Weaver et al. supplemental Figure 1

1
Weaver et al. supplemental Figure 1
A BALB/c
Epitope
Immunogen
Peptide
B1
B2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B11
B12
B10
UG37(A)
KVTFEPIPIHYCAPA (53)
STVQCTHGIRPVVST (62)
GIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQ (136,137,138,140)
RIKQIINMWQRVGQA (104)
RVLAVERYLRDQQLL(144)
LYKYKVVKIEPLGVA (120)
SF162(B)
CPKVSFEPIPIHYCAPAGF (7459,7460)
VQCTHGIRPVVSTQL (7469)
VQQQNNLLRAIEAQQ LLQLTVWGIKQLQAR (7544,7548)
92RW020_A
Chn19(C)P
QQSNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQTRV (4884,4885)
UG37(A)
DTEVHNVWATHACVP(16)
KVTFEPIPIHYCAPA(53)
STVQCTHGIRPVVST(62)
SF162(B)
VQCTHGIRPVVSTQL (7469)
CPKVSFEPIPIHYCA(7459)
KSIPIGPGKAFYATGDIIG(7484,7485)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
JRFL_B
Chn19(C)P
GKEVHNVWATHACVPTDPNP(4836)
UG37(A)
DTEVHNVWATHACVP(16)
GIVQQQSNLLRAIEAQQHLL(136,137)
SF162(B)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
VQQQNNLLRAIEAQQ(7544)
96ZM651_C
Chn19(C)P
VPVWKEAKTTLFCASDAKAYGKEVHNVWATHACVPTDPNP
SSENSSEYYRLINCNTSAIT(4848)
QQSNLLRAIEAQQHLLQLTV (4884)
(4834)
(4836)
UG37(A)
DTEVHNVWATHACVP(16)
GIVQQQSNLLRAIEAQQHL(136,137)
RIKQIINMWQRVGQA(104)
LYKYKVVKIEPLGVA(120)
RVLAVERYLRDQQLL(144)
KVTFEPIPIHYCAPA (53)
92RW020_A
SF162(B)
VQQQNNLLRAIEAQQ(7544)
CPKVSFEPIPIHYCAPAGF(7459,7460)
VQCTHGIRPVVSTQL(7469)
JRFL_B
Chn19(C)P
QQSNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQTRV(4884,4885)
VPVWKEAKTTLFCASDAKAYGKEVHNVWATHACVPTDPNP
96ZM651_C
(4834)
(4836)
(136,137,138,140)
UG37(A)
DTEVHNVWATHACVP(16)
KVTFEPIPIHYCAPA(53)
GIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQ
LYKYKVVKIEPLGVA(120)
QLQARVLAVERYLRDQQLL(143,144)
CON6
SF162(B)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
CPKVSFEPIPIHYCAPAGF(7459,7460)
VQQQNNLLRAIEAQQ(7544)
Chn19(C)P
SSENSSEYYRLINCNTSAIT(4848)
QQSNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQTRV(4884,4885)
GKEVHNVWATHACVPTDPNP
STVQCTHGIKPVVSTQLLLN(4854)
(4836)
B C57BL/6
Immunogen
Peptide
C1
C2
C3
C6
C7
C8
C9
C5
C4
GDIIGDIRQAHCNVS(81)
UG37(A)
QARPKVTFEPIPIHYCAPA(52,53)
SF162(B)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
92RW020_A
ITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7458,7459,7460,7461)
Deleted
Chn19(C)P
SSENSSEYYRLINCNTSAIT(4848)
GDIRQAHCNISKDKWNETLQ(4862)
UG37(A)
DTEVHNVWATHACVP(16)
QARPKVTFEPIPIHYCAPA(52,53)
ICPTNVPWNSSWSNKSLDE(150,151)
TIKIYELIEESQIQQ(159)
SF162(B)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
CTTAVPWNASWSNKSLDQI(7558,7559)
JRFL_B
CPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7459,7460,7461)
Chn19(C)P
GKEVHNVWATHACVPTDPNP(4836)
GDIRQAHCNISKDKWNETLQ(4862)
KLICTTTVPWNTSWSNKSLD(4889)
UG37(A)
DTEVHNVWATHACVP(16)
EPIPIHYCAPAGYAI(54)
ITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7458,7461)
SF162(B)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
96ZM651_C
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
Chn19(C)P
GKEVHNVWATHACVPTDPNP(4836)
SSENSSEYYRLINCNTSAIT(4848)
IPIHYCTPAGYAILKCNDKT(4851)
GDIRQAHCNISKDKWNETLQ(4862)
UG37(A)
92RW020_A
DTEVHNVWATHACVP(16)
QARPKVTFEPIPIHYCAPA(52,53)
ICPTNVPWNSSWSNKSLDE(150,151)
TIKIYELIEESQIQQ(159)
JRFL_B
SF162(B)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
CTTAVPWNASWSNKSLDQI(7558,7559)
PKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7459,7460,7461)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
96ZM651_C
Chn19(C)P
GKEVHNVWATHACVPTDPNP(4836)
GDIRQAHCNISKDKWNETLQ(4862)
KLICTTTVPWNTSWSNKSLD(4889)
UG37(A)
QARPKVTFEPIPIHYCAPA(52,53)
DTEVHNVWATHACVP(16)
GDIIGDIRQAHCNVSGSQW(81,82)
CNTSGLFNSTWVNGT(97)
ICPTNVPWNSSWSNKSLDE(150,151)
TIKIYELIEESQIQQ(159)
SF162(B)
CON6
ITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7458,7459,7460,7461)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
CTTAVPWNASWSNKSLDQI(7558,7559)
Chn19(C)P
MRVTGIRKNYQHLWRWGTMLLGML(4830, 5445)
GKEVHNVWATHACVPTDPNP(4836)
GDIRQAHCNISKDKWNETLQ(4862)
LLGIWGCSGKLICTTTVPWNTSWSNKSLD(4888,4889)
C C3H-NeJ
Immunogen
Peptide
H1
H2
H3
H4
H5
H6
H7
UG37(A)
TDIISLWDQSLKPCV(27)
QHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRD(140,141,143)
SF162(B)
LLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7548,7549,7551)
92RW020_A
Chn19(C)P
NQMHEDVISLWDQSLKPCVK(4840)
AQQHLLQLTVWGIKQLQTRVLAIERYLKDQ(4885,4886)
UG37(A)
TDIISLWDQSLKPCV(27)
QHLLKLTVWGIKQLQARVL(140,141)
SF162(B)
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
NNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQARVLAV(7545,7548,7549)
JRFL_B
Chn19(C)P
QEMVLENVTENFNMWKNDMVNQMHEDVISLWDQSLKPCVK(4838,4840
)
AQQHLLQLTVWGIKQLQTRVLAIERYLKDQ(4885,4886)
WEREIDNYTSLIYTLLEESQ(4892)
TDIISLWDQSLKPCV(27)
UG37(A)
QHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRD(140,141,143)
SF162(B)
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
LLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7548,7549,7551)
96ZM651_C
Chn19(C)P
QEMVLENVTENFNMWKNDMVNQMHEDVISLWDQSLKPCVK(4838,4840
)
AQQHLLQLTVWGIKQLQTRVLAIERYLKDQ(4885,4886)
UG37(A)
TDIISLWDQSLKPCV(27)
QHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRD(140,141,143)
92RW020_A
SF162(B)
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
JRFL_B
NNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7545,7548,7
549,7551)
Chn19(C)P
QEMVLENVTENFNMWKNDMVNQMHEDVISLWDQSLKPCVK(4838,4840
)
96ZM651_C
AQQHLLQLTVWGIKQLQTRVLAIERYLKDQ(4885,4886)
WEREIDNYTSLIYTLLEESQ(4892)
UG37(A)
TDIISLWDQSLKPCV(27)
QHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRD(140,141,143)
SF162(B)
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
SLTLTVQARQLLSGI(7540)
CON6
LLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7548,7549,7551)
Chn19(C)P
QEMVLENVTENFNMWKNDMVNQMHEDVISLWDQSLKPCVK(4838,4840
)
GAASITLTVQARQLLSGIVQ(4882)
AQQHLLQLTVWGIKQLQTRVLAIERYLKDQ(4885,4886)
2
Weaver et al. supplemental Figure 2
A BALB/c
Epitope
Immunogen
Peptide
B1
B2
B4
B5
B6
B7
B9
B11
MN
ACPKISFEPIPIHYC (6261)
TVQCTHGIRPVVSTQ (6271)
IVQQQNNLLRAIEAQ (6346)
LTVWGIKQLQARVLA (6351)
89.6
VSFQPIPIHYCVPAGFAILK
PCTNVSTVQCTHGIRPVVST (4721,4724)
ITLQCRIKQIINMWQKVGKA (4741)
LLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQNMLQLTVWGIKQLQARVLA
(4754,4756)
92RW020_A
SF162
CPKVSFEPIPIHYCAPAGF (7459,7460)
VQCTHGIRPVVSTQL (7469)
VQQQNNLLRAIEAQQ LLQLTVWGIKQLQAR (7544,7548)
MN
TVQCTHGIRPVVSTQ(6271)
RKRIHIGPGRAFYTT(6286)
VPVWKEATTTLFCAS(6219)
89.6
PCTNVSTVQCTHGIRPVVST(4724)
JRFL_B
GVPVWREATTTLFCASDAKAYDTEVHNVWATHACVPTDPN(4704,4706
)
RPNNNTRRRLSIGPGRAFYARRNIIGDIRQ(4730,4731)
SF162
VQCTHGIRPVVSTQL (7469)
CPKVSFEPIPIHYCA(7459)
KSIPIGPGKAFYATGDIIG(7484,7485)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
MN
IVQQQNNLLRAIEAQ(6346)
89.6
YDTEVHNVWATHACVPTDPN(4706)
LLLSGIVQQQNNLLRAIEAQ(4754)
96ZM651_C
SF162
DTEVHNVWATHACVP(7423)
VQQQNNLLRAIEAQQ(7544)
MN
RKRIHIGPGRAFYTT(6286)
IVQQQNNLLRAIEAQ(6346)
92RW020_A
ACPKISFEPIPIHYC(6261)
TVQCTHGIRPVVSTQ(6271)
89.6
JRFL_B
YDTEVHNVWATHACVPTDPN(4706)
PCTNVSTVQCTHGIRPVVST(4724)
RPNNNTRRRLSIGPGRAFYARRNIIGDIRQ(4730,4731)
LLLSGIVQQQNNLLRAIEAQ(4754)
SF162
VQQQNNLLRAIEAQQ(7544)
CPKVSFEPIPIHYCAPAGF(7459,7460)
VQCTHGIRPVVSTQL(7469)
96ZM651_C
MN
IVQQQNNLLRAIEAQ(6346)
DTEVHNVWATQACVP(6224)
89.6
CON6
LLLSGIVQQQNNLLRAIEAQQNMLQLTVWGIKQLQARVLA
(4754,4756)
YDTEVHNVWATHACVPTDPN(4706)
VSFQPIPIHYCVPAGFAILK(4721)
SF162
DTEVHNVWATHACVP(7423)
CPKVSFEPIPIHYCAPAGF(7459,7460)
VQQQNNLLRAIEAQQ(7544)
B C57BL/6
Immunogen
Peptide
C4
C5
C2
C6
C7
C8
MN
ISFEPIPIHYCAPAGFAILKCND(6262,6263,6264)
NIIGTIRQAHCNISRAKWN(6290)
89.6
Deleted
TSVITQACPKVSFQPIPIHYCVPAGFAILK(4720,4721)
RRNIIGDIRQAHCNISRAKW(4732)
92RW020_A
SF162
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
ITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7458,7459,7460,7461)
DTEVHNVWATQACVP(6224)
MN
ISFEPIPIHYCAPAGFAILKCND(6262,6263,6264)
NIIGTIRQAHCNISR(6290)
CTTTVPWNASWSNKS(6360)
89.6
YDTEVHNVWATHACVPTDPN(4706)
RRNIIGDIRQAHCNISRAKW(4732)
ICTTSVPWNVSWSNKSVDDI(4760)
JRFL_B
VSFQPIPIHYCVPAGFAILK(4721)
SF162
DTEVHNVWATHACVP(7423)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
CTTAVPWNASWSNKSLDQI(7558,7559)
CPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7459,7460,7461)
MN
PIPIHYCAPAGFAIL(6263)
NIIGTIRQAHCNISRAKWN(6290)
89.6
YDTEVHNVWATHACVPTDPN(4706)
RRNIIGDIRQAHCNISRAKW(4732)
96ZM651_C
TSVITQACPKVSFQPIPIHY (4720)
SF162
ITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7458,7461)
DTEVHNVWATHACVP(7423)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
MN
ISFEPIPIHYCAPAGFAIL(6262,6263)
NIIGTIRQAHCNISRAKWN(6290,6291)
CTTTVPWNASWSNKS(6360)
92RW020_A
89.6
YDTEVHNVWATHACVPTDPN(4706)
RRNIIGDIRQAHCNISRAKW(4732)
ICTTSVPWNVSWSNKSVDDI(4760)
JRFL_B
SF162
DTEVHNVWATHACVP(7423)
CTTAVPWNASWSNKSLDQI(7558,7559)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
ITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7459,7460,7461)
96ZM651_C
MN
ISFEPIPIHYCAPAGFAILKCND(6262,6263,6264)
NIIGTIRQAHCNISR(6290)
CTTTVPWNASWSNKS(6360)
DTEVHNVWATQACVP(6224)
89.6
CON6
YDTEVHNVWATHACVPTDPN(4706)
RRNIIGDIRQAHCNISRAKW(4732)
GEFFYCNTAQLFNSTWNVAG(4738)
ICTTSVPWNVSWSNKSVDDI(4760)
TSVITQACPKVSFQPIPIHY(4720)
SF162
DTEVHNVWATHACVP(7423)
IIGDIRQAHCNISGE(7488)
CTTAVPWNASWSNKSLDQI(7558,7559)
ITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILK(7458,7459,7460,7461)
C C3H-NeJ
Immunogen
Peptide
H1
H2
H3
H4
H5
H6
H7
MN
EDIISLWDQSLKPCV(6235)
HMLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQQLLG(6350,6351,6353,635
4)
89.6
92RW020_A
QNMLRLTVWGIKQLQARVLALERYLRDQQL(4756,4757)
SF162
LLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7548,7549,7551)
MN
EDIISLWDQSLKPCV(6235)
QNNLLRAIEAQQHMLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(6347,6350,
6351,6353)
EREIDNYTSLIYSLL(6367)
89.6
PQEVVLGNVTENFNMWKNNM(4708)
JRFL_B
QNMLRLTVWGIKQLQARVLAL (4756)
SF162
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
NNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQARVLAV(7545,7548,7549)
MN
EDIISLWDQSLKPCV(6235)
HMLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQQLLG(6350,6351,6353,635
4)
89.6
PQEVVLGNVTENFNMWKNNM(4708)
QNMLRLTVWGIKQLQARVLALERYLRDQQL(4756,4757)
96ZM651_C
SF162
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
LLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7548,7549,7551)
MN
EDIISLWDQSLKPCV(6235)
QNNLLRAIEAQQHMLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQQLLG(6347,6
350,6351,6353,6354)
EREIDNYTSLIYSLL(6367)
92RW020_A
89.6
PQEVVLGNVTENFNMWKNNM(4708)
QNMLRLTVWGIKQLQARVLALERYLRDQQL(4756,4757)
JRFL_B
SF162
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
NNLLRAIEAQQHLLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7545,7548,7
549,7551)
96ZM651_C
MN
EDIISLWDQSLKPCV(6235)
HMLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQQLLG(6350,6351,6353,635
4)
89.6
PQEVVLGNVTENFNMWKNNM(4708)
CON6
QNMLRLTVWGIKQLQARVLALERYLRDQQL(4756,4757)
SF162
VLENVTENFNMWKNNMVEQ(7429,7430)
SLTLTVQARQLLSGI(7540)
LLQLTVWGIKQLQARVLAVERYLKDQ(7548,7549,7551)
3
Weaver et al. supplemental Table 1