibre la vitesse de formation est égale à
  la vitesse de dissociation.
• Attention k1 et k-1, les constantes de vitesse
  ne sont pas égales!!

6
Constante de vitesse et ordre

• V k x An avec v en M.T-1
• Ordre 0 v k x 1 k
• ? k a pour dimension M.T-1
• Ordre 1 v k x A donc k v/A
• ? k a pour dimension T-1 ( ex k-1 )
• Ordre 2 v k x A2 donc k v/A2
• ? k a pour dimension M-1.T-1 ( ex k1 )

7
Fraction de saturation et courbes

• Y PL / (Po) PL / ( PL P ) équation 1
• Y L / ( L Kd ) équation 2
• 1ère courbe Y f (L)
• ? Hyperbole traduit phénomène spécifique,
  réversible et saturant.
• 2ème courbe 1/Y f ( 1/L )
• ? Droite de pente Kd, ordonnée à lorigine
  1, coupe laxe des abcisses pour une valeur de
  1/Kd

8
Dialyse à léquilibre

• Exercice type à deux compartiments
• Po P PL équation 1
• Lo PL 2L équation 2
• Attention variantes
• Pour un compartiment la deuxième équation change
  Lo PL L
• Poosibilité de deux compartiments de volumes
  différents!!

9
Méthode de Scatchard

• N cellules avec n sites récepteurs chacune, dont
  r sites occupés.
• ? Récepteurs totaux N x n
• Kd (P x L) / PL
  
  ( Récepteurs
  libres x L )/ Récepteurs occupés
• ( N x (n-r) x L)/ N x r
• Kd (n-r) x L / r ? r/L n/Kd r x 1/Kd

10
Méthode de Scatchard et courbe

• La courbe r/L f ( r ) est une droite
• ? de pente 1/Kd
• ? ordonnée à lorigine n/Kd
• ? coupe laxe des abcisses pour une valeur de
  n

11
Allostérie et courbe

• 1ère courbe Y Ln / ( Ln K )
• ? il sagit dune sigmoïde avec un phénomène
  de saturation. Pour Y 0,5 on définit L LO,5
• 2ème courbe log ( Y/ ( 1-Y) ) n logL
  logK
• ? pour des faibles et fortes valeurs de logL,
  on a un phénomène mickaëlien (n?1), et pour des
  valeurs intermédiaires on a le phénomène
  dallostérie

12
Myoglobine

• Protéine monomérique michaëlienne
• Son ligand est loxygène
• Un seul site de fixation par molécule
• Concentration en O2? pO2
• ? Y pO2/(pO2p50)

paO2100 mmHg pvO240 mmHg ?Mg tjs sat chez
lhomme (sauf lors dexercice extrême?), sert de
réserve dO2
13
Hémoglobine
T
R

• Protéine tétramérique allostérique
• Dans GR chez ladulte a2ß2
• 4 sites de fixation par molécule (1/monomère)
• His distale remplacé par lO2
• ? pkb ? H et pH - de liaisons
  ioniques
• Y pO2n/(pO2np50n)

R
En milieu acide (muscle en activité), lHb se
comporte comme une base et capte des H En
milieu basique (au niveau des poumons), lHb se
comporte comme un acide et libère des H
T
14
2,3 DPG (diphosphoglycérate)

• Issu de la glycolyse (détourné)
• Grande affinité pour lHb désoxy
• Effet hétérotrope négatif inhibiteur
  allostérique
• Se fixe entre 2 sous unité ß
• Adaptation à court terme à laltitude

15
Effet Bohr

• Définit la variation daffinité de lHb vis-à-vis
  de lO2 en fonction du pH
• Hb O2 HbO2 H

16
Hb Foetale
Rouge Hb A1 Vert Hb F

• a2?2
• Fixe moins bien le 2,3 DPG
• donc plus daffinité pour lO2
• Décalage de la courbe vers la droite

17
Enzymes
18
Les trois indicateurs
19
(No Transcript)
20
(No Transcript)
21
Coenzyme
22
Association du Tutorat Médecine de Montpellier -
2007/2008
22
23
GENERALITES

• Dérivent pour beaucoup des vitamines.
• Subissent des modifs lors de la réaction mais
  sont retrouvés intacts à la fin.
• Un coE nest pas spécifique dune enzyme, il peut
  aider des familles différentes denzymes.
• Les formules ne sont pas à savoir (sauf le couple
  pyridoxal phosphate/pyridoxamine vu avec Mme
  Michel)

24

• On distingue 3 groupes de CoE selon leur action
  
• coE de transfert dhydrogène
• coE de transfert délectrons
• coE de transfert de fractions carbonées
• Bonus autres couple pyridoxal/pyridoxamine
  (PALP) et le phospho-adénosyl phospho-sulfate(PAPS
  )

25
Association du Tutorat Médecine de Montpellier -
2007/2008
25
26
Association du Tutorat Médecine de Montpellier -
2007/2008
26
27
Régulation par les protéines
28
Les RCPG
29

• 50 des médicaments agissent sur de RCPG
• Ils ont une structure commune à connaître

30
STRUCTURE SERPENTINE A RETENIR (parfois
palmitoylation sur cysteine Ct donc boucle intra
C en plus) gamma beta effets sur noynoyau)
31
RCPG STEP by STEP

• Fixation du ligand FIRST STEP
• Alpha GDP?Alpha GTP qui se libère
• Adenine Cyclase BOOST
• ATP ? AMPc SECOND MESSENGER
• Activation PKA (protéine kinase)
• CHAINE DE PHOSPHORYLATIONS
• PCREB!!!!!! TRANSCRIPTION

32
RECEPTEURS ACTIVIT2 TYROSINE KINASE
33
-FIXATION SUR LE RECEPTEUR alpha -autophosphorytio
n DESINHIBEE allosterie sur beta -PTB et SH2
34
Merci de votre attention...
En cas de souci, les tuteurs restent à votre
disposition en permanence (ou PAS!!). Et surtout
BON COURAGE!! Liens http//www.atm2.fr/ http//w
ww.e-carabin.net/ (section Forums Locaux,
Nîmes-Montpellier et enfin Espace Tutorat).