Documentation M

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Documentation Médicale

• Comment interroger la base de données Pubmed?

Présentation réalisée par CARRON Ludovic,
documentaliste au CIRD de Ouagadougou
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Objectifs

• Consulter la base de donnée Pubmed de façon
  autonome
• Connaître les principes de base de lutilisation
  dun langage documentaire
• Réutilisation de ces principes avec dautres
  bases de données

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Plan de la présentation

• Présentation globale de Pubmed
• Effectuer une recherche par sujet
• Fonctions avancées de Pubmed

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Présentation

• Pubmed est une base de donnée bibliographique
  porté sur les ressources documentaires
  biomédicales.
• Pubmed est un service de lUS National Library of
  Medicine.

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Possibilités de Pubmed

• Recherche par sujet
• Recherche par auteur
• Recherche par périodique
• Pubmed peut aussi permettre daccéder au texte
  intégral de larticle.

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Visite rapide de linterface
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Effectuer une recherche par sujet

• Exemple de recherche
• Je recherche des informations sur la prévention
  du paludisme par les vitamines ou par les
  antibiotiques.
• Mots-clefs prevention paludisme vitamine
  antibiotique

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Langues et langages documentaires

• Pubmed est une base de donnée américaine. Il
  convient de traduire en langue anglaise les
  termes employés pour notre recherche.
• Pour cela, ce site peut être utile
• http//terminologiecismef.chu-rouen.fr/

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Première équation de recherche dans Pubmed

• Malaria AND Prevention AND (Vitamins OR
  Anti-Bacterial Agents)
• 391 résultats de recherche à léquation.

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Utilisation du Thésaurus de Pubmed, le MeSh

• Le MeSh permet dutiliser une liste organisée de
  termes, qui sont unifiés et organisés
  hiérarchiquement.
• Pour trouver un terme du MeSH, il suffit de
  sélectionner la base de donnée MeSh et dy entrer
  le terme recherché. Exemple de  vitamins 

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Hierarchisation des termes dans le MeSH
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Vers une nouvelle équation de recherche

• Paludism gt malaria
• Prevention gt Prevention and control (à ajouter
  en tant que sous sujet du terme  malaria )
• Vitamins gt vitamins
• Anti-Bacterial Agents

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Equation de recherche

• "Malaria/prevention and control"Mesh AND
  ("Vitamins"Mesh OR "Anti-Bacterial
  Agents"Mesh)
• 54 résultats trouvés

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Opérateurs

• mh mesh , descripteur meSH
• majr , descripteur meSH qui est thème principal
  du document
• mhnoexp , descripteur meSH qui ne prend pas en
  compte les spécifiques du descripteur
• majrnoexp , descripteur meSH thème principal
  du document , ne prend pas en compte les
  spécifiques du descripteur

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Equation de recherche

• On souhaite que Malaria/prevention and control
  soit thème principal des articles recherchés.
• "Malaria/prevention and control"Majr AND
  ("Vitamins"Mesh OR "Anti-Bacterial
  Agents"Mesh)
• 26 documents trouvés

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Lire la notice dun document

• La notice apporte plusieurs informations.
• Résumé, noms des auteurs, titre de larticle,
  périodique de publication
• Le champs descripteur apporte de linformation
  sur le contenu de larticle, et peut permettre de
  savoir très rapidement sur quoi porte larticle.

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(No Transcript)
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Accès aux documents

• Sélectionnez larticle qui vous intéresse.
• Cliquez sur licône qui apparaît en haut à droite
  de la fenêtre et qui permet daccéder au
  document.
• Les documents qui ne sont pas accessibles peuvent
  être consultés par commande via article_at_inist.

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Exemple daccès au document

• Dans le cas de cet exemple, le document est
  accessible via la base de donnée Science Direct.
• Le périodique concerné est consultable par les
  utilisateurs.
• Lien http//linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii
  /S0306-9877(07)00483-5

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Limitations à la recherche

• On souhaite que les documents trouvés soient
  rédigés en français, ou que ceux-ci soient
  disponible en texte intégral.
• Pour ces otions, il faut utiliser loption
   limits  de Pubmed

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Equation de recherche

• Léquation de recherche reste la même
• Documents en français 2 résultats
• Disponible en texte intégral 5 résultats
• Documents disponible en français ET en texte
  intégral 0 résultat

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Exercice (Application)

• Votre patient, un adolescent alcoolique, souffre
  de malnutrition. Vous désirez vous renseigner
  afin de mieux le soigner. Quelle sera votre
  démarche afin de trouver de linformation à ce
  sujet?
• Effectuez cette même recherche sans utiliser les
  descripteurs MeSh.

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Équation utilisée

• Il sagit ici dune équation possible. Cependant,
  dautres équations de recherche sont possible
  pour répondre à cette question.
• "Malnutrition"Majr AND "Alcoholism"Majr
  (Limits Adolescent 13-18 years)
• 14 résultats

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Recherche dune référence précise

• Il faut utiliser longlet  Single citation
  Matcher , remplir les champs sélectionnés et
  lancer la recherche
• Exemple Trouvez tous les articles de M.Stefanov
  dans le périodique  Folia Medica 

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Sauvegarde dune recherche et veille thématique

• Si un thème ou les travaux dun chercheur qui
  travaille dans le même domaine que vous, vous
  intéresse, il est possible de connaître, via
  votre boîte e-mail, les nouveaux articles publiés
  et indexés dans Pubmed dun auteur.
• Pour cela, il faut sinscrire sur le site de
  Pubmed.

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Sauvegarde dune recherche et veille thématique

• Une fois cette opération effectuée, vous pouvez
  sauvegarder vos recherches.
• Il est possible de recevoir des e-mails vous
  indiquant les nouveaux articles répondants à
  votre équation de recherche.

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Conclusion

• Utiliser les fonctions avancées de Pumed peut
  vous permettre de rechercher de linformation
  pertinente plus aisément.
• Questions, remarques?

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A consulter

• REPERE Ressources Electroniques, Pour les
  Etudiants, la Recherche et lenseignement
• http//issuu.com/elisaformist/docs/repere2008
• Liste (exhaustive) de bases de données en langue
  française en sciences médicales
• http//doccismef.chu-rouen.fr/servlets/Logique?Mot
  base20de20donnees.traff4tri100datt2debut
  0

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A consulter

• Tutorial de Pubmed en langue française
• http//urfist.u-strasbg.fr/supports/bddbi_co/pubme
  d/m1001.html
• Recherche d'informations médicales  sur Internet
• http//www.sfmg.org/Publication/aide_publication/b
  iblio_internet/index.htm

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Merci de votre attention