EndNote X1 : Gestion bibliographique et publication

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EndNote X1 Gestion bibliographique et
publication

• à quoi ça sert créer une collection de
  références bibliographiques personnelles,
  contenant tous les types de documents (articles
  de journaux, livres, etc.)
• commencer par introduire les références
  bibliographiques, manuellement ou mieux, se
  connecter à ou importer depuis les bases de
  données (Web of Science, SciFinder, PubMed,
  GoogleScholar, etc.)
• effectuer dans EndNotetrier, dé-dupliquer,
  éditer et compléter les références (p.ex. ajout
  fichier.pdf) préparer des sous-listes
  thématiques pour vos prochaines
  publicationsformater les références selon le
  style du journal où vous allez publier
• écrire votre publication dans Word en
  introduisant vos référencesexporter des listes
  de références entières pour vos publications ou
  citer les références directement lorsque vous
  écrivez dans Word

Francine Dreier (2008)Université de Genève
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Démarrer avec EndNote

• soit travailler sur les PC de la bibliothèque de
  Sciences II où EndNote X1 est installé,
• soit acquérir puis installer le programme (il
  faut avoir une adresse mail ltunige.chgt)
• Division informatique http//www.unige.ch/dinf/pa
  pat/outils.html ? GDLPlatform des logiciels
  GDL Edition Bibliographie ? EndNote X1Prix
  de EndNote XI ? SFr. 45.- (contre SFr. 399.- c/o
  Scientific Solutions)
• ouvrir EndNote et créer une New Reference Library
  ? exemple test.enl ? un répertoire test.DATA
  est automatiquement généré où se trouveront
  toutes les options de configuration fichiers de
  connexion, filtres dimport, styles et formats de
  journaux, etc.
• voilà, vous êtes prêts pour introduire vos
  référencesbibliographiques, donc pour créer
  votre bibliographiepersonnelle

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La bibliographie (1) constitution

• Pour introduire vos références bibliographiques
  dans EndNote X1, il y a 4 possibilités
• 1. Se connecter directement depuis EndNote (Menu
  Tools Online Search) à une base de données
  bibliographique ? exemples Web of Science SCI
  (ISI), PubMed (NLM) ouà un catalogue de
  Bibliothèque ? exemple RERO_Geneve_XI
• 2. Importer dans EndNote un fichier sauvé
  contenant les références choisies lors dune
  recherche bibliographique ? exemples SciFinder
  Scholar, MathSciNet, GeoRef (save  tagged  Text
  File), en sélectionnant ensuite le filtre
  dimport correspondant à la base de données
  bibliographique (p.ex. Scifinder CAS) ? Menu
  File Import Import Options
• 3. Exporter la(les) référence(s) souvent une à
  une - depuis un site online ? exemples sites
  déditeurs comme Blackwell ou Wiley-InterScience
  (Download Citation)
• 4. Entrer les références manuellement ou
  éditer/modifier des références incomplètes

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La bibliographie (2) exemple / aperçu

• Aperçu de votre bibliographie (exemple résultat
  de lOnline Search rigid-rod AND Matile, S.
• dans Web of Science SCI) après lajout
  automatique des 26 références
• Sélection/affichage dune référence qui est
  montrée dans le style Numbered

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La référence (1) visualisation / édition

• Avec un double-click sur la référence
  sélectionnée (Menu References Edit
  References),
• on passe en mode édition où le contenu des champs
  peut être manuellement modifié/complété
• Attention le format de chaque champ doit être
  respecté (p.ex. Author Nom,initiale.)

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La référence (2) ajouts et liens

• Exemples dajouts typiques Keywords, URL,
  Figure, File Attachments (fichiers.pdf)
• pour afficher les options dun champ, un click
  droit affiche les possibilités
• (ici, File Attachements)
• Attention le lien dun fichier.pdf est par
  défaut relatif ? le fichier se trouvera dans le
  répertoire.DATA (ici, dans Test.DATA qui
  contient les fichiers spécifiques à Test.enl)
• Pour définir un lien absolu (p.ex. un serveur de
  document), il faut décocher loption par
• défaut copy file to the default folder ? Menu
  Edit Preferences URL Links

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Gestion des références (1)

• Personnaliser laffichage de la liste de
  références (choisir quelles colonnes seront
  affichées) ? Menu Edit Preferences
  Display Fields
• Trier vos références dans un ordre de classement
  A-Z / Z-A ou chronologique? Classement
  mono-critère simple click sur len-tête dune
  colonne affichée? Classement multi-critère ?
  Menu References Sort References
• Dé-dupliquer et éliminer les références qui sont
  à double après limport depuis différentes
• bases de données bibliographiques ? Menu
  References Find Duplicates
• Editer globalement toutes ou partie des
  références pour changer ou ajouter une même
• information (exemples un mot-clé, un nom de
  journal, des notes, etc.)
• ? Menu References Change and Move Fields
• Créer des sous-listes de références selon
  certains critères de sélection

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Gestion des références (2)

Quick Search dans votre
bibliographie Création de sous-groupe(s)
Custom, ici beta-barrels ? dans la fenêtre
des références, click droit ? add references to ?
create new Group
exemples références pour une nouvelle
publication, update du dernier mois, etc.
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Formater les références Output Styles

• But Attribuer le style dun journal spécifique
  (ici, celui de Angewandte Chemie) à une liste
  de références pour lexporter déjà formatée vers
  Word

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Exporter des listes de référencescomplètes
depuis EndNote à Word

• Après avoir attribué le style du journal (ici,
  Angewandte Chemie),
• Sélectionner les références qui constitueront
  votre liste de références dans Word
• ? Dans EndNote Menu Edit Copy Formatted
  (ctrl K)
• ? Puis, dans votre document Word
• Menu Edit Paste (ctrl V)

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Editer et modifier les Output Styles

• Exemple Liste des journaux avec les noms
  abrégés Journal Abbréviations 
• 1) configurer un nouveau fichier, donc créer
  une nouvelle bibliographie EndNote et avant
  dintroduire les références, créer et attribuer
  une nouvelle  Journal List  ? Menu Edit
  Preferences Term Lists
• 2) chercher sur le web la dernière liste des
  noms de journaux abrégés chemical_2007.txt
  et la copier dans EndNote X1/Term Lists
• 3) Menu Tools Define Term Lists
  Lists/Journals
• a) Journal Term List
• b) Import List ? chemical_2007.txt ?
• c) Link List / Alternate Journal
• 4) Menu Edit Output Styles ? Journal
  Names / Abbreviation 1

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Structure de la configuration

• Le programme EndNote X1 possède une structure où
  les modèles et listes sont groupés
• par répertoires.
• Attention
• Les fichiers de chaque
• répertoire possèdent une
• extension spécifique.
• BIBLIO (.enl ? .Data)
• Connections (.enz)
• Filters (.enf)
• Styles (.ens)
• Term Lists (.txt)
• Il faut donc ranger une liste

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 Cite while you write  dans Word (1)

• Si EndNote est installé sur votre ordinateur,
  automatiquement une barre doutils
• EndNote saffiche dans Word (sinon lactivation
  se fait par ? Menu Tools EndNote)
• 1 2 3 4 5
  6 7 8 9 10 11
  12 13 14
• En passant lentement avec la souris sur les la
  fonctions 1-14, leur description saffiche.
• Les plus utilisés - activés une à la suite de
  lautre - sont certainement
• 2 Go to EndNote, basculer du document Word en
  rédaction à la bibliographie correspondante dans
  EndNote pour choisir au fur et à mesure la(les)
  référence(s)
• La barre doutil correspondante dans EndNote ?
  Wordpeut être activée ? Menu EndNote Tools -
  Show Toolbar CWYW/Add-in
• 4 Insert Selected citation(s), la(les)
  citation(s) sont insérées dans le texte et les
  références déjà formatées dans EndNote sajoutent
  automatiquement dans la liste des références à la
  fin du document
• 6 Insert Note, p.ex. un renvoi à du
  supplementary material ? fonctionne comme
  linsertion dune citation
• 3 Format Bibliography ? encore en cours
  dédition un autre style de journal peut être
  appliqué
• 13 Configuration générale des préférences CWYW

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 Cite while you write  dans Word (2)

• Exemple
• vous êtes en rédaction de votre texte dans Word ?
  insertion de vos citations
• ? à la fin de votre documentvotre liste de
  référencesest générée au fur et à mesure
  (renumérotée)

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Tips Tricks

• Connexions et Filtres dimport essayez de
  trouver linterface ou le filtre spécifique pour
  votre base de données Exemples ?
  chercher/sauver des documents de Medline (OVID)
  ou PubMed (NLM), ? sélectionner
  le filtre le plus spécifique pour votre catalogue
  de bibliothèque RERO ? RERO_XI ?
  RERO_Geneve_XI ? http//www.unige.ch/biblio/cherch
  er/endnote.html
• Création dun Output Style personnel ? Menu
  Edit Output Style Edit  "Numbered"prendre,
  éditer puis adapter des pages existantes, donc
  déjà correctement formatés (ici, Templates pour
  Reference Types)

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Application pratique

• Apprentissage session pratique pour
  lutilisation de EndNote de ?1h à la salle de
  consultation électronique de la Bibliothèque de
  Sciences II
• Liste dinscription
• travail par petits groupes, si possible de même
  niveau (EndNote basique ou avancé)
• Votre bibliographie EndNote
• exécuter la recherche bibliographique spécifique
  à votre domaine de recherche construction de
  votre propre collection de références
• Questions ?
• Francine.Dreier_at_unige.ch