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DENV-1, DENV-3 et DENV-4 chez les animaux apparent es des anciennes souches d'origine asiatique. 2 souches distinctes de DENV-2 d tect es chez les mammif res ... – PowerPoint PPT presentation

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Title: Prsentation PowerPoint


1
Rôle de la faune sauvage dans la circulation de
la dengue en Guyane réservoirs ou hôtes
accidentels? B. de Thoisy 1, V. Lacoste 1, A.
Germain 1, S. Matheus 1, P. Dussart 1, X.
Deparis 2 A. Lavergne 1 1. Institut Pasteur
de la Guyane / 2. IMTSSA France.
2
Introduction
  • Dengue Un problème de santé publique majeur
    dans les zones tropicales
  • En Amérique du Sud 3 000 000 cas enregistrés
    entre 2000 et 2005
  • En Guyane
  • Circulation des 4 sérotypes depuis les années
    1940
  • 2006 16 200 cas et 4 cas mortels
  • Emergence dans des zones où elle en était
  • auparavant absente
  • Augmentation de lincidence liée à
  • urbanisation peu ou mal gérée
  • arrêt des programmes déradications des vecteurs
  • mouvements des populations humaines
  • Augmentation des contacts entre
  • populations, environnement et animaux?

3
Introduction
Epidémiologie et relations (reconnues) avec
lenvironnement
  • Ancien Monde 2 cycles
  • cycle urbain Homme-Moustique-Homme
  • cycle selvatique impliquant des singes, mais les
    souches circulant chez ces animaux sont peu
    impliquées dans les épidémies humaines
  • ? Interactions limitées entre les 2 cycles
  • Nouveau Monde
  • Homme unique réservoir
  • Pas de cycle selvatique / animal reconnu
  • sérologies positives (SN) chez les
    chauves-souris et dautres petits mammifères
    terrestres (Equateur, Costa Rica, Mexique,
    Guyane)
  • rôle des espèces sauvages peut être évoqué

4
Sites de capture
1
2
  • 1. Zone périurbaine ? forêt secondaire où la
    dengue est endémique
  • 2. Front pionnier où la dengue na pas encore
    émergé

5
Echantillonnage analyses
  • Site 1 Mars 2001, Mai et Octobre 2005, 2006 et
    2007
  • Site 2 Novembre 2006, Juin et Novembre 2007
  • Espèces cibles marsupiaux, rongeurs et
    chauves-souris. 616 animaux capturés
  • ARN extraits à partir de 560 sérums et 569 foies
  • Détection de lARN viral par RT-PCR
  • Amplification de C/prM
  • Séquençage du fragment C/prM (424-462bp)
  • Animaux
  • Humains (CNR des Arbovirus et Virus Influenza,
    Institut Pasteur de la Guyane)

6
Distribution des sérotypes sur le Site 1
  • Camp du tigre 7257 nuits/pièges entre mars
    2001 et novembre 2007.
  • 418 mammifères terrestres sauvages (rongeurs et
    marsupiaux) et 125 chauves-souris.
  • 16 (87/543) des animaux infectés par DENV
    (Chiroptères 4, Rongeurs 5
  • and Marsupiaux 7).
  • DENV-1 41,4 (36/87)
  • DENV-2 19,5 (17/87)
  • DENV-3 33,3 (29/87)
  • DENV-4 5,7 (5/87)

Circulation des 4 sérotypes chez les animaux
7
Distribution des sérotypes sur le Site 2
  • Saint Georges 2822 nuits/pièges entre novembre
    2006 et 2007
  • 46 mammifères terrestres sauvages (rongeurs et
    marsupiaux) et 27chauves-souris.
  • 6,8 (5/73) des animaux représentant une seule
    espèce de rongeurs (Proechimys cuvieri) positifs.
  • DENV-3 4 (3/73)
  • DENV-4 3 (2/73)

8
Distribution des différents sérotypes de dengue
circulant chez lhomme et les animaux
D1 D2 D3 D4
D3
D1 D2
D1 D2 D3
Data from The CNR des Arbovirus, IPG
Pour les 2 sites pas de corrélation entre les
sérotypes circulant chez lhomme et ceux
circulant chez les animaux à des périodes
contemporaines
9
Analyse phylogénétique DENV-1
Rattaché à une souche décrite au Japon en 1943
10
Analyse phylogénétique DENV-2
  • 2 souches distinctes
  • apparenté au groupe Native American
  • apparenté à celles circulant chez lhomme en
    Guyane

Homme
11
Analyse phylogénétique DENV-3
DENV-3 rattachée à une souche isolée aux
Philippines en 1956 Brésil 2002 ? génotype V.
Homme
12
Analyse phylogénétique DENV-4
Souche DENV-4 trouvée chez les animaux et
apparentée à une souche isolée au Pérou en 2001,
au Brésil en 2005 et à une souche isolée aux
Philippines en 1956.
Homme
13
Diversité des souches virales
  • Souches de DENV-1, DENV-3, DENV-4 circulant chez
    les mammifères différentes de celles circulant
    chez lhomme à des périodes contemporaines
  • DENV-1, DENV-3 et DENV-4 chez les animaux ?
    apparentées à des anciennes souches dorigine
    asiatique
  • 2 souches distinctes de DENV-2 détectées chez les
    mammifères
  • Une apparentée au groupe Native American
  • Une autre apparentée aux souches circulant chez
    lhomme en Guyane

14
Hypothèse 2 types de circulations?
  • Un cycle urbain ? infections des animaux à partir
    de souches humaines (DENV-2)

Aedes
Mammifères
Homme
Autres ?
?
épidèmies
15
Hypothèse 2 types de circulations?
  • Un possible cycle enzootique impliquant des
    mammifères sauvages avec des souches retrouvées
    périodiquement chez les animaux et
    occasionnellement retrouvées chez lHomme
    (Brésil, Colombie, Pérou).

?
vecteurs ?
Mammifères
Homme
Aedes ?
?
16
Diversité des Hôtes
Rôle des mammifères dans lémergence
Conjonction de concepts (1) épidémiologique et
(2) écologique
Pas despèces de mammifères préférentiellement
infectées
17
Conclusions
  • Après les résultats de sérologie et
    damplification, les séquences de DENV obtenues
    sont les premières à être décrites dans le
    Nouveau Monde
  • Les animaux peuvent être infectés par des souches
    circulant chez lhomme à des périodes
    contemporaines
  • Caractérisation des souches qui sont pour chaque
    sérotype, proches des séquences prototypes

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Conclusions ... Plus de questions que de réponses
  • Quelle est lorigine des souches ?
  • Absence dévolution ?
  • Les mammifères sont infectés, mais peuvent-ils
    répliquer le virus ?
  • Si oui, les vecteurs peuvent-ils sinfecter ?
  • Diversité des vecteurs? efficacité ?
  • Et leur rôle dans lémergence ?

Cette étude est cofinancée par lUnion
européenne. LEurope sengage en Guyane avec le
Fonds Européen pour le développement régionale.
FEDER  ViRUSES  cofinancé par lInstitut
Pasteur de la Guyane
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