CLASSIFICATION DES ORGANISMES

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CLASSIFICATION DES ORGANISMES

• 1760 Linné 2 règnes animaux
  Protozoaires Métazoaires
• végétaux Plantes Algues
  Champignons
• 1866 Haeckel 3 règnes animaux
  Métazoaires
• végétaux Plantes Algues
  Champignons
• protistes Protozoaires Bactéries
  Myxomycètes
• 1969 Wittaker 5 règnes monomères
  (bactéries)
• protistes (unicellulaires)
• champignons
• végétaux
• animaux

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MYCOLOGIE dHIER et dAUJOURDHUIHISTORIQUE (1)

• Antiquité rôle maléfique
• Epoque romaine intérêt culinaire
• XVIème siècle début de la mycologie
  microscopique
• 1730 Micheli étude des microorganites
  (spores)
• XIXè siècle début de la mycologie moderne
  travaux de La Fries, de Corda, Saccardo
• 1850 du Barry dénombre 900 espèces

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MYCOLOGIE dHIER et dAUJOURDHUIHISTORIQUE (2)

• 1900 Sabouraud milieu de culture
• 1910 Villemin étude des différentes spores
  fongiques
• Milieu XXè siècle Masson et Hugues
  classification des champignons sur la base des
  formes de spores
• 1970 Baron, Ellis Classification sur mode de
  formation des spores
• 1983 Ainswork er Bisbys dictionnary of the
  fungi
• Dernière décennie ultrastructure, biologie
  moléculaire, contribuent à la taxonomie

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FACTEURS FAVORISANTS

• ? Avancées médico-chirurgicales
• - antibiotiques
• - corticoïdes
• - immunosuppresseurs
• - greffe,
• ? Prolongement de la vie
• ? Essor du SIDA
• ? une multiplication des mycoses

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INFECTIONS FONGIQUES NOSOCOMIALES

• 1980 à 1990 2 à 4 des hospitalisés
• ? candidoses 78,3 de ces infections
• ? 59,7 C. albicans
• ? 18,6 autres espèces de Candida
• ? Aspergilloses 1,3
• Beck-Sague et Jarvis (NNISS).
• J. Inf.Dis., 1993,167, 1247-1251

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CHAMPIGNONS LEVURIFORMES

• Genres - Candida
• - Cryptococcus
• - Malassezia
• - Trichosporon
• - Rhodotorula
• -Saccharomyces

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FACTEURS FAVORISANTS DES MYCOSES (1)

• Locaux rupture de la barrière cutanéo-muqueuse
• Macération
• Cathéter-sonde
• Traumatisme
• Brûlure
• Radiothérapie
• Toxicomanie par voire IV
• Interventions chirurgicales (digestive,
  cardiaque)
• Cavité préformée
• - Physiologiques
• - Nouveau-né et surtout prématuré
• - Vieillard
• - Grossesse
• - Oestroprogestatif
• - Endocrinien
• - Diabète

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FACTEURS FAVORISANTS DES MYCOSES (2)

• - Déficits immunitaires
• - acquis
• SIDA
• - iatrogènes
• Chimiothérapie aplasiante,
• greffes dorganes et de moelle osseuse
• - Thérapeutique
• Antibiothérapie
• Corticothérapie
• Traitement immunosuppresseur

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RESERVOIRS DE CHAMPIGNONS

• - Sol (champignons géophiles)
• - Animaux (champignons zoophiles)
• - Homme (champignons anthropophiles)

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EPIDEMIOLOGIE DES MYCOSES Sources de
contamination

• Homme environnement
• - inoculation par écharde (sporotrichose,
  chromomycose, maduromycose, )
• - inhalation des poussières (histoplasmose,
  coccidioïdomycose, cryptococcose, aspergillose,
  )
• Contact inter-humain
• - candidose (mère-enfant, MST)
• - teignes scolaires
• Homme-animal
• - dermatophyties

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ROLE DU BIOLOGISTE

• Prélever ou sassurer de la bonne qualité du
  prélèvement
• Identifier avec précision et rapidité lagent
  fongique en cause
• Orienter le choix thérapeutique du clinicien
• Suivre lévolution de linfection ou le contrôle
  du traitement
• Rechercher lorigine dune épidémie fongique
  nosocomiale

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PRELEVEMENTS COMMENT ?Récipients stériles et
acheminement rapide au laboratoire

• Mycoses superficielles
• - pityriasis versicolor cellophane adhésive
• - lésion suintante écouvillon
• - lésion ulcérée ou nécrotique écouvillon ou
  biopsie
• - lésion squameuse sèche en périphérie de la
  lésion
• - ongle à la limite ongle malade (ongle sain)
• - cheveux à la pince à épiler, au centre de
  la lésion
• Mycoses profondes
• - liquides LCR, sang, urines, ascites,
• - biopsies dorganes

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ARGUMENTS EN FAVEUR DE LA RESPONSABILITE DUN
CHAMPIGNON OPPORTUNISTE DANS UNE LESION

• Facteurs favorisants
• - locaux
• - généraux
• Examen direct positif (ou histologie positive)
• Une seule espèce de champignon est isolée (sur
  plusieurs points densemencement)
• La répétition des prélèvements montre toujours le
  même champignon à lisolement.

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OUTILS USUELS DE DIAGNOSTIC

• Mise en évidence du champignon dans les lésions
• ? examen direct
• ? histologie
• Isolement du champignon
• ? culture
• ? inoculation à lanimal
• Identification du champignon
• ? critères macroscopiques
• ? critères microscopiques
• ? critères physiologiques
• Réactions sérologiques
• ? anticorps circulants
• ? antigènes circulants

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OUTILS DE DIAGNOSTIC

• Techniques phénotypiques
• - Sérotypage
• - Biotypage
• - Morphotypage
• - Résistotypage
• - Système des toxines killer
• - Antifongigramme

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OUTILS DE DIAGNOSTIC

• Marqueurs moléculaires et génétiques
• Immuno empreinte
• Electrophorèse en gel de polyacrylamide (PAGE)
• Electrophorèse en gel des isoenzymes
• Caryotypage électrophorétique (champ pulsé)
• Analyse de lADN génomique (RFLP, RAPD, )

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ANTIFONGIQUES (1)

• 1903 iodure de potassium
• 1950 polyènes
• 1950 nystatine
• 1955 amphotéricine B
• 1958 griséofulvine
• 1963 5-fluorocytosine
• 1969 imidazolés
• 1969 clotrimazole
• 1969 miconazole
• 1969 éconazole
• 1977 kétoconazole

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ANTIFONGIQUES (2)

• 1985 triazolés
• 1987 fluconazole
• 1990 allylamine terbinafine
• 1990 morpholine amorolfine
• 1990 vecteurs lipidiques et ampho B
• 1993 itraconazole

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ANTIFONGIQUES A LETUDE

• Triazolés
• Saperconazole
• Altéconazole
• Ravuconazole BMS 207 147
• Voriconazole (Vefend)
• Posaconazole SCH 56 592
• Peptides et lipopeptides
• Nikkomycines
• Echinocandines
• Ly 303 366
• MK 0991 Caspofungine
• Sordarines
• Vecteurs lipidiques et polyènes
• Cochléate damphotéricine B
• Nystatine lipidique

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CONCLUSION (1)

• Protocole thérapeutique
• ? Guérison ou prolongement de la vie
• ? Augmentation des infections opportunistes
• ? Extension du spectre clinique
• ? Emergence de nouvelles espèces

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CONCLUSION (2)

• Espoirs
• Diagnostic plus précoce
• ? Sérologie (Ag circulants)
• ? Biologie moléculaire
• Adaptation des thérapeutiques antifongiques
  guidée par antifongigramme, CMI, dosage sérique
• Nouveaux antifongiques
• ? Triazolés
• ? Allylamine
• ? Vecteur lipidique

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CONCLUSION (3)

• Mesures préventives
• - Locaux
• ? Utilisation dun flux laminaire
• ? Maintenance des circuits de climatisation
• ? Traitement antifongique des peintures, faux
  plafonds
• - Malades
• ? Décontamination fongique digestive
  systématique
• ? Surveillance de la nourriture (épices, fruits,
  )
• ? Ablation des cathéters le plus vite possible
• ? Education sanitaire (fleurs, plantes,)

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CONCLUSION

• Une excellente coopération entre cliniciens et
  biologistes est le meilleur atout pour prévenir,
  diagnostiquer et traiter une affection fongique.

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