Cartografiar el terreno cientfico y tecnolgico

1
Reunión Conjunta de Editores Científicos de
Ciencias de la Salud y Ciencias Sociales

• Cartografiar el terreno científico y tecnológico
• Nuevas herramientas para la extracción de
  información a partir de las publicaciones
  científicas
• Rodolfo Barrere

2
Millones de artículos científicos

• En 1963, Derek de Solla Price afirmaba que
• el total de revistas científicas fundadas hasta
  ahora en todo el mundo es de unas 50.000, de la
  cuales unas 30.000 se siguen publicando. Han
  aparecido en ellas, en torno a seis millones de
  artículos, con un aumento aproximado de medio
  millón anual.
• El tiempo de duplicación de tal volumen de
  publicaciones -estimaba- es de unos quince años,
  lo que proyectado en el tiempo da lugar a cifras
  de una sobreabundancia escasamente manejable.

3
Un recurso o un problema?

• Esta enorme masa informativa, que además se
  expande de un modo exponencial,
• Es un proceso aleatorio o responde a ciertas
  tendencias estables?
• Es un recurso informativo que puede ser
  explotado, o es un laberinto impenetrable?
• Cómo manejarse en semejante cúmulo de
  información?

4
La calidad del recursoLas revistas como archivo
de la ciencia

• Las publicaciones científicas se han convertido
  en el archivo de la ciencia.
• Publicar en un sistema que garantiza, mediante
  evaluaciones de pares, la calidad de los
  artículos es un rasgo esencial del quehacer de
  los científicos.
• Legitimar el contenido de los artículos mediante
  su evaluación por revisores institucionalmente
  designados y manifiestamente competentes.
• Difundir los conocimientos y ponerlos al alcance
  de la comunidad científica para su contrastación
  y verificación.
• Premia al investigador con el reconocimiento de
  los pares.

5
Un canal de información seguro para la ciencia

• El universo de las publicaciones científicas
  puede ser visto como un canal seguro de la
  ciencia de calidad, garantizado por la evaluación
  de pares.
• Se garantiza en cada trabajo
• Originalidad
• Interés científico
• La información contenida en las revistas
  científicas es una muestra válida de la
  producción de conocimiento científico
• Se publica todo lo posible (publish or perish)
• Sólo se publica el material de calidad
  (evaluación de pares)

6
El impacto de las TIC

• Los sistemas de información dan lugar a
  gigantescas bases de datos que sólo pueden ser
  explotados con técnicas adecuadas.
• El Science Citation Index, la base de datos más
  reconocida, recoge artículos de 6,771 revistas.
• Esto equivale a una masa de más de 10 millones
  de artículos publicados desde 1965.
• En SCOPUS, que es la base más numerosa, se
  recogen 14,671 publicaciones.
• Esto representa una masa de más de 33 millones
  de artículos, con representatividad estadísticas
  desde 1969.

7
Recurso informativo o laberinto impenetrable?
Recorrer cada uno requiere capacidades específicas
8
El soporte informático

• IES DIVERSITY EC, P203 MODIGH M, 2002, AQUAT
  MICROB ECOL, V28, P299 PIERCE RW, 1992, REV
  AQUAT SCI, V6, P139 PIERCE RW, 1993, MAR
  ECOL-PROG SER, V94, P11 PIERCE RW, 1994, MAR
  ECOL-PROG SER, V112, P235 PODESTA GP, 1997,
  ANTECEDENTES HIST EX, V1, P195 PROVOST C, 1996,
  CONT SHELF RES, V16, P215 ROBERTSON JR, 1983,
  ESTUAR COAST SHELF S, V16, P27 ROSENZWEIG ML,
  1995, SPECIES DIVERSITY SP ROY K, 1998, P NATL
  ACAD SCI USA, V95, P3699 ROY K, 2000, P ROY SOC
  LOND B BIO, V267, P293 RUTHERFORD S, 1999,
  NATURE, V400, P749 SHANNON CE, 1949, MATH THEORY
  COMMUNIC SOUTO S, 1970, PHYSIS A, V30, P187
  SOUTO S, 1972, PHYSIS A, V31, P45 SOUTO S, 1973,
  PHYSIS, V32, P249 SOUTO S, 1979, THESIS U BUENOS
  AIRE SOUTO S, 1981, ATLAS ZOOPLANCTON AT, P353
  STOECKER DK, 1985, J PLANKTON RES, V7, P85
  THOMPSON GA, 1999, J PLANKTON RES, V21, P1265
  THOMPSON GA, 2001, MAR ECOL-P S Z N I, V22, P343
  THOMPSON GA, 2001, THESIS U BUENOS AIRE VERITY
  PG, 1985, LIMNOL OCEANOGR, V30, P1268 WHITE WB,
  1996, NATURE, V380, P699 WITTER DL, 1999, J
  GEOPHYS RES-OCEANS, V104, P20927 ZAR JH, 1999,
  BIOSTATISTICAL ANAL','62',0,'INTER-RESEARCH','OLDE
  NDORF LUHE','NORDBUNTE 23, D-21385 OLDENDORF
  LUHE, GERMANY','0948-3055','AQUAT MICROB
  ECOL','Aquat. Microb. Ecol.','APR
  1','2004','35','1','','','','93','103','','11','EC
  OLOGY MARINE FRESHWATER BIOLOGY','815DL','ISI0
  00221022900008'),('2004','J','Finocchiaro, LME
  Bumaschny, VF Karara, AL Fiszman, GL Casais,
  CC Glikin, GC','','Herpes simplex virus
  thymidine kinase/ganciclovir system in
  multicellular tumor spheroids','CANCER GENE
  THERAPY','','English','Article','suicide gene
  therapy lipofection murine adenocarcinoma','GENE
  -THERAPY CELL-LINE IN-VITRO INTERCELLULAR
  COMMUNICATION BETA-GALACTOSIDASE CANCER
  EXPRESSION APOPTOSIS DEATH GANCICLOVIR','We
  have developed multicellular spheroids (MCS)
  established from LM05e and LM3 spontaneous
  Balb/c-murine mammary adenocarcinoma and B16
  C57-murine melanoma derived cell lines as an in
  vitro model to study the efficacy of the herpes
  simplex virus thymidine kinase/ganciclovir
  (HSVtk/GCV) suicide system. We demonstrated for
  the first time that HSVtk-expressing cells
  assembled as MCS manifested a GCV resistance
  phenotype compared to the same cells grown as
  sparse monolayers. HSVtk-expressing LM05e, LM3
  and B16 spheroids were 16-, three- and nine-fold
  less sensitive to GCV than their respective
  monolayers, even though they could express
  transgenes 10-, eight- and five-fold more
  efficiently. Mixed populations of HSVtk- and
  their respective betagal-expressing cells
  displayed a cell-type specific bystander effect
  that was higher in monolayers than in MCS.
  However, HSVtk-expressing cells in two- or three-
  dimensional cultures were always significantly
  more sensitive to GCV than the betagal-expressing
  counterparts, supporting the feasibility of this
  suicide approach in vivo. We present evidence
  showing that HSVtk-expressing tumor cells, when
  transferred from monolayers to MCS, displayed
  (i) lower GCV cytotoxic activity and bystander
  effect (ii) higher and efficient expression of
  genes transferred as lipoplexes (iii) lower cell
  proliferation rates and (iv) changes in
  intracellular Bax/Bcl-xL rheostat of
  mitochondria-mediated apoptosis.','Univ Buenos
  Aires, Inst Oncol Dr AH Roffo, Unidad
  Transferencia Genet, RA-1407 Buenos Aires, DF,
  Argentina','Finocchiaro, LME, Univ Buenos Aires,
  Inst Oncol Dr AH Roffo, Unidad Transferencia
  Genet, Av San Martin 5481, RA-1407 Buenos Aires,
  DF, Argentina','gglikin_at_bg.fcen.uba.ar','AGHI M,
  2000, J GENE MED, V2, P148 ANDRADEROZENTAL AF,
  2000, BRAIN RES REV, V32, P308 BALLANGRUD AM,
  1999, CLIN CANCER RES S, V5, S3171 BELTINGER C,
  2000, CANCER RES, V60, P3212 BI WL, 1993, HUM
  GENE THER, V4, P725 BRADFORD MM, 1976, ANAL
  BIOCHEM, V72, P248 CIRENEI N, 1998, GENE THER,
  V5, P1221 CRAPERI D, 1999, HUM GENE THER, V10,
  P679 DOLBEARE F, 1988, CYTOMETRY, V9, P631
  ELION GB, 1977, P NATL ACAD SCI USA, V74, P5716
  ELION GB, 1980, ADV ENZYME REGUL, V18, P53
  FELGNER JH, 1994, J BIOL CHEM, V269, P2550
  FINOCCHIARO LME, 1998, J PINEAL RES, V24, P22
  FRANKEL A, 1997, CANCER RES, V57, P2388 FREEMAN
  SM, 1993, CANCER RES, V53, P5274 GHISO JAA,
  1997, INT J CANCER, V71, P881 HERDENER M, 2000,
  FREE RADICAL BIO MED, V29, P1260 HULSER DF,
  1992, SPHEROID CULTURE CAN, P172 JACOBSON MD,
  1995, NATURE, V374, P814 KARARA AL, 2001, CANCER
  GENE THER, V8, P96 KING TJ, 2000,
  CARCINOGENESIS, V21, P1097 KLUNDER I, 1993, EXP
  CELL RES, V207, P155 KNUECHEL R, 1996, AM J
  PATHOL, V149, P1321 KOBAYASHI H, 1993, P NATL
  ACAD SCI USA, V90, P3294 KOLCHINSKY A, 1997,
  ANTICANCER RES, V17, P3321 LUO CM, 1997, EXP
  CELL RES, V234, P225 MACGREGOR GR, 1989, NUCLEIC
  ACIDS RES, V17, P2365 MOOLTEN FL, 1986, CANCER
  RES, V46, P5276 MUELLERKLIESER W, 1997, AM J
  PHYSIOL-CELL PH, V273, C1109 NAMBA H, 2001,
  CANCER GENE THER, V8, P414 NICULESCUDUVAZ I,
  1999, CURR OPIN MOL THER, V1, P480 POPE IM,
  1997, EUR J CANCER, V33, P1005 SANTINI MT, 1999,
  PATHOBIOLOGY, V67, P148 SUTHERLAND RM, 1988,
  SCIENCE, V240, P177 TEIFEL M, 1995,
  BIOTECHNIQUES, V19, P79 TOMICIC MT, 2002,
  ONCOGENE, V21, P2141 TOURAINE RL, 1998, GENE
  THER, V5, P1705 URTREGER AJ, 2001, INT J ONCOL,
  V18, P639 WYGODA MR, 1997, CANCER RES, V57,
  P1699 YANG L, 1998, HUM GENE THER, V9,
  P719','40',1,'NATURE PUBLISHING
  GROUP','LONDON','MACMILLAN BUILDING, 4 CRINAN ST,
  LONDON N1 9XW, ENGLAND','0929-1903','CANCER GENE
  THERAPY','Cancer Gene Ther.','MAY','2004','11','5'
  ,'','','','333','345','','13','MEDICINE, RESEARCH
  EXPERIMENTAL BIOTECHNOLOGY APPLIED
  MICROBIOLOGY GENETICS HEREDITY
  ONCOLOGY','815FA','ISI000221027000004'),('2004','
  J','Corach, G Pacheco, M Stojanoff,
  D','','Geometry of epimorphisms and
  frames','PROCEEDINGS OF THE AMERICAN MATHEMATICAL
  SOCIETY','','English','Article','fibre bundle
  frame epimorphisms Bessel sequence Riesz
  sequence','RIESZ BASES OPERATORS EXPANSIONS
  SPACES','Using a bijection between the set B-H of
  all Bessel sequences in a (separable) Hilbert
  space H and the space L(l(2), H) of all (bounded
  linear) operators from l(2) to H, we endow the
  set F of all frames in H with a natural topology
  for which we determine the connected components
  of F. We show that each component is a
  homogeneous space of the group GL(l(2)) of
  invertible operators of l(2). This geometrical
  result shows that every smooth curve in F can be
  lifted to a curve in GL(l(2)) given a smooth
  curve gamma in F such that gamma(0) Xi, there
  exists a smooth curve Gamma in GL(l(2)) such that
  gamma Gamma.Xi, where the dot indicates the
  action of GL(l(2)) over F. We also present a
  similar study of the set of Riesz
  sequences.','UBA, Dept Matemat, Fac Ingn, RA-1063
  Buenos Aires, DF, Argentina UNPSJB, Fac Ingn,
  Dept Matemat, RA-9000 C Rivadavia, Argentina
  Natl Univ La Plata, Fac Ciencias Exactas, Dept
  Matemat, RA-1900 La Plata, Argentina','Corach, G,
  UBA, Dept Matemat, Fac Ingn, RA-1063 Buenos
  Aires, DF, Argentina','gcorach_at_fi.uba.ar
  mep_at_unpata.edu.ar demetrio_at_mate.unlp.edu.ar','ALD
  ROUBI A, 1995, P AM MATH SOC, V123, P1661 BALAN
  R, 1999, P AM MATH SOC, V127, P2353 BALAN R,
  2003, ADV COMPUT MATH, V18, P93 CASAZZA PG,
  2000, TAIWAN J MATH, V4, P129 CHRISTENSEN O,
  2001, B AM MATH SOC, V38, P273 CORACH G, ORBITS
  POSITIVE OPER CORACH G, 1990, INTEGR EQUAT OPER
  TH, V13, P771 CORACH G, 1999, POSITIVITY, V3, P29

9
HerramientasRecuperación de información

• Las herramientas de recuperación de información
  buscan dar con precisión en documentos
  específicos. Es el problema de buscar una aguja
  en un pajar.
• Se combinan criterios en diferentes campos de la
  base. Los resultados dependen de la calidad de la
  definición de los conceptos a buscar y de la
  habilidad del usuario para armar una consulta
  precisa.
• Actualmente, al igual que Google revolucionó el
  uso de la Web, Scholar Google está ofreciendo
  nuevas posibilidades, abiertas al público
  general, en la exploración del laberinto de las
  publicaciones académicas en Internet.

10
HerramientasAnálisis de datos

• Se obtiene información, de carácter más general,
  a partir de un volumen de información tal que
  sería imposible hacer la tarea manualmente. La
  información sale del todo y no de las partes.
• Se trata de hacer un mapa de un terreno
  desconocido, no sabiendo de antemano qué se va a
  buscar.
• Mediante la utilización de herramientas como la
  minería de datos es posible explorar campos del
  conocimiento, analizar tendencias, dinámicas,
  detectar la emergencia de nuevos temas y sistemas
  de relaciones.

11
Indicadores Bibliométricos

• Son datos estadísticos deducidos de las distintas
  características de las publicaciones científicas.
• Representan una aproximación a una evaluación
  cuantitativa del producto de la investigación
  académica.
• Proporcionan información cuantitativa y objetiva
  sobre los progresos del conocimiento.

12
Producción argentina en SCI
13
Colaboración argentina según país
14
Producción latinoamericana en SCI
15
Producción argentina en SCI - 2006
16
Información atributiva eInformación relacional

• Los indicadores bibliométricos, como la mayor
  parte de los datos estadísticos, están basados en
  información atributiva.
• No se toman en cuenta las relaciones entre las
  unidades que se busca observar.
• Ese enfoque puede obtenerse a través del análisis
  de redes.

17
Red de nanotecnología(2006)
gt 10 publicaciones
18
Disciplinas a partir de la cocitación(Argentina
- 2006)
19
Nanotecnología en Argentina(2000)
20
Nanotecnología en Argentina(2006)
21
Minado de Texto

• El minado de texto (text mining) es una colección
  de técnicas de análisis que buscan extraer
  información útil o novedosa a través de la
  identificación y exploración de patrones de
  interés sobre una colección de documentos.
• En el caso del minado de texto, estos patrones no
  se encuentran estructurados en registros de bases
  de datos sino que deben ser extraídos de los
  documentos utilizando procesamiento de lenguaje
  natural.

22
Mapa conceptualCancer
23
Mapa cluster
24
Diferentes usos de la información

• Investigación y toma de decisiones
• Estado del arte en una materia
• Identificación de temas específicos para líneas
  de investigación (a diferentes niveles de
  detalle)
• Identificación de grupos especializados y
  expertos
• En conclusión
• Se trata de la aparición y enriquecimiento de
  grandes recursos de información.
• El desafío es desarrollar capacidades para
  procesarla e interpretarla.

25
Muchas gracias. www.caicyt.gov.ar