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Mutazioni dinamiche

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Mutazioni dinamiche Vincenzo Nigro Dipartimento di Patologia Generale Seconda Universit degli Studi di Napoli Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM) – PowerPoint PPT presentation

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Title: Mutazioni dinamiche


1
Mutazioni dinamiche
  • Vincenzo Nigro
  • Dipartimento di Patologia Generale
  • Seconda Università degli Studi di Napoli

Telethon Institute of Genetics and Medicine
(TIGEM)
2
Circa il 2 della popolazione ha un IQlt70
(ritardo mentale) il 15-20 di tutti I ritardi
mentali sono attribuibili a geni del cromosoma
X Il ritardo mentale legato al cromosoma X (XLMR)
è geneticamente eterogeneo con 202 loci
responsabili di forme che si sovrappongono
clinicamente 46 geni sono stati a tuttoggi
identificati il locus che contribuisce alla
frazione maggiore causa la sindrome di
Martin-Bell, oggi nota come sindrome dellX
fragile
3
  • X fragile
  • ritardo mentale IQ tra 20 e 70
  • deficit di memoria a breve termine di
    informazioni complesse
  • ritardo nel linguaggio
  • ridotte abilità visuo-spaziali
  • ipersensibilità agli stimoli
  • iperattività con deficit di attenzione
  • comportamento autistico
  • Macrocefalia con fronte, mento e orecchie
    sporgenti
  • Macroorchidismo (lt30ml) dopo la pubertà
  • Anomalie connettivali prolasso della mitrale,
    lassità articolare, piede piatto
  • Disfunzioni ipotalamiche?

4
(No Transcript)
5
Nel 1969 Lubs osservò una costrizione (marker X)
sul braccio lungo del cromosoma X in quattro
maschi affetti e tre carriers obbligate della
stessa famiglia
6
Il sito fragile a Xq27.3
rottura o costrizione dei cromosomi in metafase
che insorge quando le cellule sono esposte ad una
perturbazione della replicazione del DNA siti
fragili sono su tutti i cromosomi e prendono il
nome della banda cromosomica, es fra(X)(q27.3) la
nomenclatura HUGO chiama questo sito FRAXA, cioè
il primo sito fragile identificato sul cromosoma X
7
Segregazione, paradosso di Sherman
Il 20 dei maschi che portano lallele mutato
sono normali (NTM) Il 30 delle carrier presenta
ritardo mentale
perché non è affetto?
1
perché è affetta?
I
2
4
1
3
II
1
III
5
1
2
3
4
IV
8
Fragile X syndrome
9
(No Transcript)
10
X fragile al microscopio a forza atomica
11
Il gene FMR
12
Zhong et al. Am J Hum Genet 1995
200
CONTROLS
PREMUTATIONS
150
100
50
0
13
CpG island/5 UTR
FMR1 gene
Eag I
EcoRI
EcoRI
probe
2.4kb
2.8kb
Normal alleles Stable in the family and in the
individual Unstable in the population (Polymorphis
m)
(CGG) 6 to 50
Premutation Unstable in the family Stable in
the individual
(CGG) 59 to 200
(CGG) gt 250
Full mutation Unstable in the
individual (somatic mutations) Repress FMR1
transcription
Methylation
14
Fragile X diagnosis Southern blot analysis of
expansion and methylation
Rousseau et al. NEJM 1991
15
Premutazioni e mutazioni
  • Le premutazioni si espandono quando sono
    trasmesse dalla madre
  • La donna con premutazioni ha un maggiore rischio
    di menopausa precoce POF (premature ovarian
    failure)
  • Il più corto allele descritto che in una sola
    generazione è diventato mutazione piena è di 59
    triplette
  • Espansione stabile (CGG)9-AGG-(CGG)9-AGG-(CGG)9
  • Ha almeno 2 A che interrompono la serie di 9
    triplette
  • Espansione instabile (CGG)9-(CGG)9-(CGG)9-
    (CGG)9
  • NON ha A che interrompono la serie

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Il gene FMR1 (fragile X mental retardation 1) è
allinterno di deserto genico quindi il fenotipo
NON è da geni contigui Mutazioni puntiformi o
delezioni di FMR1 causano un fenotipo identico
alle espansioni e questo dimostra che il ruolo
del gene non è importante nelle prime fasi dello
sviluppo, quando le triplette non sono ancora
metilate
17
Trasmissione X fragile
18
cosa fa FMR1?
  • FMRP una RNA-binding protein selettiva associata
    con i poliribosomi ed espressa nei neuroni
  • nelle spine dendritiche regola la traduzione
    degli mRNA, funzione cruciale per la plasticità
    sinaptica e la maturazione neuronale
  • interagisce con gli mRNA e con il pathway dei
    miRNA
  • NellX fragile le spine dendritiche sono immature
    e lunghe

Cerebral Cortex, Vol. 10, No. 10, 1038-1044,
October 2000
19
Spine dendritiche nel neocortex lunghe ed
immature anche nel topo KO
20
Malattie da triplette ripetute
21
Malattie da triplette ripetute non codificanti
22
anticipazione nella distrofia miotonica
23
distrofia miotonica DM1
  • fenomeno miotonico, difficoltà al rilasciamento
    muscolare dopo una contrazione
  • ipotonia al volto, non debolezza importante
  • cataratta precoce
  • alterazioni ritmo cardiaco
  • disfunzione tiroidea
  • trasmissione autosomica dominante (1/8000)
  • forma congenita con grave ipotonia neonatale

24
distrofia miotonica DM1
  • Steinert è la più comune distrofia muscolare
    delladulto
  • è causata da unespansione CTG nel 3UTR del gene
    DMPK (nellRNA CUG) a 19q13.3
  • presenta eredità autosomica dominante con
    anticipazione
  • sono state identificate RNA binding proteins che
    interagiscono con lespansione CUG

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distrofia miotonica DM2
  • cromosoma 3p21
  • unespansione simile nell introne 1 di un repeat
    CCUG nel gene ZNF9 (zinc finger protein 9) causa
    la distrofia miotonica 2
  • la DM2 è detta anche distrofia miotonica
    prossimale

26
Malattie da triplette ripetute di poliglutammina
27
Còrea di Huntington
  • descritta da George Huntington nel 1872, è detta
    anche còrea che in greco indica la danza
  • alla base vi è una degenerazione programmata
    geneticamente dei neuroni dei gangli basali
    (nuclei caudato e pallido) e della corteccia
  • prevalenza di 1/10,000 e presenta il fenomeno
    dell'anticipazione
  • si trasmette nel 97 dei casi come carattere
    autosomico dominante associato al gene
    huntingtina sul cromosoma 4p16.3
  • solo il 3 dei casi è dovuto a nuove mutazioni
  • un'espansione dinamica della tripletta CAG che
    codifica per la glutammina

28
quante glutammine?
  • fino a 28 numero max di CAG per un soggetto non
    a rischio
  • 29 - 39 CAG la malattia si potrebbe presentare
    alla generazione successiva (premutazione)
  • oltre 39 CAG il soggetto è considerato affetto
    anche se la patologia non si è ancora manifestata
  • il test è in grado di prevedere che la patologia
    si manifesterà in futuro
  • l'esecuzione in soggetti sani solleva problemi di
    natura etica

29
  • la Huntingtina con poliglutammina forma aggregati
    nei neuroni causandone la morte
  • all'inizio sintomi psichiatrici quali
    depressione, irritabilità, difficoltà a prendere
    decisioni, poi presenta movimenti incontrollati
    simili a una danza e demenza
  • pur con una grande variabilità individuale, la
    malattia avanza inesorabilmente fino alla morte
  • tentativi terapeutici sono in corso con la
    cistamina che inibisce la transglutaminasi
    coinvolta nella formazione degli aggregati

30
syndactyly of 3rd and 4th fingers of the hands
and 3th and 4th or 4th and 5th finger of
footpolydactyly
31
Synpolydactyly SPD1
  • syndactyly of 3rd and 4th fingers of the hands
    and 4th and 5th finger of foot
  • polydactyly
  • autosomal dominant with 96 penetrance for upper
    limbs and 70 for lower
  • normal subjects have 15 alanines in HOXD13,
    affected 24 alanines (27bp- duplication) at 2q31
  • large deletion (117kb) of HOXD cluster 3 has a
    similar phenotype
  • haploinsufficiency

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Polyalanine stretches (GCG)
  • 494 human proteins contain polyalanine stretches
    that form beta sheets (36 are transcription
    factors)
  • these are resistant to chemical denaturation and
    enymatic degradation
  • above 19 alanines the proteins aggregate and form
    intracellular inclusions
  • dominant disorders of the CNS or skeletal
    malformations

33
proteins involved in polyalanine expansions in
humans
34
Comparative data between polyalanine and
polyglutamine
POLY A POLY Q
normal length 520 444
length polymorphism few numerous
mutant length 1 15 gt 36
meiosis/mitosis stable unstable
gene expression specific ubiquitous
protein function transcription factor various
diseases Congenital malformations Neurodegenerative disorders
35
PHOX2B (paired-like HOX 2B) at 4p12 (20 5/13
Ala)
  • 92 of cases with congenital central
    hypoventilation syndrome (CCHS)
  • abnormal control of ventilation during sleep
  • megacolon
  • strabismus with schizofrenia
  • mutations predispose to neuroblastoma
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