Prsentation PowerPoint

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Epidémiologie et variabilité génétique des virus
HTLV-1 et HHV-8 dans larchipel du Vanuatu
Contribution à létude des migrations humaines
en Mélanésie
Olivier CASSAR Unité Epidémiologie
Physiopathologie des Virus Oncogènes Institut
Pasteur - Paris Laboratoire dEpidémiologie
Moléculaire Institut Pasteur de
Nouvelle-Calédonie - Nouméa
Vendredi 18 septembre 2009, Marseille, Le Pharo
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Epidémiologie descriptive et moléculaire de
lHTLV-1 Human T-cell Lymphotropic Virus type-1

• Rétrovirus, 15 à 20 millions dindividus
  infectés
• Pathogénicité Leucémie à cellule T de
  ladulte (ATL) et Paraparésie spastique tropicale
  (TSP/HAM)
• 3 modes de transmission connus Sexuel,
  Mère-Enfant (allaitement gt 6 mois), Sanguin
• 5 principaux sous-types moléculaires (A-E), C
  retrouvé uniquement en Mélanésie

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Epidémiologie descriptive et moléculaire de
lHTLV-1 (Human T-cell Lymphotropic Virus type 1)
Stabilité génétique du génome viral ?
Utilisation de la faible variabilité génétique de
lHTLV-1 in vivo comme un outil moléculaire pour
mieux comprendre la transmission virale et les
mouvements de populations anciennes infectées
Aucune donnée fiable connue concernant la
prévalence de lHTLV-1 au Vanuatu
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Cadre des recherches Archipel du Vanuatu en
Mélanésie

• 1500 Km à l'Est de l'Australie
• 83 îles 6 Provinces
• - 215 541 hab. (est. 2006)
• - 41 lt 15 ans
• - Esp. Vie ? 60.28 ? 63.21 ans
• - Population 98 Mélanésienne

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HTLV-1 Travaux

• Mise en place dun réseau de collaborations
  IPNC / OMS / MOH Vanuatu / IPP
• Autorisation comité déthique (Vanuatu)
• 10 missions de terrain (avril 2003 - août 2005)
  4 500 individus inclus soit 2 Pop. totale
• Fiches de renseignements épidémiologiques,
  généalogies

• Analyse descriptive Déterminants
  épidémiologiques de linfection par HTLV-1 ?
• Dépistage (MT2/C19) et confirmation
  (Western blot) sérologique
• ? Séroprévalence 0,62 chez les Ni-Vanuatu
• ? Facteurs de risque associés à la
  séropositivité âge
• Etude autour des cas index
• ? Transmission virale intrafamiliale active

Cassar et al., Emerg. Inf. Dis., 2005 Cassar et
al., J. Inf. Dis., 2007
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HTLV-1 Travaux
Epidémiologie moléculaire A quel sous-type
appartiennent les virus du Vanuatu ?

• Séquençage portion gène Env (? 600pb)
• Souches HTLV-1 du sous-type C Mélanésien
• Proximité phylogénétiques et origine commune
  avec souches des Îles Salomon

Quand les souches du Vanuatu et des Salomon
ont-elles divergé ?

• Séquençage gène Env (? 1700pb)
• Souches HTLV-1 du sous-type C Mélanésien
• Proximité phylogénétique et origine commune avec
  souches des Îles Salomon
• Emergence à partir dun ancêtre commun estimée
  à 10.000 ans

Cassar et al., J. Inf. Dis., 2007
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HHV-8 (Human HerpesVirus 8) Contexte

• 4 îles Efate, Pentecôte, Santo, Anatyum
• 255 Individus testés (159 Hommes et 96 Femmes)
• Dépistage sérologique (ELISA IFI) Þ
  Séroprévalence nulle

Quelle est la séroprévalence de lHHV-8 dans
lensemble de larchipel du Vanuatu ?
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HHV-8 (Human HerpesVirus 8) Travaux

• Gamma herpesvirus (Epstein-Barr Virus)
• Pathogénicité Sarcome de Kaposi et maladies
  lymphoprolifératives rares
• Transmission par la salive (Mère-Enfants, entre
  enfants)
• 5 sous-types moléculaires liés à lorigine
  géographique
• A et C Europe de lOuest et du Nord, pays
  Méditerranéens
• B Afrique
• D Îles du Pacifique et Japon
• E Amérindiens

• Analyse descriptive Déterminants
  épidémiologiques de linfection par HHV-8 ?
• Travail à partir de la collection déchantillons
  de lenquête HTLV-1
• Dépistage sérologique (BC3) individus 65 ans
• Séroprévalence 45,2 chez les Ni-Vanuatu
• Séropositivité augmente avec lâge
• 50 des individus infectés à partir de 70 ans
• Cassar et al., Emerg. Inf. Dis., 2007

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HHV-8 Travaux

• Analyse moléculaire A quel sous-type
  appartiennent les virus du Vanuatu ?
• Séquençage portion du gène K1 (600pb)
• Souches HHV-8 du sous-type D

Les 30 souches appartiennent au sous-type D
Pacifique et se répartissent en 3 groupes 1)
23 souches provenant des îles du Centre et du
Sud de larchipel Polynésie 2) 4 souches de
lîle de Loh, Nord de larchipel Taïwan 3)
3 souches de Motalava Australie
Introduction probable au cours de différentes
vagues de migration de populations infectées
Cassar et al., Emerg. Inf. Dis., 2007
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Conclusion générale

• Présence des virus HTLV-1 et HHV-8 de façon
  endémique dans lensemble de larchipel du
  Vanuatu avec illustration de la persistance du
  virus au sein des familles
• Mise en évidence de variants moléculaires du
  sous-type C  Mélanésien  pour lHTLV-1, proches
  des variants présents dans larchipel des Salomon
  
• Présence dune grande diversité de souches HHV-8
  de sous-type D  Pacifique  suggérant de
  multiples origines

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Perspectives (1) Origine du peuplement du
Vanuatu ?

• Associer à lhistoire évolutive des virus, des
  données de génétique humaine en associant
  virologues et généticiens (Collaboration EPVO
  avec UP Génétique Humaine Evolutive)
• - Accroître le nombre de souches virales
  humaines dune part au Vanuatu et dautre part
  dans dautres territoires de lOcéanie
  Nouvelle-Calédonie, Wallis et Futuna, Australie,
  îles Fidji
• - Séquençage de la région hypervariable de
  lADNmt (HSV-I) et génotypage de 25 régions
  informatives (SNPs) définissant les principaux
  haplogroupes mitochondriaux

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Perspectives (2) Origine du peuplement du
Vanuatu ?
800 individus testés
40,2 P et Q Origine ancienne de Papouasie
Nouvelle-Guinée B Signature austronésienne plus
récente en provenance de Taïwan (Culture
Lapita) M Très fréquent en Asie (Inde, Chine)
Hétérogénéité des différents haplogroupes selon
les îles, doù la nécessité détudier également
le chromosome Y afin de confronter les origines
paternelle et maternelle des populations
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Collaborations
Institut Pasteur à Paris Unité EPVO Sylviane
Bassot Renan Duprez Philippe Afonso Antoine
Gessain Unité Postulante de Génétique
Humaine Hélène Quach Christine Harmant Lluis
Quintana-Murci Unité de Recherche et dExpertise
en Histotechnologie et Pathologie Michel
Huerre Grégory Jouvion
Nouvelle-Calédonie Institut Pasteur Françoise
Charavay Sonia Treptow Francine Baumann Yannick
Rougier Eliane Chungue Paul M.V. Martin Service
de Transfusion Sanguine Frédéric Touzain
Vanuatu Ministère de la Santé Mathurine Tary Rose
Bahor Yvannah Taga Myriam Abel WHO/OMS Angela
Williams Corinne Capuano Vanuatu Family Health
Association Hélène Walter Woreka Mera Blandine
Boulekone Marie Nickllum-Wama
INSERM Génétique Humaine des Maladies
Infectieuses Sabine Plancoulaine