Les champignons microscopiques et les infections qu'ils provoquent

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Les champignons microscopiques et les infections
qu'ils provoquent

• Françoise Dromer,
• Mycologie Moléculaire, CNRS FRE2849
• CNR Mycologie et Antifongiques, Institut Pasteur

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Les champignons

• Organisme eucaryote
• Règne à part
• Développement par filaments ramifiés (thalle)
  parfois unicellulaire (levure)
• Aérobie stricte
• Reproduction asexuée ou sexuée

Peu de champignons pathogènes chez les mammifères
non immunodéprimés 100 000 espèces de
champignons 150 pathogènes chez l'homme
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Diversité des sources d'infection

• Source exogène ENVIRONNEMENT
• Prévalence élevée de l'infection dans les zones
  endémiques (AC)
• Incidence faible de la maladie sauf
  immunodépression ou inoculum massif
• Transmission dans les piscines, saunas, salles de
  bain
• Source endogène TUBE DIGESTIF, PEAU
• Incidence faible sauf rupture des barrières
  naturelles (KT, prothèses, chimiothérapie),
• déséquilibre de lécologie microbienne
  (antibiotiques)
• Immunodépression
• Infections nosocomiales

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Diversité des facteurs prédisposants aux
infections fongiques systémiques
Réanimation Chirurgie
Neutropénie
Cardiaque Rénale
VIH
Pulmonaire Hépatique
Mycoses systémiques
Transplantation
Corticoïdes
N-nés
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Diversité des infections produites
infections superficielles
infections profondes
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Diversité par le type de champignon responsable
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La malédiction des Pharaons
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Les champignons responsables en partie de
l'extinction des dinosaures ???

• Ere tertiaire
• Déforestation globale
• Prolifération des spores fongiques (fonction de
  dégradation)
• Aérosols massifs
• Survie des mammifères (sang chaud)
• Disparition des dinosaures (sang froid) ???

Arturo Casadevall "fungal virulence, vertebrate
endothermy, and dinosaur extinction is there a
connection?" in Fungal Genetics and Biology 2004
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Quelques chiffres

• Septicémies à levures
• 27 hôpitaux en Ile de France
• gt 1400 épisodes en 3 ans
• 37 de décès à J30
• Cryptococcose
• 2-30 des patients SIDA (Afrique Sud est
  asiatique)
• 100 décès sans traitement
• 20 avec traitement

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Les champignons que l'on connaît

• Les champignons utiles dans lagro-alimentaire et
  en médecine
• Fromages Penicillium camembertii Geotrichum
  candidum Saccharomyces cerevisiae
• Pénicilline Penicillium notatum
• Cyclosporine Trichoderma polysporum
• Les champignons néfastes par les toxines
  aflatoxine

http//www.mycolog.com/fungi.htm
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Pourquoi les mycoses sont-elles rares malgré la
fréquence des spores fongiques dans
l'environnement ?

• Température corporelle gt température de
  croissance optimale de la plupart des champignons
• Ex souris / lapin et C. neoformans
• Traits de virulence rarement combinés capsule,
  mélanine, filamentation, thermotolérance C.
  neoformans vs Cryptococcus sp.
• Pression de sélection par les prédateurs de
  l'environnement permet la survie chez l'hôte
  "animal"
• Ex champignons de l'environnement et amibes du
  sol
• Défenses immunitaires de l'homme probablement
  adaptées
• Mais

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Les apprentis sorciers ?

• Apparition / création de nouveaux facteurs de
  risque
• Infection par le VIH CAOP, cryptococcose,
  histoplasmose, aspergillose
• Chirurgie lourde, transplantation dorganes
• Traitement antibiotiques déséquilibre des
  écosystèmes digestifs
• Les voyages mycoses dimportation en métropole
• Un constat, les hommes sont plus susceptibles aux
  infections fongiques
• Hormones ?
• Mode de vie ?
• Susceptibilité génétique

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Les apprentis sorciers ?

• Mycoses des muqueuses liées à lutilisation
  dantibiotique
• Candidose du TD, muguet, vaginite
• Déséquilibre écosystèmes
• Emergence de nouveaux champignons pathogènes
  résistants à certains antifongiques
• gt découverte de la résistance aux antifongiques
  
• Pas d'échange génétique
• Rôle des biofilms
• Etude des mécanismes de résistance

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La mycologie n'est plus poussiéreuse !Les outils
moléculaires sont disponibles

• Génomes de x champignons pathogènes séquencés
• Nombreuses découvertes importantes
• Analyse des marqueurs de virulence, nouveaux
  modèles drosophiles, nématodes, amibes
• Voies de biosynthèse gt antifongiques nouveaux
• Identification des antigènes de surface gt
  tests diagnostiques
• Identification de nombreux mécanismes
  immunitaires
• Identification de protéines inconnues chez les
  eucaryotes supérieurs

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Variabilité antigénique au cours de l'infection
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L'enjeu principal une amélioration du pronostic
des mycoses invasives

• Des tests de diagnostic plus performants
• Des antifongiques plus efficaces
• La mise au point de vaccins,
• L'utilisation de thérapies immunomodulatrices ?
• gt Un intérêt plus grand de la communauté
  scientifique, médicale et des pouvoirs publics